HNRPH1 - HNRPH1

HNRNPH1

Protein HNRPH1 PDB 1wez.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
2LXU

Identifikatorlar

HNRNPH1, HNRPH, HNRPH1, hnRNPH, heterojen yadro ribonukleoprotein H1 (H), heterojen yadro ribonukleoprotein H1

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 601035 MGI: 1891925 HomoloGene: 31318 Generkartalar: HNRNPH1

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 5 (odam)^[1]

Band	5q35.3	Boshlang	179,614,178 bp^[1]
Band	5q35.3	Oxiri	179,634,784 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 11 (sichqoncha)^[2]

Band	11 \| 11 B1.3	Boshlang	50,376,990 bp^[2]
Band	11 \| 11 B1.3	Oxiri	50,386,528 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• nuklein kislota bilan bog'lanish • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • RNK bilan bog'lanish • poli (U) RNK bilan bog'lanish
Uyali komponent	• katalitik 2-bosqich splitseozoma • splitseozoma kompleksi • membrana • nukleoplazma • sitozol • hujayra yadrosi
Biologik jarayon	• mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali • RNK qo'shilishini tartibga solish • mRNKni qayta ishlash • RNKni qayta ishlash • RNK qo'shilishi • fibroblast o'sish faktori retseptorlari signalizatsiya yo'li • RNK metabolik jarayoni
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


3187


59013


ENSG00000169045


ENSMUSG00000007850


P31943


O35737

RefSeq (mRNA)


NM_001257293 NM_005520 NM_001363572


NM_021510 NM_001347487

RefSeq (oqsil)

NP_001244222 NP_005511 NP_001350501 NP_001351154 NP_001351155
NP_001351156 NP_001351157 NP_001351158 NP_001351159 NP_001351160 NP_001351161 NP_001351162 NP_001351163 NP_001351164 NP_001351165 NP_001351166 NP_001351167 NP_001351168 NP_001351169 NP_001351170 NP_001351171 NP_001351172 NP_001351173 NP_001351174 NP_001351175 NP_001351176 NP_001351177 NP_001351179 NP_001351180 NP_001351181 NP_001351182 NP_001351183 NP_001351184

NP_001334416 NP_067485 NP_001349451 NP_001349452 NP_001349453
NP_001349454 NP_001349455 NP_001349456 NP_001349457 NP_001349458 NP_001349459 NP_001349461 NP_001349462 NP_001349463

Joylashuv (UCSC)

Chr 5: 179.61 - 179.63 Mb

Chr 11: 50.38 - 50.39 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Geterogen yadro ribonukleoprotein H a oqsil ^[5] odamlarda kodlanganligi HNRNPH1 gen.^[6]^[7]

Ushbu gen hamma joyda ifoda etilgan heterojen yadro ribonukleoproteidlari (hnRNPs) ning subfamilasiga tegishli. HnRNPlar RNKni bog'laydigan oqsillar bo'lib, ular heterojen yadro RNK (hnRNA) bilan murakkablashadi. Ushbu oqsillar yadroda mRNKgacha bo'lgan moddalar bilan bog'liq bo'lib, mRNKgacha qayta ishlashga va mRNK metabolizmi va transportining boshqa jihatlariga ta'sir qiladi. HnRNPlarning barchasi yadroda mavjud bo'lsa, ba'zilari yadro va sitoplazma o'rtasida moki kabi ko'rinadi. HnRNP oqsillari aniq nuklein kislotasini bog'lash xususiyatiga ega. Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil RNKlarga bog'langan uch marta takroriy kvazi-RRM domenlariga ega. Bu HNRPF oila a'zosiga juda o'xshaydi. Ushbu gen potentsial ravishda irsiy lenfedemaning I turi fenotipida ishtirok etishi mumkin deb o'ylashadi.^[7]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000169045 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000007850 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Penumutchu, Srinivasa; Chiu, Liang-Yuan; Meagher, Jennifer L.; Xansen, Aleksandar L.; Steki, Janna A.; Tolbert, Blanton S. (2018-08-18). "HnRNP H ning inter-qRRM bog'lovchisi tomonidan kodlangan differentsial konformatsion dinamikasi". Amerika Kimyo Jamiyati jurnali. 140 (37): 11661–11673. doi:10.1021 / jacs.8b05366. ISSN 0002-7863. PMC 6648666. PMID 30122033.
^ Honore B, Rasmussen HH, Vorum H, Dejgaard K, Lyu X, Gromov P, Madsen P, Gesser B, Tommerup N, Celis JE (Yanvar 1996). "H, H, H va bir xil bo'lmagan yadroli ribonukleoproteinlar - bu har xil xromosomalarni xaritalash genlari bilan kodlangan qarindosh, ammo alohida oqsillarning subfamilasining a'zolari". J Biol Chem. 270 (48): 28780–9. doi:10.1074 / jbc.270.48.28780. PMID 7499401.
^ ^a ^b "Entrez Gen: HNRPH1 heterojen yadro ribonukleoprotein H1 (H)".

