FAHD1 - FAHD1

FAHD1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1SAW
Identifikatorlar
Taxalluslar	FAHD1, C16orf36, YISKL, 1 o'z ichiga olgan fumarilatsetoatsetat gidrolaza domeni
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 616320 MGI: 1915886 HomoloGene: 6774 Generkartalar: FAHD1
EC raqami	4.1.1.112
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	1,840,207 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 17 (sichqoncha)
Oxiri	24,850,364 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• atsetilpiruvat gidrolaza faolligi; • asilpiruvat gidrolaza faolligi; • katalitik faollik; • gidrolaza faolligi; • fumarilpiruvat gidrolaza faolligi; • metall ionlari bilan bog'lanish; • liaza faoliyati; • oksaloatsetat dekarboksilaza faolligi;
Uyali komponent	• sitozol; • mitoxondriya; • nukleoplazma; • sitoplazma; • mitoxondriyal matritsa;
Biologik jarayon	• metabolizm; • trikarboksilik kislota aylanishi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	81889
	68636
	ENSG00000180185
	ENSMUSG00000045316
	Q6P587
	Q8R0F8
	NM_031208; NM_001018104; NM_001142398
	NM_023480
	NP_001018114; NP_001135870; NP_112485
	NP_075969
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Fumarilasetoatsetat gidrolaza domen tarkibidagi oqsil 1, shuningdek, FLJ36880 oqsili sifatida tanilgan, an ferment odamlarda kodlanganligi FAHD1 gen kuni 16-xromosoma.^[5]

Tuzilishi

FAHD1 geni mahalliylashtirilgan 24 kDa oqsilini kodlaydi mitoxondriya va ga tegishli fumarilasetoasetat gidrolaza oqsillar oilasi.^[6] FAHD1 tuzilmasi yordamida hal qilindi Rentgenologik kristallografiya 2.2-Å piksellar sonida. Umumiy tuzilish Escherichia coli C dan ikki funktsiyali ferment HpcE ning C-terminal domeniga, Mus musculusdan fumarilasetoasetat gidrolaza va E. coli 1262 dan YcgM (Apc5008) ga o'xshaydi.^[6] Asp-102 va Arg-106 kabi FAHD1 konservalangan aminokislotalar uning katalitik faolligi uchun muhim ahamiyatga ega.^[7]

Funktsiya

FAHD1 oqsili an sifatida ishlaydi oksaloatsetat dekarboksilaza yilda eukaryotlar.^[8] FAHD1 oqsili, ehtimol, asilpiruvaza, katalizatori ko'rsatilgan gidroliz ning atsetilpiruvat va fumarilpiruvat in vitro tajribalarda.^[6] Mg (2+) maksimal ferment faolligi uchun zarur edi.^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000180185 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000045316 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Entrez Gen: FAHD1 fumarylacetoacetate hydrolase domain, 1 o'z ichiga oladi".
^ ^a ^b ^v Manjasetty BA, Niesen FH, Delbrück H, Götz F, Sievert V, Bussov K, Behlke J, Heinemann U (2004). "Fumarilatsetoasetat gidrolaza oilasi a'zosi Homo sapiens FLJ36880 ning rentgen tuzilishi". Biol. Kimyoviy. 385 (10): 935–42. doi:10.1515 / BC.2004.122. PMID 15551868. S2CID 16759973.
^ ^a ^b Pircher H, Straganz GD, Ehehalt D, Morrow G, Tanguay RM, Jansen-Durr P (2011). "Odam fumarilasetoatsetat gidrolaza domenli protein 1 (FAHD1) ni yangi mitoxondriyal asilpiruvaza sifatida aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 286 (42): 36500–8. doi:10.1074 / jbc.M111.264770. PMC 3196145. PMID 21878618.
^ Pircher H, von Grafenstein S, Diener T, Metzger C, Albertini E, Taferner A, Unterluggauer H, Kramer C, Liedl KR, Jansen-Dyurr P (2015). "FAAL domen tarkibidagi oqsil 1 (FAHD1) ni oksaloatsetat dekarboksilaza sifatida aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 290 (11): 6755–62. doi:10.1074 / jbc.M114.609305. PMC 4358102. PMID 25575590.

Qo'shimcha o'qish

Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In vitro saytga xos rekombinatsiya yordamida DNKni klonlash". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C va boshq. (2001). "Inson xromosomasi 16 qisqa qo'lining to'liq izohli 2 Mb terminalining ketma-ketligi, tuzilishi va patologiyasi". Hum. Mol. Genet. 10 (4): 339–52. doi:10.1093 / hmg / 10.4.339. PMID 11157797.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R va boshq. (2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: odamning CDNKlarini kodlaydigan 500 ta yangi to'liq oqsillarni ketma-ketligi va tahlili". Genom Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A va boshq. (2001). "Keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi bilan aniqlangan yangi oqsillarni tizimli hujayralararo lokalizatsiyasi". EMBO vakili. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). "Inson mRNA degradatsiyasi uchun oqsillarning o'zaro ta'sir doirasi". Genom Res. 14 (7): 1315–23. doi:10.1101 / gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber V va boshqalar. (2004). "ORFeome'dan biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom Res. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Manjasetty BA, Niesen FH, Delbrück H va boshq. (2005). "Fumarylacetoacetate hydrolase family a'zosi Homo sapiens FLJ36880 ning rentgen tuzilishi". Biol. Kimyoviy. 385 (10): 935–42. doi:10.1515 / BC.2004.122. PMID 15551868. S2CID 16759973.
Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I va boshq. (2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalari rez. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000180185 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000045316 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: FAHD1 fumarylacetoacetate hydrolase domain, 1 o'z ichiga oladi".

[Manjasetty_BA_2004-6] v Manjasetty BA, Niesen FH, Delbrück H, Götz F, Sievert V, Bussov K, Behlke J, Heinemann U (2004). "Fumarilatsetoasetat gidrolaza oilasi a'zosi Homo sapiens FLJ36880 ning rentgen tuzilishi". Biol. Kimyoviy. 385 (10): 935–42. doi:10.1515 / BC.2004.122. PMID 15551868. S2CID 16759973.

[ReferenceA-7] Pircher H, Straganz GD, Ehehalt D, Morrow G, Tanguay RM, Jansen-Durr P (2011). "Odam fumarilasetoatsetat gidrolaza domenli protein 1 (FAHD1) ni yangi mitoxondriyal asilpiruvaza sifatida aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 286 (42): 36500–8. doi:10.1074 / jbc.M111.264770. PMC 3196145. PMID 21878618.

[8] Pircher H, von Grafenstein S, Diener T, Metzger C, Albertini E, Taferner A, Unterluggauer H, Kramer C, Liedl KR, Jansen-Dyurr P (2015). "FAAL domen tarkibidagi oqsil 1 (FAHD1) ni oksaloatsetat dekarboksilaza sifatida aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 290 (11): 6755–62. doi:10.1074 / jbc.M114.609305. PMC 4358102. PMID 25575590.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]