De Bryuyn grafigi - De Bruijn graph

Yilda grafik nazariyasi, an n- o'lchovli De Bryuyn grafigi ning m belgilar bir yo'naltirilgan grafik belgilar ketma-ketliklari orasidagi o'zaro to'qnashuvlarni aks ettiradi. Unda bor mn tepaliklar mumkin bo'lgan barcha uzunliklardan iborat -n berilgan belgilarning ketma-ketliklari; bir xil belgi ketma-ketlikda bir necha marta paydo bo'lishi mumkin. Agar bizda to'plam mavjud bo'lsa m belgilar u holda tepaliklar to'plami:

Agar bironta tepalik sifatida uning barcha belgilarini bir joyga chap tomonga siljitish va shu tepaning oxiriga yangi belgi qo'shish orqali ifodalanishi mumkin bo'lsa, unda ikkinchisi oldingi tepaga yo'naltirilgan chekkaga ega. Shunday qilib, yoylarning to'plami (ya'ni yo'naltirilgan qirralarning)

Garchi De Bruijn grafikalari nomi bilan nomlangan Nikolaas Gvert de Bryuyn, ular mustaqil ravishda ikkala De Bryuyn tomonidan kashf etilgan[1] va I. J. Yaxshi.[2] Bundan ancha oldin, Kamil Flay Seynt-Mari[3] ularning xususiyatlaridan bevosita foydalanilgan.

Xususiyatlari

  • Agar u holda har qanday ikkita tepalikning sharti bo'sh joyni egallaydi va shu sababli barcha tepaliklar bir-biriga bog'lanib qirralar.
  • Har bir tepada aniq bor kiruvchi va chiquvchi qirralar.
  • Har biri De Bruijn o'lchovli grafigi chiziqli grafik ning - bir xil belgilar to'plamiga ega o'lchovli De Bryuyn grafigi.[4]
  • Har bir De Bruijn grafigi Evleriya va Hamiltoniyalik. Ushbu grafiklarning Eyler tsikllari va Gamilton davrlari (chiziqli grafika konstruktsiyasi orqali bir-biriga teng) De Bruijn ketma-ketliklari.

The chiziqli grafik quyida uchta eng kichik ikkitomonlama De Bruijn grafigi tasvirlangan. Rasmda ko'rinib turganidek, ning har bir tepasi De Bruijn o'lchovli grafigi .ning chekkasiga to'g'ri keladi - o'lchovli De Bruijn grafigi va har bir chekka De-Bruijn o'lchovli grafigi ichidagi ikki qirrali yo'lga to'g'ri keladi - o'lchovli De Bruijn grafigi.

DeBruijn-as-line-digraph.svg

Dinamik tizimlar

Ikkilik De Bruijn grafigini (quyida, chapda) shunday nazariyadagi narsalarga o'xshash tarzda chizish mumkin. dinamik tizimlar kabi Lorenz jalb qiluvchi (quyida, o'ngda):

DeBruijn-3-2.svg         Lorenz attraktori yb.svg

Ushbu o'xshashlikni qat'iy qilish mumkin: n- o'lchovli m- belgi De Bruijn grafigi - ning modeli Bernulli xaritasi

Bernulli xaritasi (shuningdek 2x mod 1 xarita uchun m = 2) an ergodik yagona deb tushunish mumkin bo'lgan dinamik tizim siljish a m-adic soni.[5] Ushbu dinamik tizimning traektoriyalari De Bruijn grafigidagi yurishlarga to'g'ri keladi, bu erda har bir haqiqiyni xaritalash orqali yozishmalar beriladi x [0,1) oralig'ida birinchisiga to'g'ri keladigan tepaga n raqamlari tayanch -m vakili x. Ekvivalent sifatida De Bruijn grafigida yurish bir tomonlama traektoriyalarga to'g'ri keladi chekli turdagi subshift.

