PABPC1 - PABPC1

PABPC1
Protein PABPC1 PDB 1cvj.png
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarPABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poli (A) bog'lovchi protein sitoplazmik 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 Generkartalar: PABPC1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 8 (odam)
Chr.Xromosoma 8 (odam)[1]
Xromosoma 8 (odam)
PABPC1 uchun genomik joylashuv
PABPC1 uchun genomik joylashuv
Band8q22.3Boshlang100,685,816 bp[1]
Oxiri100,722,809 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002568

NM_008774

RefSeq (oqsil)

NP_002559

NP_032800

Joylashuv (UCSC)Chr 8: 100.69 - 100.72 MbChr 15: 36,6 - 36,61 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Poliadenilat bilan bog'laydigan oqsil 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi PABPC1 gen.[5] PABP1 oqsili mRNKni bog'laydi va yadrodan tashish, degradatsiya, tarjima va barqarorlik kabi turli funktsiyalarni engillashtiradi. Ikkita alohida PABP1 oqsillari mavjud, biri yadroda (PABPN1), ikkinchisi esa sitoplazmada (PABPC1) joylashgan. PABP1 ning joylashishi ushbu oqsilning roliga va uning RNK bilan ishlashiga ta'sir qiladi.[6]

Funktsiya

Eukaryotik mRNKning 3 'poli (A) dumiga murakkablashgan holda topilgan poli (A) bog'laydigan oqsil (PAB yoki PABP) poli (A) qisqartirish va tarjimani boshlash uchun talab qilinadi. Odamlarda PABP kichik yadro izoformasi va boshqalarning konservalangan genlar oilasini o'z ichiga oladi poli (A) bog'laydigan oqsillar. [OMIM tomonidan taqdim etilgan][7]

PABPC1 odatda sitoplazmada tarqaladi va yuqori mRNK kontsentratsiyasi bo'lgan joylarda, masalan, stress granulalari, ishlov berish jismlari va yuqori tarjima faolligi joylarida to'planadi. PABPC1 shuningdek bema'nilik vositachiligidagi mRNA parchalanishi (NMD) bilan bog'liq. PABPC1 poli (A) dumiga bog'lanib, eRF4G bilan o'zaro ta'sir qiladi, bu mRNKlarning sirkulyarizatsiyasini barqarorlashtiradi. Ushbu tuzilma mRNA degradatsiyasini NMD orqali oldini olish uchun talab qilinadi.[8]

PABP1 yadrosida barqarorlik, eksport, transport va degradatsiyani engillashtirish uchun mRNKlarning poli (A) dumlari bilan bog'lanadi. PABP1 ulanishi, shuningdek, yadroviy vositachilik degradatsiyasi uchun talab qilinadi. PABPC1 tarkibida to'rtta RNK-tanib olish motifi (RRM) mavjud. Birinchi ikkitasi, RRM1 va RRM2, a-importinni ham, qayta ishlangan mRNKning poli (A) dumini ham bog'laydi. Bu xususiyat mRNKning yadroga qaytishini oldini oladi.[6]

O'zaro aloqalar

PABPC1 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000070756 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000022283 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Grange T, de Sa CM, Oddos J, Pictet R (iyun 1987). "Inson mRNA poliadenilat bilan bog'lovchi oqsil: nuklein kislota bilan bog'lanish motifining evolyutsion konservatsiyasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 15 (12): 4771–87. doi:10.1093 / nar / 15.12.4771. PMC  305917. PMID  2885805.
  6. ^ a b Grey NK, Hrabálkova L, Scanlon JP, Smith RW (dekabr 2015). "Poli (A) biriktiruvchi oqsillar va mRNK lokalizatsiyasi: xo'rozni kim boshqaradi?". Biokimyoviy jamiyat bilan operatsiyalar. 43 (6): 1277–84. doi:10.1042 / BST20150171. PMID  26614673.
  7. ^ "Entrez Gen: PABPC1 poli (A) biriktiruvchi oqsil, sitoplazmik 1".
  8. ^ Fatscher T, Boehm V, Weiche B, Gehring NH (oktyabr 2014). "Sitoplazmatik poli (A) bilan bog'langan oqsilning o'zaro ta'sirlashuvi 4G ning ökaryotik boshlanish faktori bilan aloqasi bema'nilik vositasi bo'lgan mRNA yemirilishini bostiradi". RNK. 20 (10): 1579–92. doi:10.1261 / rna.044933.114. PMC  4174440. PMID  25147240.
  9. ^ Koloteva-Levine N, Pinchasi D, Pereman I, Zur A, Brandeis M, Elroy-Shteyn O (2004 yil may). "Anafazani rivojlantiruvchi kompleks / siklosomaning Apc5 subbirligi poli (A) biriktiruvchi oqsil bilan o'zaro ta'sir qiladi va ichki ribosoma kirish joyi vositasida tarjimani bosadi". Molekulyar va uyali biologiya. 24 (9): 3577–87. doi:10.1128 / mcb.24.9.3577-3587.2004. PMC  387753. PMID  15082755.
  10. ^ Funakoshi Y, Doi Y, Xosoda N, Uchida N, Osava M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Xoshino S (dekabr 2007). "MRNA dedenilatsiyasining mexanizmi: eRF3 va mRNA dedenilazalar translyatsiyasini tugatish koeffitsienti o'rtasida molekulyar o'zaro ta'sirning isboti". Genlar va rivojlanish. 21 (23): 3135–48. doi:10.1101 / gad.1597707. PMC  2081979. PMID  18056425.
  11. ^ a b Imataka H, ​​Gradi A, Sonenberg N (dekabr 1998). "Inson eIF4G ning yangi aniqlangan N-terminalli aminokislotalar ketma-ketligi poli (A) -siluvchi oqsilni bog'laydi va poli (A) -ga bog'liq tarjimadagi funktsiyalar". EMBO jurnali. 17 (24): 7480–9. doi:10.1093 / emboj / 17.24.7480. PMC  1171091. PMID  9857202.
  12. ^ Xoshino S, Imai M, Kobayashi T, Uchida N, Katada T (iyun 1999). "MRNA ning 3'-Poly (A) dumiga tarjima tugatish signalini olib boruvchi eukaryotik polipeptid zanjirini chiqaruvchi omili (eRF3 / GSPT). Erf3 / GSPT ning poliadenilat bilan bog'lovchi oqsil bilan bevosita bog'liqligi". Biologik kimyo jurnali. 274 (24): 16677–80. doi:10.1074 / jbc.274.24.16677. PMID  10358005.
  13. ^ Roy G, De Crescenzo G, Khaleghpour K, Kahvejian A, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (iyun 2002). "Paip1 ikkita mustaqil bog'lovchi motif orqali poli (A) bog'laydigan oqsil bilan o'zaro ta'sir qiladi". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (11): 3769–82. doi:10.1128 / mcb.22.11.3769-3782.2002. PMC  133836. PMID  11997512.
  14. ^ Kreyg AW, Xagigat A, Yu AT, Sonenberg N (aprel 1998). "Poliadenilat bilan bog'lovchi oqsilning PAIFning eIF4G gomologi bilan o'zaro ta'siri tarjimani kuchaytiradi". Tabiat. 392 (6675): 520–3. doi:10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
  15. ^ Xaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (Avgust 2001). "Paip2 translatsiya repressorining poli (A) biriktiruvchi oqsil bilan o'zaro ta'siri". Molekulyar va uyali biologiya. 21 (15): 5200–13. doi:10.1128 / MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC  87244. PMID  11438674.

Qo'shimcha o'qish