Glypican 1 - Glypican 1

GPC1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	4ACR, 4AD7, 4BWE, 4YWT
Identifikatorlar
Taxalluslar	GPC1, glypican, Glypican 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 600395 MGI: 1194891 HomoloGene: 20477 Generkartalar: GPC1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 2 (odam)
Oxiri	240,468,076 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 1 (sichqoncha)
Oxiri	92,860,779 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• fibroblast o'sish faktorini bog'lash; • geparan sulfatni proteoglikan bilan bog'lash; • mis ionlari bilan bog'lanish; • lamininni bog'lash;
Uyali komponent	• endosoma; • membrana; • plazma membranasining ajralmas komponenti; • lizosomal lümen; • Golgi lümeni; • membrana sal; • membrananing biriktirilgan komponenti; • hujayra tashqari ekzozoma; • hujayradan tashqari; • nukleoplazma; • sitozol; • hujayra membranasi; • hujayradan tashqari matritsa; • hujayradan tashqari mintaqa; • plazma membranasining ichki komponenti; • sinaps; • plazma membranasining langar komponenti; • kollagen o'z ichiga olgan hujayradan tashqari matritsa; • hujayra yuzasi;
Biologik jarayon	• glikozaminoglikan metabolik jarayoni; • miyelin yig'ilishi; • heparan sulfat proteoglikan katabolik jarayoni; • retinoid metabolizm jarayoni; • akson qo'llanmasi; • fibroblast o'sish faktori retseptorlari signalizatsiya yo'lining salbiy regulyatsiyasi; • skelet mushaklari hujayralarining farqlanishini ijobiy tartibga solish; • glikozaminoglikan katabolik jarayoni; • glikozaminoglikan biosintezi jarayoni; • Shvann hujayralarining differentsiatsiyasi; • leykotsitlar migratsiyasi; • signal uzatilishini tartibga solish; • hujayra migratsiyasi; • membrana oqsillarni lokalizatsiyasini tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	2817
	14733
	ENSG00000063660
	ENSMUSG00000034220
	P35052
	Q9QZF2
	NM_002081
	NM_016696
	NP_002072
	NP_057905
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Glypican-1 a oqsil odamlarda kodlanganligi GPC1 gen.^[5]^[6]

Funktsiya

Hujayra sirtidagi geparan sulfat proteoglikanlar o'zgaruvchan heparan sulfat zanjirlari bilan almashtirilgan membrana bilan bog'langan oqsil yadrosidan iborat. A'zolari glypikan bilan bog'liq bo'lgan integral membrana proteoglikan oilasida (GRIPS) sitoplazmatik membranaga a glikozil fosfatidilinozitol bog'lanish. Ushbu oqsillar hujayraning bo'linishini boshqarishda va o'sishni boshqarishda rol o'ynashi mumkin.^[6]

O'zaro aloqalar

Glypican 1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan SLIT2.^[7]

Klinik ahamiyati

Ushbu oqsil normalning noto'g'ri tushishida ishtirok etadi prion hujayra membranasidagi oqsillarni yuqumli prion shakliga.^[8]

2015 yilda ushbu oqsilning mavjudligi haqida xabar berilgan edi ekzosomalar bemorlarning qonida erta aniqlashga qodir oshqozon osti bezi saratoni mutlaq o'ziga xoslik va sezgirlik bilan.^[9] Ammo bu xulosa bahsli.^[10] va oshqozon osti bezi saratoni uchun potentsial markerlarning so'nggi sharhlarida Glypican 1 haqida so'z yuritilmagan.^[11]^[12]

