Ced-12 - Ced-12

Hujayra o'limining anormalligi geni 12
Identifikatorlar
OrganizmCaenorhabditis elegans
BelgilarCED-12
Entrez172890
HomoloGene56685
RefSeq (mRNA)NM_060292.7
RefSeq (Prot)NP_492693.1
UniProtQ8STE5
Boshqa ma'lumotlar
XromosomaI: 10.22 - 10.23 Mb
Apoptotik fagotsitoz jarayoni tasvirlangan multfilm chizmasi. Apoptotik hujayra signallarni chiqaradi, ular qo'shni hujayra tomonidan tan olinadi. Signalni taniy oladigan hujayra CED-12 ni faollashtiradigan uchlamchi tuzilmani tashkil etadigan CED-12 (ochiq ko'k yarim oyda tasvirlangan), CED-2 va CED-5 ni faollashtiradi. CED-10 aktin sitoskeletini qayta tuzilishini faollashtiradi, bu esa o'layotgan hujayraning fagotsitozini keltirib chiqaradi.

CED-12 (Cell D.eath Anormal protein Protein-12) sitoplazmatik, PH-domenni o'z ichiga oladi adapter oqsili ichida topilgan Caenorhabditis elegans va Drosophila melanogaster. CED-12 - bu homolog ELMO oqsili sutemizuvchilarda uchraydi. Ushbu protein ishtirok etadi Rac-GTPase faollashtirish, apoptotik hujayra fagotsitozi, hujayra migratsiyasi va sitoskeletal qayta tashkil etish.[1][2]

Kashfiyot

CED-12 kashfiyoti yordamida amalga oshirildi nokaut tajribalari.[1] Uning apoptotik fagotsitoz yo'lidagi ishtiroki birinchi marta nokaut qilinganida qayd etilgan ced-12 yilda C. elegans apoptotik jarayonda shunga o'xshash natijalarni ko'rsatdi ced-5 va ced-2 nokautlar.[3]Bu tadqiqotchilarni oqsil mahsulotlariga ishonishiga va keyinchalik tasdiqlashiga olib keladi ced-12 (CED-12), ced-5 (CED-5) va ced-2 (CED-2) barchasi bir xil yo'lning bir qismi sifatida ishladi.[3][4]

Tadqiqotchilar, shuningdek, CED-12 va CED-10 (C. elegans uchun gomolog Rac1 ), Rac-GTPase (boshqa funktsiyalar qatorida sitoskelet tizimini qayta tiklash uchun ishlatiladigan energiyaga bog'liq protein).[5][6] CED-12 nokaut qilinganida CED-10 harakatsiz edi. CED-12 ning CED-5 va CED-2 faollashtirilgan CED-10 bilan ifodalanishi, bu apoptotik fagotsitozning faollashishiga olib keladi.[3]

