Xose V. Lopez - Jose V. Lopez

Xose V. Lopez
Jo Galway.png
MukofotlarHalmos kollejining yilning eng yaxshi professori
Ilmiy ma'lumot
Olma materGeorgia Tech
Florida shtati universiteti
Jorj Meyson universiteti
Tezis (1995)
Doktor doktoriStiven J. O'Brayen
Ta'sirCharlz Darvin, Alan Uotts, Genri Devid Toro /Valden, Lin Margulis, Benjamin Franklin
O'quv ishlari
InstitutlarSmitson instituti
Liman filiali Okeanografiya instituti
Asosiy manfaatlarevolyutsiya, genomika, simbioz, sistematik mikrobiologiya,
Taniqli ishlarYadro mitoxondrial transpozitsiyasi, mushuk mitoxondriyal genomining ketma-ketligi, molekulyar genetikasi Orbicella qardosh turlar, dengiz shimgichi genetikasi, GIGA, mikrobiomlar
Taniqli g'oyalarmitoxondrial DNKning transpozitsiyasi

Xose V. Lopez amerikalik filippinlik molekulyar biolog. U biologiya fakulteti va professori bo'lgan Nova janubi-sharqiy universiteti (NSU).[1] 2007 yildan beri Dania Beach FL-da.

Uning doktorlik dissertatsiyasi mitoxondriyal DNKning mushuklarning yadrosiga transpozitsiyasini tavsiflash va NUMT (yadro mitoxondriyal DNKlari) umumiy evolyutsion genomika hodisasi sifatida.[2] Keyingi ishlar molekulyar genetikani simbiyoz va dengiz biologiyasi tadqiqotlariga (masalan, mercan va gubkalar) qo'llashni o'z ichiga oladi. Lopez, shuningdek, Global Umurtqasizlar Genomikasi Ittifoqi (GIGA) olimlarining hammuassisi sifatida tanilgan,[3] Porifera hayot daraxti va Yerdagi mikrobioma loyihalarida ishtirok etish va potentsial yerdan tashqari mezokosm simulyatsiyasi, modellashtirish va kolonizatsiya qilish uchun simbiozning mikrobiologik tushunchalari to'g'risida xabardorligini oshirish.[4]

Karyera

Lopez Jorjiya Texnologiya Institutida bakalavr darajasini oldi. Keyinchalik u Florida shtati universitetida molekulyar biologiyaga yo'naltirilgan magistrlik ilmiy darajasini oldi (ostida J. Herbert Teylor; sobiq va vafot etgan Milliy Fanlar Akademiyasi Ro'yxatdan) va uning Fairfax VA-dagi Jorj Meyson Universitetida atrof-muhit biologiyasi va jamoat siyosati bo'yicha doktorlik dissertatsiyasi mitokondriyal DNK evolyutsiyasini va uning hujayrali yadrolarga o'tishini o'rganadi (")NUMT Frederik MDda Stiven J. O'Brayen (hozirgi Milliy Fanlar Akademiyasining a'zosi) ostida Milliy Saraton Instituti Genomika xilma-xilligi laboratoriyasida mushuklarning yadro genomlarida. Doktor Lopes keyinchalik doktor bilan postduktoral tayinlashda o'zining molekulyar evolyutsion mashg'ulotlarini o'tkazdi. Nensi Noulton (hozirgi Milliy Fanlar akademiyasining a'zosi) Orbicella (avval Montastraeya) halqasimon marjon aka-ukalar turlarining kompleksi Smithsonian tropik tadqiqot instituti Panamada va doktor Shirli Pomponi bilan dengiz shimgichi genetikasi Liman filiali Okeanografiya instituti Fort Pirsda, FL Ikkinchisi unga chuqur dengiz shimgichlari va mercanlarini tekshirish uchun Jonson Sea-Link suvosti texnologiyasidan foydalanishga imkon berdi. Lopezning dengiz shimgichlari bo'yicha tadqiqotlari Janubiy Florida shtatidagi PBS hujjatli filmida "Gubkalar: ular dengizdagi eng keksa hayvonmi?" ChangingSeas TV-da.[5] NDUning Halmos Tabiatshunoslik va Okeanografiya kollejida bo'lganida, uning laboratoriyasi genomika vositalarini dengiz umurtqasiz-mikroblarga oid turli xil savollarga javob berish uchun qo'llagan. simbiyoz,[6] mikrobioma ekologiyasi,[7][8] yog 'ta'sirida bo'lgan organizmlarning genomikasi, sud tibbiyoti, metagenomikasi, konservatsiya genomikasi[9] va sistematikasi / filogenetikasi. Professor Lopes Deepwater Horizon neft to'kilganidan keyin Meksika ko'rfazidagi oziq-ovqat tarmoqlari va pelagik mikroblarning tarqalishini yaxshiroq tushunish uchun Meksika ko'rfazidagi Deep Pelagic Nekton Dynamics (DEEPEND) konsortsiumining bir qismidir. Lopez muharriri sifatida ishlagan Irsiyat jurnali 2008 yildan beri. 2018 yilda u NDU Prezidentining "Muhtaram professor" mukofotiga sazovor bo'ldi. Lopezning izlanishlari davomida doimiy ravishda paydo bo'ladigan ikkita asosiy mavzu simbioz va biologik xilma-xillik bir necha darajalarda.