Ikkala yo'naltirilgan grafikalar B (2, 3) de Bruijn ketma-ketliklari va a B (2, 4) ketma-ketlik. Bda (2,3). har bir tepaga bir marta tashrif buyuriladi, B (2,4) da esa har bir qirradan bir marta o'tadi.

Ikkala De Bruijn grafikalari borligini ko'rsatish uchun shunga o'xshash ko'milganlardan foydalanish mumkin navbat raqami 2[6] va ular bor kitob qalinligi ko'pi bilan 5.[7]

Foydalanadi

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ de Bryuyn; N. G. (1946). "Kombinatoriya muammosi". Koninklijke Nederlandse Akademie V. Wetenschappen. 49: 758–764.
  2. ^ Yaxshi, I. J. (1946). "Oddiy takrorlanadigan o'nliklar". London Matematik Jamiyati jurnali. 21 (3): 167–169. doi:10.1112 / jlms / s1-21.3.167.
  3. ^ Flye Saint-Marie, C. (1894). "Savol 48". L'Intermédiaire des Mathématiciens. 1: 107–110.
  4. ^ Chjan, Fu Dji; Lin, Guo Ning (1987). "De-Bruijn-Yaxshi grafikalar to'g'risida". Acta matematikasi. Sinika. 30 (2): 195–205.
  5. ^ Leroux, Filipp (2002). "Koassosiyatativ grammatika, davriy orbitalar va kvant tasodifiy yurish Z". arXiv:kvant-ph / 0209100.
  6. ^ Xit, Lenvud S.; Rozenberg, Arnold L. (1992). "Navbatlar yordamida grafikalar tuzish". Hisoblash bo'yicha SIAM jurnali. 21 (5): 927–958. doi:10.1137/0221055. JANOB  1181408.
  7. ^ Obrenich, Boyana (1993). "De Bruijn-ni joylashtirish va aralashma-almashinuv grafikalari besh sahifada". Diskret matematika bo'yicha SIAM jurnali. 6 (4): 642–654. doi:10.1137/0406049. JANOB  1241401.
  8. ^ Pevzner, Pavel A.; Tang, Xaysu; Waterman, Maykl S. (2001). "DNK bo'lagi yig'ilishiga Evlerian yo'l yondashuvi". PNAS. 98 (17): 9748–9753. Bibcode:2001 yil PNAS ... 98.9748P. doi:10.1073 / pnas.171285098. PMC  55524. PMID  11504945.
  9. ^ Pevzner, Pavel A.; Tang, Xayxu (2001). "Ikki bochkali ma'lumotlar bilan parcha yig'ish". Bioinformatika. 17 (Qo'shimcha 1): S225-S233. doi:10.1093 / bioinformatika / 17.suppl_1.S225. PMID  11473013.
  10. ^ Zerbino, Daniel R.; Birney, Ewan (2008). "Velvet: de Bruijn grafikalari yordamida de novo qisqa o'qish yig'ish algoritmlari". Genom tadqiqotlari. 18 (5): 821–829. doi:10.1101 / gr.074492.107. PMC  2336801. PMID  18349386.
  11. ^ Chixi, R; Limasset, A; Jekman, S; Simpson, J; Medvedev, P (2014). "De Bryuyn grafikalari haqida". Hisoblash biologiyasi jurnali: hisoblash molekulyar hujayra biologiyasi jurnali. 22 (5): 336–52. arXiv:1401.5383. doi:10.1089 / cmb.2014.0160. PMID  25629448.
  12. ^ Iqbol, Zamin; Kakkamo, Mario; Tyorner, Ishoq; Flikek, Pol; Makvin, Gil (2012). "De-Bruijn rangli grafikalari yordamida variantlarni yig'ish va genotiplash". Tabiat genetikasi. 44 (2): 226–32. doi:10.1038 / ng.1028. PMC  3272472. PMID  22231483.

Tashqi havolalar