DR1 (gen) - DR1 (gene)

DR1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1JFI
Identifikatorlar
Taxalluslar	DR1, NC2, NC2-BETA, NC2B, transkripsiyaning pastga regulyatori 1, NCB2
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 601482 MGI: 1100515 HomoloGene: 38809 Generkartalar: DR1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 1 (odam)
Oxiri	93,369,493 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 5 (sichqoncha)
Oxiri	108,280,526 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• TBP sinfidagi oqsillarni biriktirish; • DNK bilan bog'lanish; • transkripsiya faktorining majburiyligi; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • GO: 0001106 transkripsiyasi korepressor faoliyati; • oqsillarni heterodimerizatsiya qilish faoliyati; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi, RNK polimeraza II ga xos; • GO: 0001105 transkripsiya koaktivatori faoliyati; • GO: 0000983 RNK polimeraza II umumiy transkripsiyasini boshlash omilining faolligi;
Uyali komponent	• Ada2 / Gcn5 / Ada3 transkripsiyasini faollashtiruvchi kompleks; • hujayra yadrosi; • salbiy kofaktor 2 kompleksi;
Biologik jarayon	• transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • histon H3 atsetilatsiyasi; • transkripsiya, DNK-andozali; • xromatinni qayta qurish; • RNK-polimeraza II transkripsiyali oldindan rejalashtirish majmuasini tartibga solish; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi; • RNK polimeraza II transkripsiyali oldindan rejalashtirish kompleksi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiya;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	1810
	13486
	ENSG00000117505
	ENSMUSG00000029265
	Q01658
	Q91WV0
	NM_001938
	NM_026106
	NP_001929
	NP_080382
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Protein Dr1 a oqsil odamlarda kodlanganligi DR1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Ushbu gen TBP- (TATA qutisini bog'laydigan oqsil) bilan bog'langan fosfoproteinni kodlaydi, bu transkripsiyaning bazal va faollashtirilgan darajasini bosadi. Kodlangan oqsil in vivo jonli ravishda fosforillanadi va bu fosforlanish uning TBP bilan o'zaro ta'siriga ta'sir qiladi. Ushbu oqsil tarkibida aminok terminalda giston katlama motifi, TBP bilan bog'lanish sohasi va glutamin va alaninga boy mintaqa mavjud. DR1 repressor komplekslarini TBP-promotor komplekslari bilan bog'lab turishi, o'zgargan DNK konformatsiyasi, yuqori tartibli komplekslarning hosil bo'lishi bilan birga, preinitiatsiya kompleksining yig'ilishini inhibe qiladigan va RNK polimeraza II transkripsiyasi tezligini boshqaradigan mexanizmni yaratishi mumkin.^[7]

O'zaro aloqalar

DR1 (gen) ko'rsatilgan o'zaro ta'sir qilish bilan DRAP1.^[8]^[9]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000117505 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029265 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Inostroza JA, Mermelstein FH, Ha I, Leyn WS, Reynberg D (sentyabr 1992). "Dr1, TATA bilan bog'langan oqsil bilan bog'liq fosfoprotein va II sinf gen transkripsiyasining inhibitori". Hujayra. 70 (3): 477–89. doi:10.1016/0092-8674(92)90172-9. PMID 1339312.
^ Purrello M, Di Pietro C, Rapisarda A, Viola A, Corsaro C, Motta S, Grzeschik KH, Sichel G (1996). "Dr1 kodlovchi inson genining genomik lokalizatsiyasi, II va III sinf genlari transkripsiyasining manfiy modulyatori". Sitogenetika va hujayra genetikasi. 75 (2–3): 186–9. doi:10.1159/000134479. PMID 9040789.
^ ^a ^b "Entrez Gen: 1-transkripsiyaning DR1 pastga regulyatori, TBP-biriktiruvchi (salbiy kofaktor 2)".
^ Yeung K, Kim S, Reinberg D (1997 yil yanvar). "Odamning Dr1-DRAP1 repressor kompleksini funktsional disektsiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 17 (1): 36–45. doi:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.
^ Mermelshteyn F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K, Landsman D, Levitt P, Tempst P, Reinberg D (aprel 1996). "Transkripsiyani Dr1 vositachiligida repressiya qilish uchun korepressor talablari". Genlar Dev. 10 (8): 1033–48. doi:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