Global umurtqasizlar genomikasi alyansi (GIGA)

Professor Lopez hamkorlik qilish qobiliyatiga ega va shuning uchun GIGA tashkil topishi tabiiy rivojlanishni ta'minladi. GIGA missiyasi dengiz va suv umurtqasiz hayvonlar genomikasi bo'yicha tadqiqot va o'quvchilarni tayyorlashga ko'maklashishdan iborat.[10] Genetika mutaxassisi bilan dastlabki maslahatlashgandan so'ng Stiven J. O'Brayen Va Genomes10K birinchi genomini tartiblashtirish loyihasining muvaffaqiyatini ko'rib, Lopez 2013 yilda GIGA tashkil etishga o'tdi.[11] Bu asosan kontseptsiyani qo'llab-quvvatlaydigan umurtqasizlar biologlarining katta va xilma-xil jamoasiga murojaat qilishni o'z ichiga oladi. Keyin qizlarning ustaxonasini moliyalashtirishga ko'mak ko'rsatildi Amerika Genetika Assotsiatsiyasi. GIGA asosan suvda yashovchi hayvonlarga e'tibor qaratadi, ammo shunga o'xshash muammolar (nisbatan qiyin, kichik individual hayvonlar, sekvensiya uchun kam DNK), katta umurtqasizlar konsorsiumi, Insect5K (i5K) bilan bog'liq.[12] Endi GIGA va i5K Earth BioGenome Project (EBP) doirasida "tarmoqlar tarmog'ini" o'z ichiga oladi.[13] 2018 yil dekabrida er yuzidagi ko'p hujayrali bioxilma-xillikning asosiy qismi bo'lgan 1,5 million eukaryotlarning barcha genomlarini sinab ko'rish va ketma-ketligini ta'minlash uchun ishga tushirildi. Endi GIGA 2020 yilda notijorat tashkilot sifatida ro'yxatdan o'tish uchun yangi ofitserlarni sayladi. Lopez GIGA ning birinchi prezidenti sifatida ishlaydi.

Gubkalar, mikrobial simbionlar va mikroblar jamoalari

Dengiz shimgichlarini o'rganish bilvosita dengiz mikroblariga olib keldi, chunki Lopez mikrobiologiya bo'yicha rasmiy ma'lumotga ega bo'lmagan. Gubka biologiyasi turli xil ilmiy nuqtai nazardan hayratlanarli edi: mikroblar eng qadimgi tirik organizmlar, gubkalar metazo evolyutsion daraxtidagi eng qadimgi guruhlardan birini anglatadi; gubkalar filimdan ajratilgan ko'plab tabiiy mahsulotlarning asl manbai bo'lishi mumkin bo'lgan turli xil mikrobial simbionlarni o'z ichiga oladi. Keyingi jihat keyingi yillarda bir nechta boshqa ekotizimlar va xost modellariga kengaygan tabiiy mikroblar jamoalariga ("mikrobiomlar") qiziqish uyg'otdi.

