CPSF1 - CPSF1

CPSF1
Identifikatorlar
Taxalluslar	CPSF1, CPSF160, HSU37012, P / cl.18, dekolte va poliadenilatsiyaga xos omil 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 Generkartalar: CPSF1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	144,409,349 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 15 (sichqoncha)
Oxiri	76,607,591 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nuklein kislota bilan bog'lanish; • fermentlarni bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • mRNA 3'-UTR AUga boy mintaqani bog'lash; • RNK bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• mRNK parchalanishi va poliadenillanishning o'ziga xosligi omillari kompleksi; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma;
Biologik jarayon	• mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali; • RNK polimeraza II transkripsiyasini tugatish; • mRNA poliadenilatsiyasi; • mRNKni qayta ishlash; • mRNA parchalanishi; • mRNA 3'-ni qayta ishlash; • mRNA yadrosidan eksport qilish; • poliadenilatlanish uchun zarur bo'lgan mRNKgacha bo'linish; • tRNK qo'shilishi, endonukleolitik bo'linish va ligatsiya orqali;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	29894
	94230
	ENSG00000071894
	ENSMUSG00000034022
	Q10570
	Q9EPU4
	NM_013291
	NM_001164173; NM_053193; NM_001361485
	NP_037423
	NP_001157645; NP_444423; NP_001348414
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Parchalanish va poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati omili 1-bo'lim a oqsil odamlarda kodlanganligi CPSF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Ko'p hollarda ökaryotik oldindan xabarchi (m) RNK 3 ta asosiy uchi ikki muvofiqlashtirilgan bosqichda qayta ishlanadi. Dastlab endonukleaza orqali uchastkaga xos bo'linish, so'ngra 5 ta asosiy parchalanish mahsulotining 3 ta asosiy uchida poli (A) quyruq qo'shilishi mavjud. Parchalanish uchun to'rt sububunitli komplekslar kerak bo'ladi, ya'ni dekolte va poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati (CPSF), dekolmani stimulyatsiya qilish koeffitsienti (CstF), bo'linish omillari Im va IIm (CFIm va CFIIm), shuningdek bitta subunitli poli (A) polimeraza (PAP). CPSF1 CPSF1, CPSF2, CPSF3, CPSF4, FIP1L1, Symplekin va WDR33 dan tashkil topgan va yadroda joylashgan CPSF kompleksining eng katta tarkibiy qismidir.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000071894 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034022 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Jenni A, Keller V (sentyabr 1995). "Sigirning bo'linishi va poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati 160 kDa subbirligini kodlovchi cDNA-larni klonlash". Nuklein kislotalari rez. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.
^ Murthy KG, Manley JL (1995 yil dekabr). "Odamning bo'linishi-poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati omilining 160-kD subbirligi mRNA 3'-oxirigacha hosil bo'lishini muvofiqlashtiradi". Genlar Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10.1101 / gad.9.21.2672. PMID 7590244.
^ "Entrez geni: CPSF1 dekolte va poliadenilatsiyaga xos omil 1, 160kDa".
^ Shi Y, Di Giammartino DC, Teylor D, Sarkeshik A, Rays WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (Fevral 2009). "Inson mRNA 3 'ga qadar qayta ishlash kompleksining molekulyar arxitekturasi". Mol. Hujayra. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