Funktsiya

CED-12 - bir marta tarjima qilingan adapter oqsili (signalizatsiya komplekslarini shakllantirishga yordam beradigan oqsillar) apoptoz hujayrada tetiklenmiştir. Hujayraning dasturlashtirilgan o'limi deb ham ataladigan apoptoz rivojlanish jarayonida, shuningdek hujayra etarlicha jismoniy zarar ko'rgan holatlarda faollashadi.[7][8] Hujayra tarkibidagi ko'p narsalar hujayradan tashqaridagi muhit bilan reaktiv bo'lib, atrofdagi to'qimalarga zarar etkazmasdan yo'q qilinishi kerak. Apoptotik hujayralar tashqi muhitdan apoptotik hujayra membranasida joylashgan hujayra-sirt belgilarini tanigan qo'shni hujayralar tomonidan olib tashlanadi. Markerni tanib olish apoptotik hujayralarni fagotsitoz bilan yutilishiga olib keladi.[8] Molekulyar darajada hujayra sirtidagi markerlarni tanib olish, o'ralgan hujayraning sitoplazmasidagi CED-12 oqsilining tarjimasiga olib keladi va keyinchalik hujayra membranasiga joylashadi. CED-12 CED-2 bilan bog'lanadi (C. elegans sut emizuvchilarda CrkII ga homolog), so'ngra CED-5 (C. elegans uchun gomolog DOCK180 sutemizuvchilarda) va a hosil qiladi uchlamchi tuzilish.[5][9] Transmembranli CED-1 - o'ralgan hujayradagi hujayra yuzasi retseptorlari misoli. Retseptorlar apoptotik hujayradagi hujayra yuzasi markerlari bilan aloqa qilganda, CED-6 (sutemizuvchilar uchun GULP uchun homolog) deb nomlanuvchi oqsil ifoda etiladi.[2][10] Ikkala CED-2 / CED-5 / CED-12 uchlamchi tuzilishi va CED-6 funktsiyasi uni faollashtirish uchun effektor oqsili CED-10 sifatida tanilgan. CED-10 to'g'ridan-to'g'ri qayta tashkil etilishi uchun javobgar bo'lgan RAC-GTPaza oqsilidir aktin fagotsitozni boshlaydigan sitoskelet.[5][6] Ushbu jarayon ikkita yo'l bilan tartibga solinadi. Birinchisi, CED-6 tomonidan amalga oshiriladi, bu CED-10 va protein o'rtasidagi o'zaro ta'sirlarni muvofiqlashtirish uchun mas'ul bo'lgan adapter oqsilidir. aktin.[11] Ikkinchi yo'l CED-2 / CED-5 / CED-12 uchlik tuzilishi a shakllanganda sodir bo'ladi GEF (guanin nukleotid almashinish koeffitsienti) bilan CTP-10, bu GTP ga bog'liq bo'lgan CED-10 ni faollashtirish uchun GTP energiya molekulasining bog'lanishiga yordam beradi.[2][5][10][11]

CED-12, shuningdek, apoptotik fagotsitoz yo'li bilan bir xil ta'sir o'tkazish bilan tartibga solinadigan hujayra migratsiyasi jarayonlarida ham ishlaydi. Gonad rivojlanishida distal uchli hujayralar migratsiyasida ishlaydi C. elegans.[12] Distal uchi hujayralari somatik hujayralar rivojlanayotgan gonadal qo'llarning uchida joylashgan bo'lib, gonadal qo'lni cho'zish uchun javobgardir, shuningdek, rivojlanish va kattalar davrida gonadal hujayralarning mitoz va meiotik hujayralari bo'linishini boshqaradi.[13] Sifatida C. elegans rivojlanadi, distal hujayralar gonadaning shakli va hajmini belgilaydigan morfologik o'zgarishlarni yakunlash uchun bir qator migratsiyaga uchraydi.[12] Ushbu jarayon qachon sodir bo'ladi integrallar distal uchi hujayralari yuzasida joylashgan ximotraktorlarni uchratadi hujayradan tashqari matritsa.[12][13] Integrinlar hosil bo'ladi fokal yopishqoqlik CEM-5 ning yopishish nuqtalariga lokalizatsiyasini keltirib chiqaradigan chemoattractants saytlarida.[12] CED-12 va CED-2 aktin sitoskeletini qayta o'rnashtirish va distal uchi hujayralarining oldinga tarqalishini ta'minlash uchun CED-5 bilan GEF-triosini hosil qiladi va CED-10 Rac-GTPase-ni faollashtiradi.[12][14]