Qo'shimcha o'qish

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Goppelt A, Stelzer G, Lottspeich F, Meisterernst M (1996). "Heterodimerik histon katlama domenlari orqali TB2-promotor komplekslariga NC2 ni o'ziga xos bog'lash orqali II sinf gen transkripsiyasini repressiya qilish mexanizmi". EMBO J. 15 (12): 3105–16. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00673.x. PMC 450253. PMID 8670811.
Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "1-turdagi inson immunitet tanqisligi virusi TFIIDning noyob joyi bilan o'zaro ta'siri Dr1 salbiy kofaktorini inhibe qiladi va TFIID-TFIIA kompleksini barqaror qiladi". J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
Cowell IG, Hurst HC (1996). "E4BP4 transkripsiyali repressor va TBP-bog'lovchi oqsil Dr1 o'rtasidagi protein-oqsilning o'zaro ta'siri". Nuklein kislotalari rez. 24 (18): 3607–13. doi:10.1093 / nar / 24.18.3607. PMC 146135. PMID 8836190.
Rozet JM, Gerber S, Perrault I, Kamuzat A, Calvas P, Viegas-Pequignot E, Molina-Gomes D, Le Paslier D, Chumakov I, Munnich A, Kaplan J (1996). "TATA bilan bog'langan fosfoprotein geni bo'lgan DR1 ning tuzilishi va fizik xaritasi 1p22.1 xromosomasiga va uning Stargardt kasalligi (STGD) ga chiqarilishi". Genomika. 36 (3): 554–6. doi:10.1006 / geno.1996.0508. PMID 8884286.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kamada K, Shu F, Chen X, Malik S, Stelzer G, Roeder RG, Meisterernst M, Burley SK (2001). "TBP-DNK transkripsiyasi kompleksini tan oluvchi salbiy kofaktor 2 ning kristalli tuzilishi". Hujayra. 106 (1): 71–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00417-2. PMID 11461703.
Gilfillan S, Stelzer G, Piaia E, Hofmann MG, Meisterernst M (2005). "TATA yo'qligida NC2.TATA bilan bog'langan oqsilni DNK bilan samarali bog'lash". J. Biol. Kimyoviy. 280 (7): 6222–30. doi:10.1074 / jbc.M406343200. PMID 15574413.
Lyuis BA, Sims RJ, Leyn WS, Reinberg D (2005). "Yadro promotor elementlarining funktsional tavsifi: DPE-ga xos transkripsiya uchun protein kinaz CK2 va PC4 koaktivatori kerak". Mol. Hujayra. 18 (4): 471–81. doi:10.1016 / j.molcel.2005.04.005. PMID 15893730.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 yil. Nat. 437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Malecova B, Gross P, Boyer-Guittaut M, Yavuz S, Oelgeschläger T (2007). "Tashabbuskor yadro promouter elementi TATA-ga asoslangan transkripsiyaning NC2 salbiy kofaktori bilan repressiyasini antagonizatsiya qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 282 (34): 24767–76. doi:10.1074 / jbc.M702776200. PMID 17584739.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000117505 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000029265 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid1339312-5] Inostroza JA, Mermelstein FH, Ha I, Leyn WS, Reynberg D (sentyabr 1992). "Dr1, TATA bilan bog'langan oqsil bilan bog'liq fosfoprotein va II sinf gen transkripsiyasining inhibitori". Hujayra. 70 (3): 477–89. doi:10.1016/0092-8674(92)90172-9. PMID 1339312.

[pmid9040789-6] Purrello M, Di Pietro C, Rapisarda A, Viola A, Corsaro C, Motta S, Grzeschik KH, Sichel G (1996). "Dr1 kodlovchi inson genining genomik lokalizatsiyasi, II va III sinf genlari transkripsiyasining manfiy modulyatori". Sitogenetika va hujayra genetikasi. 75 (2–3): 186–9. doi:10.1159/000134479. PMID 9040789.

[entrez-7] "Entrez Gen: 1-transkripsiyaning DR1 pastga regulyatori, TBP-biriktiruvchi (salbiy kofaktor 2)".

[pmid8972183-8] Yeung K, Kim S, Reinberg D (1997 yil yanvar). "Odamning Dr1-DRAP1 repressor kompleksini funktsional disektsiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 17 (1): 36–45. doi:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.

[pmid8608938-9] Mermelshteyn F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K, Landsman D, Levitt P, Tempst P, Reinberg D (aprel 1996). "Transkripsiyani Dr1 vositachiligida repressiya qilish uchun korepressor talablari". Genlar Dev. 10 (8): 1033–48. doi:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]