HMBOX1 - HMBOX1

HMBOX1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2CUF, 4J19
Identifikatorlar
Taxalluslar	HMBOX1, HNF1LA, HOT1, PBHNF, 1, TAH1 o'z ichiga olgan homeobox
Tashqi identifikatorlar	MGI: 2445066 HomoloGene: 11589 Generkartalar: HMBOX1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 8 (odam)
Oxiri	29,064,764 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 14 (sichqoncha)
Oxiri	64,949,871 bp
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • telomeraza faolligi; • ikki zanjirli telomerik DNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • bir xil protein bilan bog'lanish; • telomerik DNKni bog'lash; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 DNK bilan bog'langan transkripsiya repressor faoliyati, RNK polimeraza II ga xos; • ketma-ketlikka xos DNK bilan bog'lanish; • GO: 0032403 makromolekulyar kompleksni bog'lash; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNK bilan bog'laydigan transkripsiya omilining faolligi, RNK polimeraza II ga xos;
Uyali komponent	• sitoplazma; • hujayra yadrosi; • telomeraza holoenzim kompleksi; • nukleoplazma; • sitozol; • yadro tanasi; • yadro xromosomasi, telomerik mintaqa; • xromosoma, telomerik mintaqa; • xromosoma; • Kajal tanasi; • PML tanasi;
Biologik jarayon	• transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • telomeraza orqali telomerlarga texnik xizmat ko'rsatishni ijobiy tartibga solish; • transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • telomeraza faolligini ijobiy tartibga solish; • transkripsiya, DNK-andozali; • RNKga bog'liq bo'lgan DNK biosintezi jarayoni; • xromatin bilan bog'lanishning ijobiy regulyatsiyasi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • telomeraza faolligini tartibga solish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	79618
	219150
	ENSG00000147421
	ENSMUSG00000021972
	Q6NT76
	Q8BJA3
NM_001135726; NM_024567; NM_001324382; NM_001324383; NM_001324384;
	NM_001324385; NM_001324386; NM_001324387; NM_001324388; NM_001324389; NM_001324390; NM_001324391; NM_001324392; NM_001324393; NM_001324394; NM_001324395; NM_001330498
	NM_177338; NM_001347626; NM_001347627
NP_001129198; NP_001311311; NP_001311312; NP_001311313; NP_001311314;
	NP_001311315; NP_001311316; NP_001311317; NP_001311318; NP_001311319; NP_001311320; NP_001311321; NP_001311322; NP_001311323; NP_001311324; NP_001317427; NP_078843
	NP_001334555; NP_001334556; NP_796312
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

1 ta o'z ichiga olgan uy qutisi, shuningdek, nomi bilan tanilgan homeobox telomer bilan bog'laydigan oqsil 1 (HOT1), a oqsil odamlarda kodlanganligi HMBOX1 gen.^[5] HMBOX1 to'g'ridan-to'g'ri ikki qatorli takroriy ketma-ketlikka bog'lanadi telomerlar.^[6]^[7]

