MUBII-TB-JB - MUBII-TB-DB

MUBII-TB-JB
Tarkib
TavsifSilga qarshi antibiotiklarga chidamlilik genlarini hujjatlashtiradigan va kuzatadigan ma'lumotlar bazasi.
Ma'lumot turlari
qo'lga olindi		Silga qarshi antibiotiklarga chidamlilik genlari
OrganizmlarBakteriyalar
Aloqa
Birlamchi iqtibosPMID  24731071
Kirish
Veb-saytumr5558-bibiserv.univ-lyon1.fr/ mubii/ mubii-ni tanlang.cgi.
Turli xil
Xatcho'plar
sub'ektlar		ha

MUBII-TB-JB a ma'lumotlar bazasi bu yo'naltirilgan sil kasalligi antibiotiklarga qarshilik genlar.[1] Bu yuqori darajada tuzilgan, matnga asoslangan ma'lumotlar bazasi e'tiborini qaratish Mikobakteriya tuberkulyozi etti xilda mutatsiya lokuslar: rpoB, pncA, katG; mabA (fabG1) -inhA, gyrA, gyrB va rrs.[1][2][3][4][5] MUBII so'rovni ikkita parallel strategiya yordamida tahlil qiladi: 1). A Portlash ilgari mutatsiyaga uchragan ketma-ketliklardan qidirish. 2). So'rovlar ketma-ketligini yovvoyi turdagi ketma-ketliklarga moslashtirish. MUBII hizalamalar grafigini va tavsifini chiqaradi mutatsiya va terapevtik ahamiyati.[1] Terapevtik jihatdan ahamiyatli mutatsiyalar Sandgren va boshqalar tomonidan belgilangan mezonlarga asoslanib "Yuqori ishonch" deb etiketlanadi.[6] MUBII-TB-JB, hatto o'qimagan foydalanuvchilar uchun ham foydalanishi oson bo'lgan platformani taqdim etadi bioinformatika.[1]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d Flandrois, Jan-Per; Lina, Jerar; Dumitresku, Oana (2014 yil dekabr). "MUBII-TB-JB: tuberkulyoz mikobakteriyasida antibiotiklarga chidamliligi bilan bog'liq mutatsiyalar ma'lumotlar bazasi". BMC Bioinformatika. 15 (1): 107. doi:10.1186/1471-2105-15-107. ISSN  1471-2105. PMC  4021062. PMID  24731071.
  2. ^ Heym, B (1997 yil fevral). "Mikobakteriya tuberkulyozida ko'p dori-darmonlarga qarshilik". Xalqaro mikroblarga qarshi vositalar jurnali. 8 (1): 61–70. doi:10.1016 / s0924-8579 (96) 00356-1. ISSN  0924-8579. PMID  18611785.
  3. ^ Musser, J M (1995 yil oktyabr). "Mikobakteriyalardagi mikroblarga qarshi vositalarning qarshiligi: molekulyar genetik tushunchalar". Klinik mikrobiologiya sharhlari. 8 (4): 496–514. doi:10.1128 / cmr.8.4.496. ISSN  0893-8512. PMC  172873. PMID  8665467.
  4. ^ Almeyda Da Silva, P. E .; Palomino, J. C. (2011-07-01). "Mikobakteriya tuberkulyozida dori-darmonlarga chidamlilikning molekulyar asoslari va mexanizmlari: klassik va yangi dorilar". Antimikrobiyal kimyoterapiya jurnali. 66 (7): 1417–1430. doi:10.1093 / jac / dkr173. ISSN  0305-7453. PMID  21558086.
  5. ^ Chjan, Y .; Yew, W-W. (2015-11-01). "Dori vositalariga qarshilik mexanizmlari Mikobakteriya tuberkulyozi: yangilash 2015 ". Xalqaro sil va o'pka kasalliklari jurnali. 19 (11): 1276–1289. doi:10.5588 / ijtld.15.0389. ISSN  1027-3719. PMID  26467578.
  6. ^ Sandgren, Andreas; Kuchli, Maykl; Mutukrishnan, Preetika; Vayner, Brayan K; Cherkov, Jorj M; Myurrey, Megan B (2009-02-10). "Silga qarshi dori-darmonlarga qarshi mutatsion ma'lumotlar bazasi". PLoS tibbiyoti. 6 (2): e1000002. doi:10.1371 / journal.pmed.1000002. ISSN  1549-1676. PMID  19209951.