Gen va oqsil tuzilishi

(A) DOCK2 (sutemizuvchilar homologi CED-5 ga) va ELMO1 (CED-12 uchun sutemizuvchilar homologi) uchun protein domenlarining soddalashtirilgan grafik tasviri. DOCK2 / CED-5-da ELMO1 / CED-12 bilan bog'langan SH3-domeni ko'k to'rtburchak sifatida ko'rsatilgan. ELMO1-da PH tomonidan ko'rsatilgan Proline-Rich mintaqalari ochiq-ko'k rangda. Bular ELMO1 / CED-12 va DOCK2 / CED-5 komplekslarni hosil qilishda o'zaro ta'sir qiladigan hududlarni ko'rsatadi. (B) DOCK2 / CED-5 va ELMO1 / CED-12 orasidagi heterodimer strukturaning kristalli 3D-tasviri. O'ng tomonda xuddi shu kristalli struktura 90 ° ga burilgan. KO'RSATILMAYDI: CrkII / CED-2 uchlamchi tuzilishda DOCK2 / CED-5 va ELMO1 / CED-12 bilan

The ced-12 uzunligi 731 aminokislotani o'z ichiga olgan 82kDa katta oqsil uchun gen kodlari.[2] U L qo'lidagi 2-xromosomada uchraydi Drosophilava xromosomada men bor C. elegans.[1]CED-12 ning oqsil tuzilishi uning majburiy domenlari asosida ajratiladi:

  • CED-12-dagi prolinlarga boy mintaqa CED-5 / DOCK180-da C-terminal SH3-ulanish domeni uchun bog'lanish joyidir.[15] Prolinga boy mintaqada aminokislotaning yuqori konsentratsiyasi mavjud Proline, va aminokislota qoldiqlari orasida yotadi 711-724.[2] Ushbu domen sitoskeletni qayta qurish jarayonida hal qiluvchi ahamiyatga ega va prolin va o'zboshimchalik bilan alifatik (qutbsiz aminokislotalar ochiq alkan qoldiqlar.[2] Ketma-ketlikning saqlanib qolgan namunasi SH3-domeni bilan gidrofobik va tuz-ko'prikning o'zaro ta'sirini ta'minlaydi.[15]
  • N-terminalda takrorlanadigan Armadillo (ARM) mintaqasi CED-5 / DOCK180 bilan heterodimerizatsiyani faollashtirish uchun zarur bo'lgan CED-2 / CrkII ni bog'laydi.[11]
  • The Pleckstrin Homology domeni uzunligi 100-200 aminokislotalarni o'z ichiga oladi.[2][11][16] U yaqin joylashgan C-terminali va CED-5 va CED-2 bilan Guanine nukleotid almashinuvi faktori hosil bo'lgandan keyin Rac-GTPase bilan bog'lanish zarur. Bu faollashadi sitoskeletal qayta qurish.[11]

