Mahalliy aloqa - Native contact

Yilda oqsilni katlama, a mahalliy aloqa orasidagi aloqa yon zanjirlar ikkitadan aminokislotalar qo'shni bo'lmagan aminokislotalar ketma-ketligi (ya'ni, alfa spirallari bo'ylab ahamiyatsiz i - i + 4 kontaktlarini olib tashlash uchun ular birlamchi ketma-ketlikda to'rtdan ortiq qoldiq), ammo oqsil tarkibida fazoviy yaqin ona shtati uchinchi darajali tuzilish. Muayyan strukturada qayta tiklanadigan mahalliy kontaktlarning qismi ko'pincha a sifatida ishlatiladi reaktsiya koordinatasi davomida ishlab chiqarilgan inshootlarning asl holatidan og'ishni o'lchash uchun molekulyar dinamikasi simulyatsiyalar yoki mezonlarida oqsil tuzilishini bashorat qilish usullari.

The aloqa buyurtmasi bu oqsilning mahalliy kontaktlari joylashuvining o'lchovidir; ya'ni kontaktlarni hosil qiluvchi aminokislotalar orasidagi ketma-ketlik masofasi. Aloqa darajasi past bo'lgan oqsillar tezroq katlanabilmektedir va ba'zilari nomzod bo'lishi mumkin pastga burma.