COG2 - COG2
Konservalangan oligomerik Golgi kompleksi 2-bo'linmasi a oqsil odamlarda kodlanganligi COG2 gen.[5][6]Multiprotein komplekslari Golji apparati tuzilishini va uning hujayra ichidagi transport va glikoprotein modifikatsiyasini o'tkazish qobiliyatini belgilovchi asosiy omil hisoblanadi. Golgi transport kompleksi (GTC), glikozillanish reaksiyalarida qatnashadigan LDLC kompleksi va vesikulyar transportda ishtirok etadigan SEC34 kompleksi kabi bir qancha komplekslar aniqlandi. Ushbu 3 kompleks bir xil va ular tarkibiga COG2 (Ungar va boshq., 2002) kiruvchi konservalangan oligomerik Golgi (COG) kompleksi deb nom berilgan.[6]
Model organizmlar
| Xarakterli | Fenotip |
|---|---|
| Gomozigota hayotiylik | Anormal |
| Retsessiv halokatli o'rganish | Oddiy |
| Fertillik | Oddiy |
| Tana vazni | Oddiy |
| Tashvish | Oddiy |
| Nevrologik baholash | Oddiy |
| Qo'l kuchi | Oddiy |
| Issiq tarelka | Oddiy |
| Dismorfologiya | Oddiy |
| Bilvosita kalorimetriya | Oddiy |
| Glyukoza bardoshlik testi | Oddiy |
| Miya eshitishining eshitish javobi | Oddiy |
| DEXA | Oddiy |
| Radiografiya | Oddiy |
| Tana harorati | Oddiy |
| Ko'z morfologiyasi | Oddiy |
| Klinik kimyo | Oddiy |
| Gematologiya | Oddiy |
| Periferik qon limfotsitlari | Oddiy |
| Mikronukleus sinovi | Oddiy |
| Yurakning vazni | Oddiy |
| Teri histopatologiyasi | Oddiy |
| Miya gistopatologiyasi | Oddiy |
| Salmonella infektsiya | Oddiy[7] |
| Sitrobakter infektsiya | Oddiy[8] |
| Barcha testlar va tahlillar[9][10] |
Model organizmlar COG2 funktsiyasini o'rganishda ishlatilgan. Shartli sichqoncha chiziq, chaqirildi Cog2tm1a (KOMP) Vtsi[11][12] ning bir qismi sifatida yaratilgan Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi Dastur - kasallikning hayvon modellarini yaratish va manfaatdor olimlarga tarqatish uchun yuqori samaradorlikdagi mutagenez loyihasi.[13][14][15]
Erkak va urg'ochi hayvonlar standartlashtirildi fenotipik ekran o'chirish ta'sirini aniqlash uchun.[9][16] Yigirma beshta amalga oshirildi mutant sichqonlar va bitta anormallik kuzatildi: yo'q bir jinsli mutant sichqonlar qadar omon qoldi sutdan ajratish. Qolgan sinovlar o'tkazildi heterozigot mutant kattalar sichqonlari; ushbu hayvonlarda qo'shimcha anormallik kuzatilmagan.[9]
O'zaro aloqalar
COG2 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan COG4[17] va COG3.[18]
Adabiyotlar
- ^ a b v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000135775 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031979 - Ansambl, 2017 yil may
- ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
- ^ Podos SD, Reddy P, Ashkenas J, Krieger M (dekabr 1994). "LDLC oddiy Golgi funktsiyasi uchun zarur bo'lgan brefeldin A-sezgir, periferik Golgi oqsilini kodlaydi". J hujayra biol. 127 (3): 679–91. doi:10.1083 / jcb.127.3.679. PMC 2120235. PMID 7962052.
- ^ a b "Entrez Gen: Oligomerik golgi kompleksi 2 ning COG2 komponenti".
- ^ "Salmonella Cog2 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
- ^ "Sitrobakter Cog2 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
- ^ a b v Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetika dasturi: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ Sichqoncha resurslari portali, Wellcome Trust Sanger instituti.
- ^ "Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi".
- ^ "Sichqoncha genomining informatikasi".
- ^ Skarnes, VC.; Rozen, B.; G'arbiy, A. P .; Koutsourakis, M .; Bushell, V .; Iyer, V .; Muxika, A. O .; Tomas, M.; Xarrou, J .; Koks, T .; Jekson, D.; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Nefedov, M.; De Yong, P. J.; Styuart, A. F.; Bredli, A. (2011). "Sichqon genlari funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut-resurs". Tabiat. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Kollinz FS, Rossant J, Vurst V (2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ van der Veyden L, Uayt JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "Sichqoncha genetikasi uchun asboblar to'plami: funktsiyasi va mexanizmini ochib berish". Genom Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
- ^ Loh, Eva; Hong Wanjin (iyun 2004). "Konservalangan oligomerik Golgi bog'lash majmuasining o'zaro ta'sir qiluvchi tarmog'i". J. Biol. Kimyoviy. 279 (23): 24640–8. doi:10.1074 / jbc.M400662200. ISSN 0021-9258. PMID 15047703.
- ^ Loh, Eva; Hong Wanjin (iyun 2002). "Sec34 endoplazmik retikulumdan Golgi tomon yo'l harakati bilan bog'liq va GTC-90 va ldlBp bilan kompleksda mavjud". J. Biol. Kimyoviy. 277 (24): 21955–61. doi:10.1074 / jbc.M202326200. ISSN 0021-9258. PMID 11929878.
Tashqi havolalar
- Inson COG2 genom joylashuvi va COG2 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.
Qo'shimcha o'qish
- Salesiotis AN, Vang CK, Vang CD va boshq. (1995). "Differentsial displey orqali oshqozon saraton hujayralari qatoridan yangi genlarni aniqlash". Saraton Lett. 91 (1): 47–54. doi:10.1016 / 0304-3835 (95) 03717-B. PMID 7750094.
- Loh E, Xong V (2002). "Sec34 endoplazmik retikulumdan Golgi tomon yo'l harakati bilan bog'liq va GTC-90 va ldlBp bilan kompleksda mavjud". J. Biol. Kimyoviy. 277 (24): 21955–61. doi:10.1074 / jbc.M202326200. PMID 11929878.
- Ungar D, Oka T, mo'rt EE va boshqalar. (2002). "Golgi morfologiyasi va funktsiyasi uchun zarur bo'lgan sutemizuvchilarning Golgi-lokalizatsiya qilingan COG oqsil kompleksining xarakteristikasi". J. Hujayra Biol. 157 (3): 405–15. doi:10.1083 / jcb.200202016. PMC 2173297. PMID 11980916.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Loh E, Xong V (2004). "Konservalangan oligomerik Golgi bog'lash majmuasining o'zaro ta'sir qiluvchi tarmog'i". J. Biol. Kimyoviy. 279 (23): 24640–8. doi:10.1074 / jbc.M400662200. PMID 15047703.
- Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T va boshq. (2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
- Sohda M, Misumi Y, Yoshimura S va boshq. (2007). "Golgi yaxlitligi uchun ikkita bog'lash omilining o'zaro ta'siri, p115 va COG kompleksi". Yo'l harakati. 8 (3): 270–84. doi:10.1111 / j.1600-0854.2006.00530.x. PMID 17274799.