Taniqli simbiozdan tashqari,[14] Lopes dastlab gubka mikrobiomalari yaqin atrofdagi dengiz suvi muhitida jamoalar uchun indikator bo'lib xizmat qilishi mumkin, deb taxmin qildi, chunki gubkalar filtrli oziqlantiruvchi moddalardir. Keyinchalik bu gipoteza qisman to'g'ri ekanligi isbotlandi (gubkalarning yuqori va past mikrobial tasnifiga qarang - HMA, LMA), chunki o'sib borayotgan dalillar shuni ko'rsatadiki, ko'plab shimgich turlari o'zlarining moslashtirilgan simbionlarini olib yurishadi. Shunga qaramay, Lopez rRNK asosidagi bakteriyalar sistematikasining Vuez inqilobidan kelib chiqqan yangi rivojlanayotgan madaniyatga bog'liq bo'lmagan molekulyar vositalarni qo'lladi.[15] Oxir-oqibat molekulyar asoslangan identifikatsiyalash mahalliy dengiz ekotizimlariga suv sifatini bashorat qiluvchi vositalar sifatida kengaytirildi, inson terisi mikrobiomalari mumkin bo'lgan sud-tibbiyot vositalari, uzoq umr ko'rishga potentsial mikrobiom ta'sirini tekshirish uchun Myotis yarasalari najasi va Florida shtatidagi Okeechobee ko'li suv havzasi.

Hayot

Lopezning ota-onasi Filippin universiteti birinchi bo'lib Binghamtonda Nyu-Yorkda uchrashgan bitiruvchilar, klinik patolog Ernesto G. va Rosario Lopez.[16] U Emi Doyl (Plantation FL) ga uylangan.[iqtibos kerak ]

