Kupe virusi - Kupe virus

Orthonairovirus
Viruslarning tasnifi e
(ochilmagan):Virus
Shohlik:Riboviriya
Qirollik:Orthornavirae
Filum:Negarnavirikota
Sinf:Ellioviritsetalar
Buyurtma:Bunyavirales
Oila:Nairoviridae
Tur:Orthonairovirus
Kuchlanish

Kupe virusi

Kupe virusi jinsdagi virus Orthonairovirus, buyurtma Bunyavirales.

Taksonomiya

Ganjam virusi Nayrobi qo'y kasalligi serogrupida joylashgan.

Tarix

Virus birlashtirilgan holda ajratilgan Shomil (Amblyomma gemma va Rhipicephalus pulchellus ) mol terisidan yig'ilgan Nayrobi, Keniya, 1999 yil oktyabrda.[1] "Kupe" so'zi Kisvaxili Shomil uchun.

Genom

Genom salbiy qismli RNKning uchta bo'lagidan iborat - kichik (S), o'rta (M0 va katta (L)).

L segmenti RNK 12,330 ga teng nukleotidlar (nt) uzunlikda va 4050 aminokislotadan iborat bitta ochiq o'qish doirasini (ORF) kodlaydi. Kodlamaydigan mintaqalar mavjud: 5 n mintaqasi 40 nt va 3 ′ viloyati 137 nt. Ushbu ochiq o'qish doirasi bir nechta modullarni kodlaydi, shu jumladan RNKga bog'liq RNK polimeraza. Ehtimol, bu tarjimadan keyin bir nechta oqsillarga bo'linib ketgan, ammo bu hali ko'rsatilmagan.

M segmenti RNKning uzunligi 4818 nukleotid bo'lib, uning tarkibida 47 va 121 nukleotidlardan iborat 5 ′ va 3 c kodlanmagan mintaqalar yonma-yon joylashgan bitta ochiq o'qish doirasi mavjud. ORF 1549 ta aminokislotadan iborat oqsilni 8 ta potentsial joy bilan N ga bog'langan glikosilatsiya uchun kodlaydi. U Gn va Gc glikoprotein mintaqalarida navbati bilan 612 va 1514 aminokislotalarida noyob potentsial N-gly saytini o'z ichiga oladi.

S segmentida 1,694 nt bor va 483 aminokislotadan iborat ORFni kodlaydi. Kodlashsiz 5 ′ va 3 regions mintaqalar navbati bilan 49 nt va 193 nt.

Adabiyotlar

  1. ^ Sang R, Onyango C, Gachoya J, Mabinda E, Konongoi S, Ofula V, Dunster L, Okoth F, Coldren R, Tesh R, da Rossa AT, Finkbeiner S, Wang D, Crabtree M, Miller B (2006) Tickborne arbovirus bozordagi chorvachilikda kuzatuv, Nayrobi, Keniya. Rivojlanayotgan yuqumli kasalliklar. 2006 yil Iyul; 12 (7): 1074-1080