Artropod defensin - Arthropod defensin

Artropod defensin
PDB 1ica EBI.jpg
Defektin A hasharotlarining tuzilishi.[1]
Identifikatorlar
BelgilarDefensin_2
PfamPF01097
InterProIPR001542
PROSITEPDOC00356
SCOP21ica / QOIDA / SUPFAM
TCDB1.C.47
OPM superfamily58
OPM oqsili1l4v

Artropod defensinlari mollyuskalar, hasharotlar va araxnidlar oilasi sistein - boy antibakterial peptidlar, birinchi navbatda qarshi Gram-musbat bakteriyalar va in vitro qo'ziqorinlar.[2][3][4][5][6] Ammo Drosophila Fly defensin uchun mutant bo'lgan mevali chivinlar grammusbat bakteriyalar tomonidan yuqtirishga ko'proq moyil edi Providencia burhodogranariea va yovvoyi pashshalar singari grammusbat bakteriyalarga qarshi infektsiyaga qarshi turdi.[7] In vitro faollik in vivo jonli funktsiya bilan qanday bog'liqligini ko'rish kerak. Defensinga o'xshash mikroblarga qarshi peptid uchun mutantlar Drosomitsin qo'ziqorinlarga qarshi ko'proq sezgir bo'lib, qo'ziqorinlarga qarshi mudofaada defensinga o'xshash peptidlarning rolini tasdiqlaydi.[7]

Tuzilishi

Artropod defensin peptidlari uzunligi 38 dan 51 gacha aminokislotalarga etadi. Ichki disulfid birikmalariga aloqador oltita konservalangan sistein mavjud. Tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, sistein-ko'prik disulfid bog'lari antimikrobiyal faollik uchun zarur emas.[8] Shuningdek, sutemizuvchilarning defensinlari antimikrobiyal faollikni namoyish etish uchun disulfid birikmalarini talab qilmaydi.[9] Bundan tashqari, artropod yoki hasharotlar defensinlaridagi N-terminal spiral mintaqasi ham ushbu peptidlarning mikroblarga qarshi faolligi uchun zarur emasligi ko'rsatildi.[8]

Artropoddan peptidlarning sxematik tasviri defensin oila quyida ko'rsatilgan.

           + ---------------------------- + | | xxCxxxxxxxxxxxxxxCxxxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx | | | | + --- | --------------- + | + ----------------- +

'S': disulfid birikmasiga aloqador konservalangan sistein.

Boshqa defensinlarga aloqasi

Artropod defensinlari va sutemizuvchilarning defensinlari o'rtasida ketma-ketlik o'xshashliklari qayd etilgan.[10][2] Ammo umurtqali hayvonlar, artropodlar, o'simliklar va zamburug'larning defensinlari mustaqil ravishda paydo bo'lgan ko'rinadi.[11] Buni artropod defensinlari va umurtqali hayvonlarning 3D strukturaviy farqlari qo'llab-quvvatlaydi beta defensinlar.[12] Shu bilan birga, ushbu defensinlar o'rtasida tizimli o'xshashliklar mavjud, xususan "C6" va "C8" deb nomlangan ikkita strukturaviy motiflarda. Bu defensin o'xshashliklarini aniqlash uchun umumiy motivlarning strukturaviy munosabatlari qo'llaniladigan "cis-" yoki "tras-" defensinlarni tasniflash tizimining kuchayishiga olib keldi.[11]

Mikrob bo'lmagan hujayralarga qarshi faollik

Sutemizuvchilarning defensinlari in vitro saratonga qarshi ta'sir ko'rsatadi,[13] va inson beta-defensin 1 ning past regulyatsiyasi yuqori xavf bilan bog'liq prostata saratoni va aniq hujayralardagi karsinomalar.[14] Defensin uchun birinchi in vivo jonli saratonga qarshi funktsiyalar paydo bo'ldi Drosophila ekanligini ko'rsatadigan tadqiqotlar Drosophila defensin o'simta hujayralariga hujum qiladi va defensin etishmayotgan chivinlar saraton kasalligi modelida o'smaning o'sishi ko'proq bo'lgan.[15][16]