Adabiyotlar

  1. ^ "NDU huzuridagi Halmos tabiiy fanlar va okeanografiya kolleji". cnso.nova.edu. Olingan 2019-03-01.
  2. ^ Lopez, J. V .; Yuxki, N .; Masuda, R .; Modi, V.; O'Brayen, S. J. (1994). "Numt, yaqinda mitokondriyal DNKning uy mushukining yadro genomiga o'tkazilishi va tandem bilan kuchaytirilishi". Molekulyar evolyutsiya jurnali. 39 (2): 174–90. doi:10.1007 / BF00163806 (harakatsiz 2020-09-10). PMID  7932781.CS1 maint: DOI 2020 yil sentyabr holatiga ko'ra faol emas (havola)
  3. ^ GIGA olimlar hamjamiyati; Braken-Grissom, X.; Kollinz, A. G.; Kollinz T .; Crandall, K .; Distel, D .; Dann, C .; Giribet, G .; Haddok, S .; Nellton, N .; Martindeyl, M.; Medina M.; Messing, C .; O'Brayen, S. J .; Polay, G.; Putnam, N .; Ravasi, T .; Ruz, G. V .; Rayan, J. F .; Shulze, A .; Vorheide, G.; Adamska, M .; Bailli, X .; Breinholt, J .; Braun, V. E.; Diaz, M. C .; Evans, N .; Flot, J. F .; Fogarti, N .; va boshq. (2014). "Umurtqasizlarning genomikasi bo'yicha global alyans (GIGA): umurtqasizlarning turli xil genomlarini o'rganish uchun jamoaviy resurslarni rivojlantirish". Irsiyat jurnali. 105 (1): 1–18. doi:10.1093 / jhered / est084. PMC  4072906. PMID  24336862.
  4. ^ Lopez, Xose V; Peixoto, Rakuel S; Rosado, Aleksandr S (22 avgust 2019). "Muqarrar kelajak: birinchi navbatda Yerdan tashqarida mikroblar bilan kosmik kolonizatsiya". FEMS Mikrobiologiya Ekologiyasi. 95 (10). doi:10.1093 / femsec / fiz127. PMC  6748721. PMID  31437273.
  5. ^ "ChangingSeas.TV Gubkali hujjatli film (801-qism)". www.changingseas.tv/.
  6. ^ Tomas, Torsten (2016). "Global shimgichni mikrobiomi: bazaz metazoan filimidan olingan simbioz haqidagi tushunchalar". Tabiat aloqalari. 7 (11870): 11870. doi:10.1038 / ncomms11870. PMC  4912640. PMID  27306690.
  7. ^ Kempbell, Aleksandra; Flerizer, Jey; Sinigalliano, Kristofer; Oq, Jeyms; Lopez, Xose (2015). "Janubi-Sharqiy Florida shtatining qirg'oq bo'yidagi suv sathilaridagi suv sathidagi bakterial hamjamiyatning xilma-xilligi dinamikasi". Mikrobiologiya Ochiq. 4 (3): 390–408. doi:10.1002 / mbo3.245. PMC  4475383. PMID  25740409.
  8. ^ O'Konnel, Loren; Gao, qo'shiq; Flerizer, Jey; Lopez, Xose (2018). "DNKning yuqori o'tkazuvchanligi ketma-ketligini qo'llagan holda Everglades kirish mikrobiomasining nozik taneli kompozitsion tahlili". PeerJ. 6: e4671. doi:10.7717 / peerj.4671. PMC  5947159. PMID  29761039.
  9. ^ Lopez, Xose; Kamel, Bishoy; Medina, Monika; Kollinz, Timoti; Baums, Illiana (2019). "Dengiz umurtqasiz hayvonlarni saqlash genomikasining ko'p qirralari. Hayvonlarning biologik fanlarini yillik sharhi". Hayvonlarning biologik fanlarini yillik sharhi. 7: 473–497. doi:10.1146 / annurev-animal-020518-115034. PMID  30485758.
  10. ^ GIGA olimlar hamjamiyati; Braken-Grissom, X.; Kollinz, A. G.; Kollinz T .; Crandall, K .; Distel, D .; Dann, C .; Giribet, G .; Haddok, S .; Nellton, N .; Martindeyl, M .; Medina M.; Messing, C .; O'Brayen, S. J .; Polay, G.; Putnam, N .; Ravasi, T .; Ruz, G. V .; Rayan, J. F .; Shulze, A .; Vorheide, G.; Adamska, M .; Bailli, X .; Breinholt, J .; Braun, V. E.; Diaz, M. C .; Evans, N .; Flot, J. F .; Fogarti, N .; va boshq. (2014). "Umurtqasizlarning genomikasi bo'yicha global alyans (GIGA): umurtqasizlarning turli xil genomlarini o'rganish uchun jamoaviy resurslarni rivojlantirish". Irsiyat jurnali. 105 (1): 1–18. doi:10.1093 / jhered / est084. PMC  4072906. PMID  24336862.
  11. ^ Koepfli, Klaus-Piter; Paten, Benedikt; Genom 10K Olimlar Jamiyati (2015). "Genom 10K loyihasi: oldinga siljish". Annu. Rev. Anim. Biosci. 3 (5): 57–111. doi:10.1146 / annurev-animal-090414-014900. PMC  5837290. PMID  25689317.
  12. ^ i5K konsortsiumi. (2013). "I5K tashabbusi: bilim, inson salomatligi, qishloq xo'jaligi va atrof-muhit uchun artropod genomikasini rivojlantirish". Irsiyat jurnali. 104 (5): 595–600. doi:10.1093 / jhered / est050. PMC  4046820. PMID  23940263. Olingan 20 oktyabr 2019.
  13. ^ Levin, Xarris; Robinson, Gen; Kress, Jon; Beyker, Uilyam (2018). "Earth BioGenome loyihasi: hayotning kelajagi uchun hayotni tartiblashtirish". Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 115 (17): 4325–4333. doi:10.1073 / pnas.1720115115. PMC  5924910. PMID  29686065.
  14. ^ Wilkinson, Clive (1987). "Gubka evolyutsiyasi va ekologiyasida mikrobial simbiontlarning ahamiyati". Simbiyoz.
  15. ^ Pace, Norm (1997). "Mikroblarning xilma-xilligi va biosferaning molekulyar ko'rinishi". Ilm-fan. 276 (5313): 734–740. doi:10.1126 / science.276.5313.734. PMID  9115194.
  16. ^ Nensi Uiltsi (1961 yil 24 sentyabr). "Qvedding-Lopez to'yida Filippin urf-odatlari amal qilindi". Binghamton Sun-byulleteni.

Tashqi havolalar

  • Global umurtqasizlar genomikasi alyansi - GIGA [1]
  • DEEPEND konsortsiumi [2]
  • Porifera hayot daraxti loyihasi [3]
  • Boshqa nashrlar [4]
  • Nashr qilinmagan insholar [5]