L tipidagi lektin domeni - L-type lectin domain

Lectin_leg kabi
PDB 1r1z EBI.jpg
glikoproteinlarni saralash retseptorlari p58 / ergic-53 ning uglevodlarni tanib olish sohasining kristalli tuzilishi yangi metalning bog'lanish joyini va kaltsiy ionining birikishi bilan bog'liq konformatsion o'zgarishlarni ochib beradi.
Identifikatorlar
BelgilarLectin_leg kabi
PfamPF03388
Pfam klanCL0004
InterProIPR005052
SCOP21gv9 / QOIDA / SUPFAM
Membranom719

Molekulyar biologiyada L ga o'xshash lektin domeni a protein domeni ichida topilgan ma'ruzalar ga o'xshash bo'lganlar dukkakli o‘simliklar lektinlari.

Lektinlar tuzilishi jihatidan xilma-xildir oqsillar bu bog'lash aniq uglevodlar. Bu oilaga quyidagilar kiradi VIP36 va ERGIC-53 ma'ruzalar.[1] Ushbu domenni o'z ichiga olgan oqsillar dastlab hayvon lektinlari oilasi sifatida aniqlangan bo'lsa-da, ular ham mavjud xamirturush vakillar.[1]

ERGIC-53 - bu 53kDa oqsil bo'lib, ular orasidagi oraliq mintaqaga joylashtirilgan endoplazmatik to'r va Golgi apparati (ER-Golgi-oraliq bo'lim, ERGIC). Bu aniqlandi kaltsiy - mustaqil, mannoz - maxsus ma'ruza.[2] Uning disfunktsiya birlashtirilgan bilan bog'langan omillar V va VIII etishmovchiligi, ERGIC-53 uchun muhim va substratga xos rolni taklif qiladi glikoprotein - yashirin yo'l.[2][3]

L ga o'xshash lektin domeni a dan tashkil topgan umumiy sharsimon shaklga ega beta-sendvich ikki katta burmalangan antiparallel beta-varaqlar. Beta-sendvich asosiy tarkibni o'z ichiga oladi konkav beta-varaq va voyaga etmagan qavariq beta-varaq, ning o'zgarishi bilan jele rulonli burma.[4][5][6][7]

Adabiyotlar

  1. ^ a b Fidler K, Simons K (1994 yil iyun). "Dukkakli lektinlarga homolog bo'lgan sekretor yo'lda hayvonlar lektinlarining taxminiy yangi klassi". Hujayra. 77 (5): 625–6. doi:10.1016/0092-8674(94)90047-7. PMID  8205612. S2CID  21111364.
  2. ^ a b Itin C, Roche AC, Monsigny M, Hauri HP (mart 1996). "ERGIC-53 - bu dukkakli lektinlarning funktsional mannoz-selektiv va kaltsiyga bog'liq inson homologi". Mol. Biol. Hujayra. 7 (3): 483–93. doi:10.1091 / mbc.7.3.483. PMC  275899. PMID  8868475.
  3. ^ Nichols WC, Terry VH, Wheatley MA, Yang A, Zivelin A, Ciavarella N, Stefanile C, Matsushita T, Saito H, de Bosch NB, Ruiz-Saez A, Torres A, Tompson AR, Feinstein DI, White GC, Negrier C , Vinciguerra C, Aktan M, Kaufman RJ, Ginsburg D, Seligsohn U (aprel 1999). "ERGIC-53 gen tuzilishi va mutatsiyani tahlil qilish 19 ta V va VIII omillarning etishmasligi oilalarida". Qon. 93 (7): 2261–6. PMID  10090935.
  4. ^ Velloso LM, Svensson K, Shneyder G, Pettersson RF, Lindqvist Y (may 2002). "Endoplazmik retikulumdan glikoprotein eksporti bilan shug'ullanadigan oqsil - p58 / ERGIC-53 uglevodlarni tanib olish sohasining kristalli tuzilishi". J. Biol. Kimyoviy. 277 (18): 15979–84. doi:10.1074 / jbc.M112098200. PMID  11850423.
  5. ^ Velloso LM, Svensson K, Pettersson RF, Lindqvist Y (2003 yil dekabr). "P58 / ERGIC-53 glikoproteinlarni saralash retseptorlari uglevodlarni tanib olish sohasining kristalli tuzilishi oldindan taxmin qilinmagan metall bilan bog'lanish joyini va kaltsiy ionlari bilan bog'lanish bilan bog'liq konformatsion o'zgarishlarni ochib beradi". J. Mol. Biol. 334 (5): 845–51. doi:10.1016 / j.jmb.2003.10.031. PMID  14643651.
  6. ^ Satoh T, Sato K, Kanoh A, Yamashita K, Yamada Y, Igarashi N, Kato R, Nakano A, Vakatsuki S (2006 yil aprel). "Emp46p va Emp47p ga bog'liq bo'lgan mustaqil Ca2 + yuk retseptorlari uglevodlarni tanib olish sohasining tuzilmalari". J. Biol. Kimyoviy. 281 (15): 10410–9. doi:10.1074 / jbc.M512258200. PMID  16439369.
  7. ^ Satoh T, Cowieson NP, Hakamata V, Ideo H, Fukushima K, Kurihara M, Kato R, Yamashita K, Wakatsuki S (sentyabr 2007). "VIP36 sutemizuvchilar transport vositasi tomonidan yuqori mannozli glikoproteinlarni tanib olishning tarkibiy asoslari" (PDF). J. Biol. Kimyoviy. 282 (38): 28246–55. doi:10.1074 / jbc.M703064200. PMID  17652092. S2CID  33042130.
Ushbu maqola jamoat domenidagi matnlarni o'z ichiga oladi Pfam va InterPro: IPR005052