HMBOX1 dastlab telomeraza-musbat saraton hujayralari va ularning telomeralarini saqlab turadigan saraton hujayralarida telomerik xromatin bilan birikishi aniqlangan. Telomerlarning alternativ uzayishi (ALT) mexanizmi "teskari ChIP 'PICh texnikasi (Izolyatsiya qilingan xromatin segmentlarining proteomikasi).^[6] Keyinchalik, telomerik DNK bilan bevosita bog'lanish ko-kristall tuzilishi ning DNK bilan bog'lanish sohasi telomerik DNK bilan HMBOX1 ning.^[7] Funktsiyaning yo'qolishi va funktsiya ortishi tajribalari HMBOX1ni telomer uzunligining ijobiy regulyatori deb tasniflaydi.^[7]^[8] HMBOX1 dastlab transkripsiyaviy repressor sifatida tavsiflangan edi muxbir geni tahlillari,^[9] ammo genom-keng yondashuvlardan foydalanish RNK-seq va ChIP-seq hech bo'lmaganda bir nechta saraton hujayralari qatorida bunday ta'sirni ozgina ko'ring.^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000147421 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000021972 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Entrez Gen: Homeobox 1 ta o'z ichiga oladi".
^ ^a ^b Dejardin J, Kingston RE (yanvar 2009). "Maxsus genomik Loci bilan bog'liq oqsillarni tozalash". Hujayra. 136 (1): 175–86. doi:10.1016 / j.cell.2008.11.045. PMC 3395431. PMID 19135898.
^ ^a ^b ^v Kappei D, Butter F, Benda C, Scheibe M, Draškovic I, Stevense M, Novo CL, Basquin C, Araki M, Araki K, Krastev DB, Kittler R, Jessberger R, Londoño-Vallejo JA, Mann M, Buchholz F ( Iyun 2013). "HOT1 - bu sutemizuvchilarning to'g'ridan-to'g'ri telomer takroriy bog'lovchi oqsilidir, bu telomeraza yollashga yordam beradi". EMBO jurnali. 32 (12): 1681–701. doi:10.1038 / emboj.2013.105. PMC 3680732. PMID 23685356.
^ Chjou S, Xiao Y, Chjuan Y, Lyu Y, Chjao X, Yang X, Xie S, Chjou F, Chjou Y (2017 yil iyul). "1 tarkibidagi homeoboxni nokdaun qilish telomerlarni qisqartirish orqali bachadon bo'yni saraton hujayralarining radio sezgirligini oshiradi". Onkologik hisobotlar. 38 (1): 515–521. doi:10.3892 / yoki.2017.5707. PMID 28628186.
^ Chen S, Saiyin H, Zeng X, Xi J, Liu X, Li X, Yu L (2006). "Insonning HMBOX1 izolyatsiyasi va funktsional tahlili, transkripsiya qiluvchi repressor faolligi bilan oqsilni o'z ichiga olgan gomoboks". Sitogenetik va genom tadqiqotlari. 114 (2): 131–6. doi:10.1159/000093328. PMID 16825764. S2CID 21067536.
^ Jahn A, Rane G, Paszkovskiy-Rogacz M, Sayols S, Bluhm A, Xan CT, Draškovich I, Londo-Vallejo JA, Kumar AP, Buchholz F, Butter F, Kappei D (iyun 2017). "ZBTB48 - bu umurtqali telomer bilan bog'lovchi oqsil va transkripsiya faollashtiruvchisi". EMBO hisobotlari. 18 (6): 929–946. doi:10.15252 / embr.201744095. PMC 5452029. PMID 28500257.

Qo'shimcha o'qish

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 8 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000147421 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000021972 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: Homeobox 1 ta o'z ichiga oladi".

[Déjardin_2009-6] Dejardin J, Kingston RE (yanvar 2009). "Maxsus genomik Loci bilan bog'liq oqsillarni tozalash". Hujayra. 136 (1): 175–86. doi:10.1016 / j.cell.2008.11.045. PMC 3395431. PMID 19135898.

[Kappei_2013-7] v Kappei D, Butter F, Benda C, Scheibe M, Draškovic I, Stevense M, Novo CL, Basquin C, Araki M, Araki K, Krastev DB, Kittler R, Jessberger R, Londoño-Vallejo JA, Mann M, Buchholz F ( Iyun 2013). "HOT1 - bu sutemizuvchilarning to'g'ridan-to'g'ri telomer takroriy bog'lovchi oqsilidir, bu telomeraza yollashga yordam beradi". EMBO jurnali. 32 (12): 1681–701. doi:10.1038 / emboj.2013.105. PMC 3680732. PMID 23685356.

[8] Chjou S, Xiao Y, Chjuan Y, Lyu Y, Chjao X, Yang X, Xie S, Chjou F, Chjou Y (2017 yil iyul). "1 tarkibidagi homeoboxni nokdaun qilish telomerlarni qisqartirish orqali bachadon bo'yni saraton hujayralarining radio sezgirligini oshiradi". Onkologik hisobotlar. 38 (1): 515–521. doi:10.3892 / yoki.2017.5707. PMID 28628186.

[9] Chen S, Saiyin H, Zeng X, Xi J, Liu X, Li X, Yu L (2006). "Insonning HMBOX1 izolyatsiyasi va funktsional tahlili, transkripsiya qiluvchi repressor faolligi bilan oqsilni o'z ichiga olgan gomoboks". Sitogenetik va genom tadqiqotlari. 114 (2): 131–6. doi:10.1159/000093328. PMID 16825764. S2CID 21067536.

[10] Jahn A, Rane G, Paszkovskiy-Rogacz M, Sayols S, Bluhm A, Xan CT, Draškovich I, Londo-Vallejo JA, Kumar AP, Buchholz F, Butter F, Kappei D (iyun 2017). "ZBTB48 - bu umurtqali telomer bilan bog'lovchi oqsil va transkripsiya faollashtiruvchisi". EMBO hisobotlari. 18 (6): 929–946. doi:10.15252 / embr.201744095. PMC 5452029. PMID 28500257.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]