Qo'shimcha o'qish

Keller V, Bienrot S, Lang KM, Kristofori G (1992). "Parchalanish va poliadenilatsiya faktori CPF mRNA 3 ga qadar" AAUAAA ishlov berish signali bilan o'zaro ta'sir qiladi ". EMBO J. 10 (13): 4241–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb05002.x. PMC 453176. PMID 1756731.
Thuresson AC, Aström J, Aström A va boshq. (1994). "Inson hujayralaridagi poli (A) polimerazalarning ko'p shakllari". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 91 (3): 979–83. doi:10.1073 / pnas.91.3.979. PMC 521437. PMID 8302877.
Schul V, Groenhout B, Koberna K va boshq. (1996). "RNK 3 'ajratish omillari CstF 64 kDa va CPSF 100 kDa o'ralgan jismlar va yangi sintez qilingan RNK bilan chambarchas bog'liq bo'lgan yadro domenlarida to'plangan". EMBO J. 15 (11): 2883–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386.
McCracken S, Fong N, Yanqulov K va boshq. (1997). "RNK polimeraza II juftlarining m-RNKlarini transkripsiyaga qadar qayta ishlashning C-terminal domeni". Tabiat. 385 (6614): 357–61. doi:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523. S2CID 4307073.
Dantonel JK, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkripsiya faktori TFIID mRNA ning 3 'uchini hosil qilish uchun CPSF omilini jalb qiladi". Tabiat. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784. S2CID 4413324.
Takagaki Y, Manli JL (2000). "Insonning poliadenilatlash apparati tarkibidagi oqsillarning o'zaro o'zaro ta'siri yangi komponentni aniqlaydi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
de Vries H, Rüegsegger U, Xyubner V va boshq. (2000). "Inson mRNK dekolte faktori IIm tarkibida xamirturush oqsillarining homologlari mavjud va yana ikkita ajralish omillari ko'prigi". EMBO J. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
Samiotaki M, Balatsos NA, Courtis N, Tsiapalis CM (2001). "Radiatsion gibrid xaritalash orqali odamning 8q24.23 xromosomasiga parchalanish va poliadenilatsiyaning o'ziga xoslik koeffitsienti (CPSF1) ning 160-kDa kichik birligini tayinlash". Sitogenet. Hujayra geneti. 90 (3–4): 234–5. doi:10.1159/000056776. PMID 11124521. S2CID 202645825.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). "SRm160 birlashtiruvchi koaktivator transkriptning 3′ uchli dekoltsiyasini targ'ib qiladi". Mol. Hujayra. Biol. 22 (1): 148–60. doi:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002. PMC 134228. PMID 11739730.
Maeda Y, Ito M, Xarashima N va boshq. (2002). "Parchalanish va poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati (CPSF) asosidagi peptidlar oshqozon-ichak saratoni bilan kasallangan bemorlarning ko'pchiligida HLA-A2 cheklangan va o'smalarga xos CTLlarni keltirib chiqarishi mumkin". Int. J. Saraton. 99 (3): 409–17. doi:10.1002 / ijc.10377. PMID 11992410. S2CID 12789683.
Holland L, Gautier L, Bell-Rojers P, Yanqulov K (2002). "Minichromosoma parvarishlash oqsili 2 ning alohida qismlari histon H3 / H4 va RNK polimeraza II holoenzim bilan bog'lanadi". Yevro. J. Biokimyo. 269 (21): 5192–202. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03224.x. PMID 12392551.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lehner B, Semple JI, Braun SE va boshqalar. (2004). "Yuqori darajadagi xamirturushli ikki gibrid tizimni tahlil qilish va undan odamning MHC III klassi hududida kodlangan hujayra ichidagi oqsillarning ishlashini bashorat qilishda foydalanish". Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Kaufmann I, Martin G, Fridlen A va boshq. (2005). "Human Fip1 - U-ga boy RNK elementlari bilan bog'langan va poli (A) polimerazni stimulyatsiya qiluvchi CPSF ning kichik birligi". EMBO J. 23 (3): 616–26. doi:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Shvarts D va boshq. (2004). "HeLa hujayra yadroviy fosfoproteidlarining keng ko'lamdagi tavsifi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tashqi havolalar

Inson CPSF1 genom joylashuvi va CPSF1 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 8 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000071894 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034022 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid7651824-5] Jenni A, Keller V (sentyabr 1995). "Sigirning bo'linishi va poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati 160 kDa subbirligini kodlovchi cDNA-larni klonlash". Nuklein kislotalari rez. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.

[pmid7590244-6] Murthy KG, Manley JL (1995 yil dekabr). "Odamning bo'linishi-poliadenilatsiyaning o'ziga xos xususiyati omilining 160-kD subbirligi mRNA 3'-oxirigacha hosil bo'lishini muvofiqlashtiradi". Genlar Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10.1101 / gad.9.21.2672. PMID 7590244.

[entrez-7] "Entrez geni: CPSF1 dekolte va poliadenilatsiyaga xos omil 1, 160kDa".

[pmid19217410-8] Shi Y, Di Giammartino DC, Teylor D, Sarkeshik A, Rays WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (Fevral 2009). "Inson mRNA 3 'ga qadar qayta ishlash kompleksining molekulyar arxitekturasi". Mol. Hujayra. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]