O'zaro aloqalar

CED-12 quyidagilar bilan o'zaro ta'sir ko'rsatdi:[2][5][11]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v Brodi T. "Ced-12". Interaktiv uchish. Olingan 11-noyabr, 2015.
  2. ^ a b v d e f g h Zhou Z, Caron E, Hartwieg, Hall A, Horvitz HR (oktyabr 2001). "C. elegans PH domen oqsili CED-12 Rho / Rac GTPase signalizatsiya yo'li orqali sitoskeletning qayta tashkil etilishini tartibga soladi". Rivojlanish hujayrasi. 1 (4): 477–89. doi:10.1016 / s1534-5807 (01) 00058-2. PMID  11703939.
  3. ^ a b v Pasqualini R, Arap V (2009). Proteinlarni kashf qilish texnologiyalari. CRC Press. p. 175. ISBN  978-1420014211.
  4. ^ Chung S, Gumienny TL, Hengartner MO, Driscoll M (dekabr 2000). "Yutish genlarining umumiy to'plami C. elegansdagi apoptotik va nekrotik hujayra jasadlarini olib tashlashda vositachilik qiladi". Tabiat hujayralari biologiyasi. 2 (12): 931–7. doi:10.1038/35046585. PMID  11146658. S2CID  743063.
  5. ^ a b v d e Lettre G, Xengartner MO (2006 yil fevral). "C. elegans-da rivojlanish apoptozisi: murakkab CEDnario". Tabiat sharhlari. Molekulyar hujayra biologiyasi. 7 (2): 97–108. doi:10.1038 / nrm1836. PMID  16493416. S2CID  15323587.
  6. ^ a b Raftopoulou M, zal A (2004 yil yanvar). "Uyali migratsiya: Rho GTPazlari etakchi o'rinni egallaydi". Rivojlanish biologiyasi. 265 (1): 23–32. doi:10.1016 / j.ydbio.2003.06.003. PMID  14697350.
  7. ^ "Dasturlashtirilgan hujayralar o'limi". www.ncbi.nlm.nih.gov. 2005-10-06. Olingan 2015-12-02.
  8. ^ a b Elmore S (2007 yil iyun). "Apoptoz: dasturlashtirilgan hujayralar o'limini ko'rib chiqish". Toksikologik patologiya. 35 (4): 495–516. doi:10.1080/01926230701320337. PMC  2117903. PMID  17562483.
  9. ^ Vang X, Vu YC, Fadok VA, Li MC, Gengyo-Ando K, Cheng LC va boshq. (2003 yil noyabr). "CED-5 va CED-12 orqali C. elegans phosphatidylserine retseptorlari vositasida hujayra murdasini yutish". Ilm-fan. 302 (5650): 1563–6. Bibcode:2003 yilgi ... 302.1563W. doi:10.1126 / science.1087641. PMID  14645848. S2CID  25672278.
  10. ^ a b Kinchen JM, Cabello J, Klingele D, Vong K, Feichtinger R, Schnabel H va boshq. (2005 yil mart). "Ikkita yo'l CED-10da birlashib, C. elegans-da aktinni qayta tashkil etish va murdani olib tashlash vositachiligida". Tabiat. 434 (7029): 93–9. Bibcode:2005 yil Tabiat. 434 ... 93K. doi:10.1038 / nature03263. PMID  15744306. S2CID  13399557.
  11. ^ a b v d e f Ravichandran KS, Lorenz U (dekabr 2007). "Apoptotik hujayralarni yutish: yaxshi ovqat uchun signallar". Tabiat sharhlari. Immunologiya. 7 (12): 964–74. doi:10.1038 / nri2214. PMID  18037898. S2CID  10670430.
  12. ^ a b v d e Vong MC, Shvartsbauer JE (2012). "Gonorhabditis elegans hermaphrodite-da Gonad morfogenezi va distal uchi hujayralari migratsiyasi". Wiley fanlararo sharhlari. Rivojlanish biologiyasi. 1 (4): 519–31. doi:10.1002 / wdev.45. PMC  3614366. PMID  23559979.
  13. ^ a b "Reproduktiv tizim: Somatik Gonad".
  14. ^ Conradt B (2001 yil oktyabr). "Hujayralarni yutib yuborish, tezda bajarilganidan keyin". Rivojlanish hujayrasi. 1 (4): 445–7. doi:10.1016 / s1534-5807 (01) 00065-x. PMID  11703934.
  15. ^ a b Veng Z, Riklz RJ, Feng S, Richard S, Shou AS, Shrayber SL, Brugge JS (1995 yil oktyabr). "SH3 domenlarining struktura-funktsional tahlili: bitta aminokislota almashtirishlari bilan o'zgartirilgan SH3 majburiyligi". Molekulyar va uyali biologiya. 15 (10): 5627–34. doi:10.1128 / mcb.15.10.5627. PMC  230813. PMID  7565714.
  16. ^ Gumienny TL, Brugnera E, Tosello-Trampont AC, Kinchen JM, Haney LB, Nishiwaki K va boshq. (Oktyabr 2001). "Cag-12 / ELMO, CrkII / Dock180 / Rac yo'lining yangi a'zosi, fagotsitoz va hujayralar migratsiyasi uchun talab qilinadi" (PDF). Hujayra. 107 (1): 27–41. doi:10.1016 / s0092-8674 (01) 00520-7. PMID  11595183. S2CID  15232864.