Haddan tashqari faol immunitet signalizatsiyasi, shuningdek, yoshga bog'liq neyrodejeneratsiyada,[17] va defensinning haddan tashqari namoyon bo'lishi miya to'qimalarining degradatsiyasini kuchayishiga olib keladi.[18]

Izohlar

  1. ^ Cornet B, Bonmatin JM, Hetru C, Hoffmann JA, Ptak M, Vovelle F (may 1995). "Hasharotlar defensin A ning uch o'lchovli eritma tuzilishi". Tuzilishi. 3 (5): 435–48. doi:10.1016 / S0969-2126 (01) 00177-0. PMID  7663941.
  2. ^ a b Lambert J, Keppi E, Dimarcq JL, Viker S, Reyxart JM, Dunbar B va boshq. (1989 yil yanvar). "Hasharotlarga qarshi immunitet: quyon o'pka makrofagiga bakteritsid peptidlari uchun ketma-ket homologiyasi bo'lgan ikkita hasharotga qarshi antibakterial peptidlarning dipteran Phormia terranovae ning immun qonidan ajratilishi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 86 (1): 262–6. Bibcode:1989 yil PNAS ... 86..262L. doi:10.1073 / pnas.86.1.262. PMC  286444. PMID  2911573.
  3. ^ Fujiwara S, Imai J, Fujiwara M, Yaeshima T, Kawashima T, Kobayashi K (iyul 1990). "Qirollik jeli tarkibidagi kuchli antibakterial oqsil. Royalisinning tozalanishi va birlamchi tuzilishini aniqlash". Biologik kimyo jurnali. 265 (19): 11333–7. PMID  2358464.
  4. ^ Yamada K, Natori S (1993 yil aprel). "Sarcophaga embrion hujayralaridan ikkita yangi sapetsinli gomologlarning tozalanishi, ketma-ketligi va antibakterial faolligi: sapetsin B ning xarybdotoksinga o'xshashligi". Biokimyoviy jurnal. 291 (Pt 1): 275-9. doi:10.1042 / bj2910275. PMC  1132513. PMID  8471044.
  5. ^ Bulet P, Cociancich S, Dimarcq JL, Lambert J, Reyxart JM, Hoffmann D va boshq. (1991 yil dekabr). "Hasharotlarga qarshi immunitet. Yangi qo'zg'atadigan antibakterial peptid va hasharotlar defensin oilasining yangi a'zolarini koleopteran hasharotidan ajratish". Biologik kimyo jurnali. 266 (36): 24520–5. PMID  1761552.
  6. ^ Bulet P, Cociancich S, Reuland M, Sauber F, Bischoff R, Hegy G va boshq. (1992 yil noyabr). "Yangi hasharotlar defensin iynesi Aeschna cyanea (Paleoptera, Odonata) lichinkalarida qo'zg'atadigan antibakterial ta'sirga vositachilik qiladi". Evropa biokimyo jurnali. 209 (3): 977–84. doi:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb17371.x. PMID  1425705.
  7. ^ a b Hanson MA, Dostalova A, Ceroni C, Poidevin M, Kondo S, Lemaitre B (fevral, 2019). "Vivo jonli ravishda antimikrobiyal peptidlarning sinergiyasi va ajoyib o'ziga xos xususiyati sistematik nokaut usulidan foydalangan holda". eLife. 8. doi:10.7554 / eLife.44341. PMC  6398976. PMID  30803481.
  8. ^ a b Varki J, Singx S, Nagaraj R (2006 yil noyabr). "Artropod defensinlarining karboksi-terminal beta-varaq domenini o'z ichiga olgan chiziqli peptidlarning antibakterial faolligi". Peptidlar. 27 (11): 2614–23. doi:10.1016 / j.peptidlar.2006.06.010. PMID  16914230.
