EDEM3 - EDEM3

EDEM3

Identifikatorlar

EDEM3, C1orf22, ER degradatsiyasi, protein 3 kabi alfa-mannosidazani kuchaytiradi

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 610214 MGI: 1914217 HomoloGene: 11866 Generkartalar: EDEM3

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 1 (odam)^[1]

Band	1q25.3	Boshlang	184,690,237 bp^[1]
Band	1q25.3	Oxiri	184,754,907 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 1 (sichqoncha)^[2]

Band	1 \| 1 G1-G2	Boshlang	151,755,371 bp^[2]
Band	1 \| 1 G1-G2	Oxiri	151,822,051 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• kaltsiy ioni bilan bog'lanish • gidrolaza faolligi • metall ionlari bilan bog'lanish • mannosil-oligosakkarid 1,2-alfa-mannosidaza faolligi • katalitik faollik
Uyali komponent	• endoplazmatik to'r pardasi • endoplazmatik to'r • membrana • endoplazmik retikulum sifatini nazorat qilish bo'limi
Biologik jarayon	• endoplazmatik retikulum katlanmagan oqsil reaksiyasi • oqsil glikosilatsiyasi • N-glikanni qayta ishlash • katlanmagan oqsilga javob • glikoprotein katabolik jarayoni • proteazom vositachiligidagi ubiqitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni • glikoprotein ERAD yo'lida ishtirok etgan mannozni kesish
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


80267


66967


ENSG00000116406


ENSMUSG00000043019


Q9BZQ6


Q2HXL6

RefSeq (mRNA)


NM_025191 NM_001319960


NM_001039644 NM_001311165 NM_001311166

RefSeq (oqsil)


NP_001306889 NP_079467


NP_001034733 NP_001298094 NP_001298095

Joylashuv (UCSC)

Chr 1: 184.69 - 184.75 Mb

Chr 1: 151.76 - 151.82 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

ER degradatsiyasini kuchaytiradigan alfa-mannosidaza o'xshash 3 bu ferment odamlarda kodlanganligi EDEM3 gen.^[5]^[6]^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000116406 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000043019 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Mast SW, Diekman K, Karaveg K, Devis A, Sifers RN, Moremen KW (Mar 2005). "Human EDEM2, 47 glikozidaza oilasining yangi homologi, glikoproteinlarning ER bilan bog'liq degradatsiyasida ishtirok etadi". Glikobiologiya. 15 (4): 421–36. doi:10.1093 / glycob / cwi014. PMID 15537790.
^ Olivari S, Galli C, Alanen H, Ruddok L, Molinari M (Yanvar 2005). "Endoplazmik retikulum bilan bog'liq glikoprotein degradatsiyasini tartibga soluvchi yangi stressli EDEM varianti". J Biol Chem. 280 (4): 2424–8. doi:10.1074 / jbc.C400534200. PMID 15579471.
^ "Entrez Gen: EDEM3 ER degradatsiyasini kuchaytiruvchi, mannosidaza alfa o'xshash 3".

Qo'shimcha o'qish

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Sood R, Bonner TI, Makalowska I va boshq. (2001). "Irqiy prostata saratoni (HPC1) lokusini o'z ichiga olgan 1q25 mintaqadan olingan 13 ta yangi transkriptlar va odamning RGS8 genini klonlash va tavsifi". Genomika. 73 (2): 211–22. doi:10.1006 / geno.2001.6500. PMID 11318611.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kimura K, Vakamatsu A, Suzuki Y va boshq. (2006). "Transkripsiya modulyatsiyasining diversifikatsiyasi: keng ko'lamli identifikatsiyalash va inson genlarining muqobil alternativ targ'ibotchilarini tavsiflash". Genom Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Xirao K, Natsuka Y, Tamura T va boshq. (2006). "EDEM3, eruvchan EDEM gomologi, glikoprotein endoplazmik retikulum bilan bog'liq degradatsiyani va mannoz trimini kuchaytiradi". J. Biol. Kimyoviy. 281 (14): 9650–8. doi:10.1074 / jbc.M512191200. PMID 16431915.
Gregori SG, Barlow KF, McLay KE va boshq. (2006). "DNKning ketma-ketligi va odam xromosomasining biologik izohlanishi 1". Tabiat. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.