Sellozavr - Cellosaurus


Sellozavr
Tarkib
TavsifSellozavr: hujayra chiziqlaridagi bilim manbai
Ma'lumot turlari
qo'lga olindi		Hujayra chiziqlari
OrganizmlarUmurtqali hayvonlar, Hasharot, Shomil
Aloqa
Ilmiy-tadqiqot markaziShveytsariya bioinformatika instituti
LaboratoriyaKALIFO
MualliflarAmos Bayroch
Kirish
Ma'lumotlar formatiYassi fayllar bazasi, OBO va XML
Veb-saytveb.xavfsizlik.org/ cellosaurus/
URLni yuklab olishftp://ftp.expasy.org/databases/cellosaurus
Asboblar
InternetQidirmoq
Turli xil
LitsenziyaCreative Commons Attribution-NoDerivs
VersiyalarHa
Ma'lumotlarni chiqarish
chastota		Yiliga 4 dan 6 gacha nashrlar
Kuratsiya siyosatiHa - qo'lda
Xatcho'plar
sub'ektlar		Ha - alohida katak yozuvlari

Sellozavr biomedikal tadqiqotlarda ishlatiladigan barcha hujayra satrlarini hujjatlashtirishga urinadigan hujayra liniyalaridagi onlayn ma'lumot manbai.[1] Bu tomonidan taqdim etiladi Shveytsariya bioinformatika instituti (SIB) o'z hissalaridan biri sifatida[2][tekshirib bo'lmadi ] ga ELIXIR. Bu Resurs identifikatsiya portalidagi hujayra liniyalari uchun hissa qo'shadigan manba.[3] 2020 yil aprel oyidan boshlab taxminan 118,000 hujayra liniyalari uchun ma'lumot mavjud.[4]

Uning ko'lami o'z ichiga oladi abadiylashtirilgan hujayra chiziqlari, tabiiy ravishda o'lmaydigan hujayra chiziqlari (misol: embrional ildiz hujayralari ) va cheklangan hayot hujayralari chiziqlari taqsimlanganda va keng ishlatilganda. Cellosaurus qo'lda davolanadigan ko'plab ma'lumotlarni taqdim etadi; har bir hujayra chizig'i uchun tavsiya etilgan ism, sinonimlar va kelib chiqish turlari ro'yxati berilgan. Axborotning boshqa turlariga standartlashtirilgan kasallik terminologiyasi kiradi (uchun saraton yoki genetik buzilish hujayra liniyalari), hujayra chizig'ini abadiylashtirish uchun ishlatiladigan transformator, transfekte qilingan yoki urib tushirilgan genlar, mikrosatellitning beqarorligi, vaqtni ikki baravar oshirish, donorning jinsi va yoshi (bemor yoki hayvon), ketma-ketlikning muhim o'zgarishlari, veb-havolalar, nashrga havolalar va o'zaro bog'liqlik 70 dan ortiq turli xil ma'lumotlar bazalariga, ontologiyalarga, hujayralar to'plamlariga va boshqa tegishli manbalarga.[5]

Tadqiqotda ishlatiladigan ko'plab hujayra chiziqlari noto'g'ri aniqlanganligi yoki ifloslangan, Cellosaurus muammoli hujayra liniyalarini, shu jumladan Xalqaro Uyali Hujjatlarni Tasdiqlash Qo'mitasida (ICLAC) ro'yxatga olinganlarning hammasini kuzatib boradi.[6] jadvallar. Inson uchun ham, ba'zi bir it hujayralari qatorlari ham beradi qisqa tandemni takrorlash (STR) profil ma'lumotlari. 2018 yil iyul oyidan boshlab Cellosaurusdagi barcha hujayra chiziqlari element sifatida namoyish etiladi Vikidata.[7] 2020 yil mart oyida Cellosaurus tegishli bo'lgan hujayra liniyasi ma'lumotlarini o'z ichiga olgan sahifani yaratdi SARS-CoV-2 ga javoban Covid-19 pandemiyasi.[8][9]

Adabiyotlar

  1. ^ Bairoch Amos (2018). "Cellosaurus, hujayra qatori bilim manbai". Biyomolekulyar usullar jurnali. 29 ([Epub nashrdan oldin): 1-14. doi:10.7171 / jbt.18-2902-002. PMC  5945021. PMID  29805321.
  2. ^ "Xizmatlar | ELIXIR".
  3. ^ https://scicrunch.org/resources/Cell%20Lines/source/SCR_013869-1/search?q=%2A&l=
  4. ^ "ExPASy - Cellosaurus". web.expasy.org. Olingan 2020-04-13.
  5. ^ "Cellosaurus tavsifi - hujayra chiziqlaridagi bilim manbai". web.expasy.org. Olingan 2020-04-13.
  6. ^ http://iclac.org/wp-content/uploads/Cross-Contaminations-v8_0.pdf
  7. ^ Bayroch, A (2018). "Cellosaurus, hujayraning bilim manbai". J Biomol Tech. 29 (2).
  8. ^ Cellosaurus (2020-03-23). "MUHIM: biz #Cellosaurus veb-saytida SARS-CoV-2 ni o'rganishda #celllines dan foydalanadigan tadqiqotchilarga yordam berish uchun sahifa yaratdik: https://web.expasy.org/cellosaurus/sars-cov-2.html… Biz rejalashtirmoqdamiz ushbu sahifani tez-tez yangilab turish uchun # COVID19 ". @Cellosaurus. Olingan 2020-04-13. Tashqi havola sarlavha = (Yordam bering)
  9. ^ "Cellosaurus - SARS-CoV-2 tegishli ma'lumotlari". web.expasy.org. Olingan 2020-04-14.

Tashqi havolalar