  9. ^ Varkey J, Nagaraj R (2005 yil noyabr). "Sisteinlarsiz odam neytrofil defensin HNP-1 analoglarining antibakterial faolligi". Mikroblarga qarshi vositalar va kimyoviy terapiya. 49 (11): 4561–6. doi:10.1128 / AAC.49.11.4561-4566.2005. PMC  1280114. PMID  16251296.
  10. ^ Rosa RD, Santini A, Fievet J, Bulet P, Destoumieux-Garzón D, Bachère E (2011). "Katta defensinlar, turli xil antimikrobiyal peptidlar oilasi, istiridye Crassostrea gigas gemotsitlarida turli xil ekspression shakllariga amal qiladi". PLOS ONE. 6 (9): e25594. Bibcode:2011PLoSO ... 625594R. doi:10.1371 / journal.pone.0025594. PMC  3182236. PMID  21980497.
  11. ^ a b Shafee TM, Lay FT, Xulett MD, Anderson MA (sentyabr 2016). "Defensinlar ikkita mustaqil, konvergent oqsilli superfiliyadan iborat". Molekulyar biologiya va evolyutsiya. 33 (9): 2345–56. doi:10.1093 / molbev / msw106. PMID  27297472.
  12. ^ Hanzava H, Shimada I, Kuzuhara T, Komano H, Kohda D, Inagaki F va boshq. (1990 yil sentyabr). "1H antibakterial oqsil, sapetsin konformatsiyasini yadro magnit-rezonansli o'rganish". FEBS xatlari. 269 (2): 413–20. doi:10.1016/0014-5793(90)81206-4. PMID  2401368.
  13. ^ Deslouches B, Di YP (2017 yil iyul). "Selektiv antitümörlü mexanizmlarga ega mikroblarga qarshi peptidlar: saratonga qarshi dasturlar istiqbollari". Onkotarget. 8 (28): 46635–46651. doi:10.18632 / oncotarget.16743. PMC  5542299. PMID  28422728.
  14. ^ Donald CD, Sun CQ, Lim SD, Macoska J, Koen S, Amin MB, Young AN, Ganz TA, Marshall FF, Petros JA (2003 yil aprel). "Buyrak va prostata karsinomalarida beta-defensin 1 saratoniga xos yo'qotish". Laboratoriya tekshiruvi; Texnik usullar va patologiya jurnali. 83 (4): 501–5. doi:10.1097 / 01.LAB.0000063929.61760.F6. PMID  12695553.
  15. ^ Parvy JP, Yu Y, Dostalova A, Kondo S, Kurjan A, Bulet P, Lemaitre B, Vidal M, Cordero JB (iyul, 2019). "Antimikrobiyal peptid defensin Drozofilada o'simta hujayralari o'limini qo'zg'atish uchun o'sma nekrozi omil bilan hamkorlik qiladi". eLife. 8: e45061. doi:10.7554 / eLife.45061. PMC  6667213. PMID  31358113.
  16. ^ Douson KP, Abbott GD, Allan J (iyun 1983). "Bolalikda o'tkir nafas yo'li infektsiyasi: ota-onalarning retseptlari va maslahat manbalarini o'rganish". Yangi Zelandiya tibbiyot jurnali. 96 (734): 481–2. PMID  6602314.
  17. ^ Kounatidis I, Chtarbanova S, Cao Y, Hayne M, Jayanth D, Ganetzky B, Ligoxygakis P (aprel 2017). "Miyada NF-κB immuniteti sog'lom qarish va yoshga bog'liq neyrodejeneratsiyada uchish umrini belgilaydi". Hujayra hisobotlari. 19 (4): 836–848. doi:10.1016 / j.celrep.2017.04.007. PMC  5413584. PMID  28445733.
  18. ^ Cao Y, Chtarbanova S, Petersen AJ, Ganetski B (may 2013). "Dnr1 mutatsiyalari Drozofilada miyada tug'ma immunitet reaktsiyasini faollashtirish orqali neyrodejeneratsiyani keltirib chiqaradi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 110 (19): E1752-60. Bibcode:2013PNAS..110E1752C. doi:10.1073 / pnas.1306220110. PMC  3651420. PMID  23613578.

Qo'shimcha o'qish

Adabiyotlar