OLE RNK - OLE RNA

Bezakli katta ekstremofil RNK
OLE ikkilamchi structure.jpg
Identifikatorlar
BelgilarOLE
RfamRF01071
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen
Domen (lar)Bakteriyalar
SOSO: 0001263
PDB tuzilmalarPDBe

OLE RNK (Bezakli katta ekstremofil RNK) saqlanib qolgan RNK mavjud bo'lgan tuzilish bakteriyalar.[1] RNK o'rtacha 610 ga teng nukleotidlar uzunligi bo'yicha. OLE RNKdan uzunroq bo'lgan yagona ma'lum bo'lgan RNKlar ribozimlar kabi II guruh intron va ribosoma RNKlari. OLE RNKning alohida uzunligi va yuqori darajada saqlanib qolgan tuzilishi OLE RNKning ribozim bo'lishi yoki boshqa yo'l bilan murakkab biokimyoviy vazifani bajarishi mumkinligi haqidagi gipotezani keltirib chiqardi.

OLE RNKlari asosan tartibda uchraydi Clostridiales, ammo boshqa turlari Firmicutes OLE RNKlarini ham o'z ichiga oladi. OLE RNKni o'z ichiga olgan organizmlar asosan ekstremofillar va anaeroblar.

OLE RNKlari RNK sifatida transkripsiyalanadi va tajribalar Bacillus haloduranlar a-da yozilganligini ko'rsating mRNA yana 10 kishi bilan genlar. Qo'shni genlar OLE RNK atrofida saqlanadigan ko'pgina turlarda saqlanadi, ammo Desulfitobacterium hafniense ular boshqa joyda joylashgan xromosoma. OLE RNKlari kattaroq transkriptdan taxminan konservalangan, ~ 610-nukleotid tuzilishga mos keladigan qisqaroq RNKga ishlov beriladi. Noma'lum funktsiyaga ega bo'lgan oqsil sinfini kodlovchi genlar odatda OLE RNK ning quyi qismida joylashgan va bu oqsil sinfining mavjudligi OLE RNK borligi bilan turlar bilan bog'liq. Ushbu o'zaro bog'liqlik RNK va oqsil o'rtasida mumkin bo'lgan funktsional bog'liqlikni taklif qiladi.

Adabiyotlar

  1. ^ Puerta-Fernandez E, Barrik JE, Roth A, Breaker RR (2006 yil dekabr). "Ekstremofil eubakteriyalarda katta bo'lmagan kodlovchi RNKni aniqlash". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 103 (51): 19490–19495. doi:10.1073 / pnas.0607493103. PMC  1748253. PMID  17164334.

Tashqi havolalar