DDX19B - DDX19B

DDX19B
Mavjud tuzilmalar
PDB	Inson UniProt qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	3EWS, 3FHC, 3FHT, 3FMO, 3FMP, 3G0H
Identifikatorlar
Taxalluslar	DDX19B, DBP5, DDX19, RNAh, DEAD-box helikaz 19B
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 605812 MGI: 2148251 HomoloGene: 56032 Generkartalar: DDX19B
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	70,335,283 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nukleotid bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • gidrolaza faolligi; • ATP majburiy; • GO: 0008026 helikaz faoliyati; • RNK bilan bog'lanish; • nuklein kislota bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• yadroviy konvert; • yadroviy teshik; • membrana emas; • hujayra tashqari ekzozoma; • membrana; • hujayra yadrosi; • katalitik 2-bosqich splitseozoma; • nukleus; • sitoplazma;
Biologik jarayon	• oqsillarni tashish; • mRNA transporti; • RNKning ikkinchi darajali tuzilishi; • mRNA yadrosidan eksport qilish; • RNK qo'shilishi; • gen ekspressionini tartibga solish; • transport;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	11269
	234733
	ENSG00000157349
	ENSMUSG00000033658
	Q9UMR2
	n / a
NM_001014449; NM_001014451; NM_001257172; NM_001257173; NM_001257174;
	NM_001257175; NM_007242; NM_001363938
	NM_001190786; NM_001190800; NM_172284
NP_001014449; NP_001014451; NP_001244101; NP_001244102; NP_001244103;
	NP_001244104; NP_009173; NP_001350867
	n / a
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

ATP ga bog'liq bo'lgan RNK helikaz DDX19B bu ferment odamlarda kodlanganligi DDX19B gen.^[4]^[5]

O'lik quti konservalangan Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) motifi bilan tavsiflangan oqsillar, taxminiy RNK helikaslar. Ular RNK o'zgarishini o'z ichiga olgan bir qator uyali jarayonlarda ishtirok etadi ikkilamchi tuzilish tarjimani boshlash, yadro va mitoxondriyali biriktirish va ribosoma va splitseozoma yig'ilish. Ularning tarqalish uslublariga asoslanib, ushbu oilaning ba'zi a'zolari ishtirok etgan deb hisoblashadi embriogenez, spermatogenez va uyali o'sish va bo'linish. Ushbu gen RNKga bog'liq bo'lgan DEAD qutisi oqsilini kodlaydi ATPase va ATP ga bog'liq bo'lgan RNKni bo'shatish faoliyati. Bu oqsil ning sitoplazmatik fibrillalariga qo'shiladi yadro teshiklari kompleksi, qaerda eksport qilishda ishtirok etadi mRNA dan yadro. Bir nechta muqobil ravishda birlashtirilgan transkript variantlari kodlash boshqacha izoformlar ushbu gen uchun topilgan.^[5]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157349 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Pante N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Seraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (1999 yil sentyabr). "DBp5, mRNA eksporti uchun zarur bo'lgan O'LGAN qutidagi oqsil, yadro teshiklari kompleksining sitoplazmik fibrillalariga CAN / Nup159p bilan saqlanib qolgan ta'sir o'tkazish yo'li bilan jalb qilinadi". EMBO J. 18 (15): 4332–47. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4332. PMC 1171509. PMID 10428971.
^ ^a ^b "Entrez Gen: DDX19B DEAD (Asp-Glu-Ala-As) qutisi polipeptidi 19B".

Qo'shimcha o'qish

Mattioni T, Hume CR, Konigorski S va boshq. (1992). "DNK bilan bog'lanish faolligi bo'lgan yangi yadro oqsili uchun cDNA klon". Xromosoma. 101 (10): 618–24. doi:10.1007 / BF00360539. PMID 1424986. S2CID 23195894.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R va boshq. (2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: odamning CDNKlarini kodlaydigan 500 ta yangi to'liq oqsillarni ketma-ketligi va tahlili". Genom Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Yin L, Li J, Zhu H va boshq. (2003). "DEAD-box protein yangi izoformini kodlovchi genni aniqlash va tavsifi". Reproduktsiya. Urug'lantirish. Dev. 14 (3–4): 185–9. doi:10.1071 / RD01028. PMID 12219940.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ewing RM, Chu P, Elisma F va boshq. (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000157349 - Ansambl, 2017 yil may

[2] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[3] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10428971-4] Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Pante N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Seraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (1999 yil sentyabr). "DBp5, mRNA eksporti uchun zarur bo'lgan O'LGAN qutidagi oqsil, yadro teshiklari kompleksining sitoplazmik fibrillalariga CAN / Nup159p bilan saqlanib qolgan ta'sir o'tkazish yo'li bilan jalb qilinadi". EMBO J. 18 (15): 4332–47. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4332. PMC 1171509. PMID 10428971.

[entrez-5] "Entrez Gen: DDX19B DEAD (Asp-Glu-Ala-As) qutisi polipeptidi 19B".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]