Shuningdek qarang

Glypican

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000063660 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034220 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Vermeesch JR, Mertens G, Devid G, Maryen P (Iyul 1995). "Insonning glypican genini (GPC1) 2q35-q37 ga in situ gibridlash orqali lyuminestsentsiya bilan tayinlash". Genomika. 25 (1): 327–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-C. PMID 7774946.
^ ^a ^b "Entrez Gen: GPC1 glypican 1".
^ Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (avgust 2001). "Glitpikan-1 bilan oqsillarning o'zaro ta'sirining xarakteristikasi". J. Biol. Kimyoviy. 276 (31): 29141–7. doi:10.1074 / jbc.M100240200. PMID 11375980.
^ Teylor DR, Whitehouse IJ, Hooper NM (noyabr 2009). "Glypican-1 ikkala prion oqsilli lipid raft assotsiatsiyasi va kasallik izoformasi shakllanishiga vositachilik qiladi". PLOS patogenlari. 5 (11): e1000666. doi:10.1371 / journal.ppat.1000666. PMC 2773931. PMID 19936054.
^ Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandes AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (iyul 2015) . "Glypican-1 saraton ekzozomalarini aniqlaydi va oshqozon osti bezi saratonini aniqlaydi". Tabiat. 523 (7559): 177–82. doi:10.1038 / tabiat14581. PMC 4825698. PMID 26106858.
^ Www.pubpeer.com saytidagi munozaralar; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888
^ Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (avgust 2017). "Jarrohlik yo'li bilan rezektsiya qilinadigan oshqozon osti bezi saratonini aniqlash uchun plazmadagi biomarkerlar paneli". Milliy saraton instituti jurnali. 109 (8). doi:10.1093 / jnci / djw341. PMC 6059209. PMID 28376184.
^ Chang JC, Kundranda M (mart 2017). "Pankreatik adenokarsinomadagi yangi diagnostik va bashorat qiluvchi biomarkerlar". Xalqaro molekulyar fanlar jurnali. 18 (3): 667. doi:10.3390 / ijms18030667. PMC 5372679. PMID 28335509.

Qo'shimcha o'qish

Karthikeyan L; Maurel P; Rauch U; va boshq. (1992). "Asosiy geparan sulfat proteoglikanni miyadan klonlash va glypikanning kalamush shakli sifatida identifikatsiya qilish". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 188 (1): 395–401. doi:10.1016 / 0006-291X (92) 92398-H. PMID 1417860.
Devid G; Lory V; Dekok B; va boshq. (1991). "Fosfatidilinozit bilan biriktirilgan membrana geperan sulfat proteoglikanning inson o'pkasi fibroblastlaridan molekulyar klonlash". J. Hujayra Biol. 111 (6 Pt 2): 3165-76. doi:10.1083 / jcb.111.6.3165. PMC 2116352. PMID 2148568.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y; Yoshitomo-Nakagava K; Maruyama K; va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kleff J; Ishiwata T; Kumbasar A; va boshq. (1998). "Hujayra sirtidagi geperan sulfat proteoglikan glypican-1 oshqozon osti bezi karsinomasi hujayralarida o'sish omilining ta'sirini tartibga soladi va inson me'da osti bezi saratonida ortiqcha ta'sir ko'rsatadi". J. klinikasi. Investitsiya. 102 (9): 1662–73. doi:10.1172 / JCI4105. PMC 509114. PMID 9802880.
Gengrinovich S; Berman B; Devid G; va boshq. (1999). "Glypican-1 - bu VEGF165 uchun hujayradan tashqaridagi chaperone vazifasini bajaradigan VEGF165 bog'laydigan proteoglikan". J. Biol. Kimyoviy. 274 (16): 10816–22. doi:10.1074 / jbc.274.16.10816. PMID 10196157.
Liang Y; Annan RS; Carr SA; va boshq. (1999). "Drozofila yorig'i oqsilining sutemizuvchilar gomologlari - bu geparan sulfat proteoglikan glypican-1 ning miyadagi ligandlari". J. Biol. Kimyoviy. 274 (25): 17885–92. doi:10.1074 / jbc.274.25.17885. PMID 10364234.
Shofild KP, Gallagher JT, Devid G (2000). "Insonning suyak iligi stromasida proteoglikan yadrosi oqsillari ekspressioni". Biokimyo. J. 343 Pt 3 (3): 663-8. doi:10.1042/0264-6021:3430663. PMC 1220599. PMID 10527946.
Karumanchi SA; Jha V; Ramchandran R; va boshq. (2001). "Hujayra sirtidagi glipikanlar past afinosti bo'lgan endostatin retseptorlari" (PDF). Mol. Hujayra. 7 (4): 811–22. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00225-8. PMID 11336704.
Matsuda K; Maruyama H; Guo F; va boshq. (2001). "Glypican-1 insonning ko'krak bezi saratonida haddan tashqari ta'sir ko'rsatadi va ko'krak bezi saraton hujayralarida ko'p sonli heparin bilan bog'langan o'sish omillarining mitogen ta'sirini modulyatsiya qiladi". Saraton kasalligi. 61 (14): 5562–9. PMID 11454708.
Alvarez K, Fadic R, Brandan E (2002). "Dyuken mushaklari distrofiyasida geparan sulfat proteoglikanlarining kengaytirilgan sintezi va differentsial lokalizatsiyasi". J. hujayra. Biokimyo. 85 (4): 703–13. doi:10.1002 / jcb.10184. PMID 11968010. S2CID 20243469.
Ding K; Mani K; Cheng F; va boshq. (2002). "Ichki nitrosotiollardan olingan azot oksidi bilan glypican-1 heparan sulfatning misga bog'liq avtoklavlanishi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (36): 33353–60. doi:10.1074 / jbc.M203383200. PMID 12084716.
Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Belting M; Mani K; Yonsson M; va boshq. (2004). "Glypican-1 - bu sutemizuvchilar hujayralarida poliaminni qabul qilish vositasi: nitrosotioldan olingan azot oksidi uchun hal qiluvchi rol". J. Biol. Kimyoviy. 278 (47): 47181–9. doi:10.1074 / jbc.M308325200. PMID 12972423.
Ota T; Suzuki Y; Nishikava T; va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Vatanabe N; Araki V; Chuy DH; va boshq. (2004). "Glypican-1 inson miyasida Abeta bilan bog'langan HSPG sifatida: uning DIG domenlarida lokalizatsiyasi va Altsgeymer kasalligining patogenezidagi mumkin bo'lgan rollari". FASEB J. 18 (9): 1013–5. doi:10.1096 / fj.03-1040fje. PMID 15084524. S2CID 83560098.
Li J; Kleff J; Kayed H; va boshq. (2004). "Glypican-1 antisense transfektsiyasi Colo-357 oshqozon osti bezi saraton hujayralarida TGF-beta-ga bog'liq signallarni modulyatsiya qiladi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 320 (4): 1148–55. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.06.063. PMID 15249209.
Devies EJ; Blekxoll FH; Shanks JH; va boshq. (2005). "Tuxumdon saratonida geperan sulfat proteoglikanlarning tarqalishi va klinik ahamiyati". Klinika. Saraton kasalligi. 10 (15): 5178–86. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0103. PMID 15297422.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000063660 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000034220 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid7774946-5] Vermeesch JR, Mertens G, Devid G, Maryen P (Iyul 1995). "Insonning glypican genini (GPC1) 2q35-q37 ga in situ gibridlash orqali lyuminestsentsiya bilan tayinlash". Genomika. 25 (1): 327–9. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-C. PMID 7774946.

