BZIP Maf - BZIP Maf

bZIP_Maf
MafA homodimer.png-ning kristalli tuzilishi
DNK bilan bog'langan MafA homodimerining kristalli tuzilishi. PDB yozuvi 3a5t[1]
Identifikatorlar
BelgilarbZIP_Maf
PfamPF03131
Pfam klanCL0018
InterProIPR004826
SCOP21k1v / QOIDA / SUPFAM

bZIP Maf Mafda joylashgan domen transkripsiya omili oqsillar. Uning tarkibida a leucine fermuar (bZIP) domeni, bu transkriptsiya omilining vositachiligidir dimerizatsiya va DNK majburiy xususiyatlari. Maf kengaytirilgan gomologik mintaqasi (EHR) oqsilning N-uchida mavjud. Ushbu mintaqa (qo'shni tasvirda sariq rangda ko'rsatilgan) faqat Maf oilasida mavjud va oilaga boshqa leytsin fermuarlariga qaraganda uzunroq DNK motiflarini tanib olishga imkon beradi. Ushbu motiflar Mafni tanib olish elementi (MARE) deb nomlanadi va 13 yoki 14 ga teng tayanch juftliklari uzoq. Xususan, ikkalasi qoldiqlar boshida spiral H2 DNKning yonbosh sohasini tanib olish uchun joylashtirilgan.[2] Kichik Maf oqsillar bilan heterodimerizatsiya qilish Fos va raqobatbardosh rol o'ynashi mumkin repressorlar NF2-E2 transkripsiya faktorining.

Sichqonchada Maf1 eksenel naqshlashda dastlabki rol o'ynashi mumkin. Ushbu oqsillarning nuqsonlari sababdir autosomal dominant retinit pigmentozasi. Asabiy retina -spetsifik lösin fermuar oqsillari ushbu oilaga tegishli.

Adabiyotlar

  1. ^ Kurokava, X .; Motoxashi, X .; Sueno, S .; Kimura, M.; Takagava, X .; Kanno, Y .; Yamamoto, M .; Tanaka, T. (2009). "Maf transkripsiyasi omillari bo'yicha alternativ DNKni tanib olishning strukturaviy asoslari". Molekulyar va uyali biologiya. 29 (23): 6232–6244. doi:10.1128 / MCB.00708-09. PMC  2786689. PMID  19797082.
  2. ^ Kusunoki H, Motohashi H, Katsuoka F, Morohashi A, Yamamoto M, Tanaka T (aprel 2002). "MafG ning DNK bilan bog'laydigan domenining eritma tuzilishi". Nat. Tuzilishi. Biol. 9 (4): 252–6. doi:10.1038 / nsb771. PMID  11875518. S2CID  23687470.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR004826