Iodatsetamid - Iodoacetamide

Iodatsetamid
Skelet formulasi
Joyni to'ldirish modeli
Ismlar
IUPAC nomi afzal
2-yodosetamid
Identifikatorlar
3D model (JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
ECHA ma'lumot kartasi100.005.119 Buni Vikidatada tahrirlash
EC raqami
  • 205-630-1
RTECS raqami
  • AC4200000
UNII
Xususiyatlari
C2H4MenNO
Molyar massa184.964 g · mol−1
Tashqi ko'rinishioq kristallar (sariq rang yod borligini bildiradi)
Erish nuqtasi 94 ° C (201 ° F; 367 K)
Xavf
Xavfsizlik ma'lumotlari varaqasiMSDS 1, MSDS 2
NFPA 704 (olov olmos)
Boshqacha ko'rsatilmagan hollar bundan mustasno, ulardagi materiallar uchun ma'lumotlar keltirilgan standart holat (25 ° C [77 ° F], 100 kPa da).
tekshirishY tasdiqlang (nima bu tekshirishY☒N ?)
Infobox ma'lumotnomalari

2-yodosetamid bu alkillash agenti uchun ishlatilgan peptid xaritalash maqsadlari. Uning harakatlari xuddi shunga o'xshash yodoatsetat. Odatda kovalent ravishda bog'lash uchun ishlatiladi tiol guruhi sistein shuning uchun oqsil hosil bo'lmaydi disulfid birikmalari.[1][2] Shuningdek, ishlatilgan hamma joyda ning inhibitori sifatida o'rganadi deubikuitinaza fermentlari (DUB), chunki u DUB faol uchastkasidagi sistein qoldiqlarini alkillashtiradi.

Peptidaza inhibitori

Yodoatsetamid barcha sistein peptidazalarning qaytarilmas inhibitori bo'lib, inhibisyon mexanizmi katalitik sistein qoldig'ining alkillanishidan kelib chiqadi (sxemaga qarang). Yodatsetamid kislota hosilasi bilan taqqoslaganda ancha tezroq reaksiyaga kirishadi. Ushbu kuzatuv standart kimyoviy reaktivlikka qarama-qarshi bo'lib ko'rinadi, ammo katalitik gistidinning musbat imidazolium ioni va yodoatsetatning salbiy zaryadlangan karboksil-guruhi o'rtasida o'zaro ta'sirning mavjudligi yodoatsetamidning nisbiy faolligining oshishiga sabab bo'ladi.[3]

Sistein peptidazalarini yodoatsetamid bilan qaytarib bo'lmaydigan inhibisyon mexanizmi.

Proteinli mass-spektrometriya

Odatda de novo (peptid) sekanslash uchun namuna tayyorlash paytida foydalaniladi oqsil massasi spektrometriyasi, ammo so'nggi tanqidchilar undan foydalanishdan qochishni taklif qilishmoqda [4]

Adabiyotlar

  1. ^ Smit The CV (1936). "Yodoatsetat va yodoatsetamidning turli xil sulfidril guruhlari bilan, Urease va xamirturush preparatlari bilan reaktsiyalari". J. Biol. Kimyoviy. 114 (3): 601–12.
  2. ^ Anson ML (1940). "Yod va yodatsetamidning mahalliy tuxum albuminlari bilan reaktsiyalari". J. Gen. Fiziol. 23 (3): 321–31. doi:10.1085 / jgp.23.3.321. PMC  2237930. PMID  19873158.
  3. ^ Polgar, L (1979). "Deuterium izotoplarining papain asilatsiyasiga ta'siri. Umumiy asos katalizining etishmasligi va fermentlarni qoldiruvchi guruh uchun dalillar. O'zaro ta'sir". Yevro. J. Biokimyo. 98 (2): 369–374. doi:10.1111 / j.1432-1033.1979.tb13196.x. PMID  488108.
  4. ^ Myuller (2017). "Proteinlarni kamaytirish va alkilatsiyani tizimli ravishda baholash yodli reaktivlar tomonidan o'ziga xos bo'lmagan nojo'ya ta'sirlarni ochib beradi". Molekulyar va uyali proteomika. 16 (7): 1173–1187. doi:10.1074 / mcp.M116.064048. PMC  5500753. PMID  28539326.

Tashqi havolalar

  • The MEROPS peptidazalar va ularning inhibitorlari uchun onlayn ma'lumotlar bazasi: [1]