[entrez-6] "Entrez Gen: GPC1 glypican 1".

[pmid11375980-7] Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (avgust 2001). "Glitpikan-1 bilan oqsillarning o'zaro ta'sirining xarakteristikasi". J. Biol. Kimyoviy. 276 (31): 29141–7. doi:10.1074 / jbc.M100240200. PMID 11375980.

[Taylor_2009-8] Teylor DR, Whitehouse IJ, Hooper NM (noyabr 2009). "Glypican-1 ikkala prion oqsilli lipid raft assotsiatsiyasi va kasallik izoformasi shakllanishiga vositachilik qiladi". PLOS patogenlari. 5 (11): e1000666. doi:10.1371 / journal.ppat.1000666. PMC 2773931. PMID 19936054.

[Melo_2015-9] Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandes AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (iyul 2015) . "Glypican-1 saraton ekzozomalarini aniqlaydi va oshqozon osti bezi saratonini aniqlaydi". Tabiat. 523 (7559): 177–82. doi:10.1038 / tabiat14581. PMC 4825698. PMID 26106858.

[10] Www.pubpeer.com saytidagi munozaralar; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888

[pmid28376184-11] Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (avgust 2017). "Jarrohlik yo'li bilan rezektsiya qilinadigan oshqozon osti bezi saratonini aniqlash uchun plazmadagi biomarkerlar paneli". Milliy saraton instituti jurnali. 109 (8). doi:10.1093 / jnci / djw341. PMC 6059209. PMID 28376184.

[pmid28335509-12] Chang JC, Kundranda M (mart 2017). "Pankreatik adenokarsinomadagi yangi diagnostik va bashorat qiluvchi biomarkerlar". Xalqaro molekulyar fanlar jurnali. 18 (3): 667. doi:10.3390 / ijms18030667. PMC 5372679. PMID 28335509.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]