Qo'shimcha o'qish

Rasmussen HH, van Damm J, Puype M va boshq. (1993). "Oddiy odam epidermal keratinotsitlarining ikki o'lchovli jel oqsillari ma'lumotlar bazasida qayd etilgan 145 oqsilning mikroskventsiyalari". Elektroforez. 13 (12): 960–9. doi:10.1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
Douson SJ, White LA (1992). "Gemofil afrofilus endokarditini siprofloksatsin bilan davolash". J. yuqtirgan. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Matunis MJ, Xing J, Dreyfuss G (1994). "HnRNP F oqsili: noyob birlamchi tuzilish, nuklein kislota bilan bog'lanish xususiyatlari va hujayra osti lokalizatsiyasi". Nuklein kislotalari rez. 22 (6): 1059–67. doi:10.1093 / nar / 22.6.1059. PMC 307930. PMID 7512260.
Gamberi C, Izaurralde E, Beisel C, Mattaj IW (1997). "Insonning yadro qopqog'ini bog'laydigan oqsil kompleksi va hnRNP F o'rtasidagi o'zaro ta'sir". Mol. Hujayra. Biol. 17 (5): 2587–97. doi:10.1128 / MCB.17.5.2587. PMC 232108. PMID 9111328.
Chou MY, Rooke N, Turck CW, Black DL (1999). "hnRNP H - bu neyronal hujayralardagi c-src alternativ ekzonini faollashtiradigan biriktiruvchi kuchaytiruvchi kompleksning tarkibiy qismi". Mol. Hujayra. Biol. 19 (1): 69–77. doi:10.1128 / MCB.19.1.69. PMC 83866. PMID 9858532.
Evans AL, Brice G, Sotirova V va boshq. (1999). "Birlamchi tug'ma limfedemani 5q35.3 mintaqasiga xaritalash". Am. J. Xum. Genet. 64 (2): 547–55. doi:10.1086/302248. PMC 1377764. PMID 9973292.
Honoré B, Vorum H, Baandrup U (1999). "hnRNPs H, H 'va F o'zlarini posttranslyatsion parchalanish va subcellular lokalizatsiyaga nisbatan boshqacha tutishadi". FEBS Lett. 456 (2): 274–80. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00911-4. PMID 10456323. S2CID 7617501.
Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA va boshq. (2000). "Polipirimidin traktining biriktiruvchi oqsilining o'ziga xos homologi tomonidan qo'zg'atilgan hnRNP kompleksini kooperativ yig'ish". Mol. Hujayra. Biol. 20 (20): 7463–79. doi:10.1128 / MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC 86300. PMID 11003644.
Andersen JS, Lion CE, Fox AH va boshqalar. (2002). "Inson yadrosi yo'naltirilgan proteomik tahlil". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR va boshq. (2002). "Uch o'lchovli strukturaviy tahlil uchun mos bo'lgan mahalliy splitseozomalarni tozalash va tavsiflash". RNK. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Angenstayn F, Evans AM, Settlage RE va boshq. (2002). "Aktivizatsiya qilingan C kinaz retseptorlari - bu neyronlarda poliA-mRNA bilan bog'langan xabarchi ribonukleoprotein komplekslarining bir qismidir". J. Neurosci. 22 (20): 8827–37. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-20-08827.2002. PMC 6757688. PMID 12388589.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Li J, Xokins IC, Harvi CD va boshq. (2003). "SRrp86 va uning o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillari tomonidan muqobil biriktirishni tartibga solish". Mol. Hujayra. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Honoré B, Baandrup U, Vorum H (2004). "F va H / H 'heterojen yadro ribonukleoproteinlari odatdagi va tanlangan saraton to'qimalarida differentsial ekspressionni namoyish etadi". Muddati Hujayra rez. 294 (1): 199–209. doi:10.1016 / j.yexcr.2003.11.011. PMID 14980514.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB va boshq. (2004). "Immobilizatsiyalangan metallga o'xshashlik xromatografiyasi va tandem mass-spektrometriyasi yordamida odamning T hujayralaridan tirozin fosforillanish joylarini mustahkam fosfoproteomik profillash". Anal. Kimyoviy. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Shvarts D va boshq. (2004). "HeLa hujayra yadroviy fosfoproteidlarining keng ko'lamdagi tavsifi". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Smit FD, Stark C va boshq. (2004). "Sitoskeletal regulyatsiya va uyali aloqada ishtirok etuvchi in vivo 14-3-3 majburiy oqsillarni proteomik, funktsional va domenga asoslangan tahlil qilish". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). "WW tarkibidagi domen tarkibidagi oqsillar erta splitseozoma bilan o'zaro ta'sir qiladi va in Vivo jonli ravishda mRNA qo'shilishida ishtirok etadi". Mol. Hujayra. Biol. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.

PDB galereyasi
1wez: Heterogen bo'lmagan yadro ribonukleoproteididagi RRM domenining eritma tuzilishi H ' 1wg5: Heterogen bo'lmagan yadro ribonukleoproteididagi birinchi RRM domenining eritma tuzilishi

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 5 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.