Dukkaklilar haqida ma'lumot tizimi - Legume Information System

The Dukkaklilar haqida ma'lumot tizimi (LIS), tomonidan tashkil etilgan va qo'llab-quvvatlanadigan dukkakli ekinlar selektsionerlari va tadqiqotchilari uchun dukkakli ekinlar portali Qishloq xo'jaligi tadqiqotlari xizmati ning Amerika Qo'shma Shtatlari Qishloq xo'jaligi vazirligi. Dukkakli o'simliklar tizimining vazifasi "dukkakli ekinlarda kashfiyotlar va ekinlarni yaxshilashga ko'maklashish", xususan, ekinlarning hosildorligini, ularning ozuqaviy qiymatini yaxshilash va dukkakli ekinlar haqidagi asosiy bilimlarimizni yaxshilashdan iborat.

Dukkakli ma'lumot tizimini rivojlantirish - bu qo'shma korxona Genom manbalari bo'yicha milliy markaz (NCGR) va USDA-ARS da Ayova shtati universiteti. 2014 yilda LIS-ni rivojlantirish bo'yicha harakatlar Comparative-legumes.org domeniga o'tdi legumeinfo.org. Qiyosiy dukkaklilar sayti Ruby on Rails ramkasidan foydalangan holda, LegumeInfo sayti esa Tripal tarkibni boshqarish tizimi.

Etim turlarini tadqiq qilish uchun asos sifatida mos yozuvlar turlari

LISda qabul qilingan fundamental yondoshish mos yozuvlar turlari uchun ishlab chiqilgan kengroq bilimlardan foydalanib, etim turlarni tadqiq qilishni osonlashtiradi. Masalan, mahalliy va mahalliy o'xshashlikdan foydalanish xususiyatlarni xulosalash uchun asos yaratadi.

Malumot turlari

LIS-dan foydalanganligini unutmang UniProt organizm mnemonikasi iloji boricha turlarni aniqlash uchun.

Hozirgi dukkakli ekinlar mos yozuvlar turlari (shuningdek, model organizmlar ) quyidagilar:

• Glycine max (soya), GLYMA
• Lotus japonicus (lotus), LOTJA
• Medicago trunkatula (barrel barrel), MEDTR
• Phaseolus vulgaris (oddiy loviya), PHAVU

Etim turlari

LISda namoyish etilgan etim turlari:

• Arachis duranensis (yovvoyi eman), ARADU
• Arachis ipaensis (yovvoyi eman), ARAIP
• Arachis hypogaea (yeryong'oq), ARAHY
• Cajanus cajan (kabutar no'xat), CAJCA
• Chamaecrista fasciculata (no'xat) CHAFS
• Cicer arietinum (nohut), CICAR
• Lens culinaris (yasmiq), LENCU
• Lupinus albus (oq lupin), LUPAL
• Lupinus angustifolius (tor bargli lupin), LUPAN
• Medicago sativa (beda), MEDSA
• Pisum sativum (bog 'no'xati), PISSA
• Trifolium pratense (qizil yonca), TRIPR
• Trifolium repenslari (oq yonca), TRIRE
• Vicia faba (faba loviya), VICFA
• Vigna angularis (adzuki loviya), VIGAN
• Vigna unguiculata (sigir), VIGUN

Shuningdek qarang

• Dukkaklilar
• Impulslar

Tashqi havolalar

• Bosh sahifa dukkakli ma'lumot tizimi uchun.
• Gonsales, tibbiyot xodimi; Gajendran, K; Farmer, AD; Archuleta, E; Beavis, WD (2007). "Dukkakli o'simliklar uchun ma'lumot tizimidan foydalanib, soya fasulyesi to'satdan o'lish sindromi uchun nomzod genlarini topish uchun dukkakli o'simliklar ma'lumotidan foydalanish". Molekulyar biologiya usullari. 406: 245–59. PMID  18287696.
• Gonsales, M. D .; Archuleta, E; Fermer, A; Gajendran, K; Grant, D; Poyafzal, R; Beavis, WD; Vo, ME (2004). "Dukkakli o'simliklar tizimi (LIS): dukkakli o'simliklar biologiyasi uchun integral axborot resursi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 33 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D660-5. doi:10.1093 / nar / gki128. PMC  540082. PMID  15608283.
• Dash, S .; Kempbell, JD .; Cannon, E.K.S .; Kliari, AM; Xuang, V.; Kalberer, S.R .; Karingula, V .; Rays, A.G .; Singx, J .; Umale, P.E .; Hafta, N.T .; Uilki, A.P .; Fermer, A.D .; Kannon, S.B. (2016). Dukkaklilar uchun ma'lumot tizimi (LegumeInfo.org): dukkaklilar oilasi uchun federatsiya qilingan ma'lumotlar manbalari to'plamining asosiy komponenti Nuklein kislotalarni tadqiq qilish 44 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D1181-D1188. doi: 10.1093 / nar / gkv1159 PMC4702835