PCBP2 - PCBP2

PCBP2
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2AXY, 2JZX, 2P2R, 2PQU, 2PY9
Identifikatorlar
Taxalluslar	PCBP2, HNRNPE2, HNRPE2, hnRNP-E2, poli (rC) bog'laydigan oqsil 2
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 601210 MGI: 108202 HomoloGene: 74536 Generkartalar: PCBP2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 12 (odam)
Oxiri	53,481,162 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 15 (sichqoncha)
Oxiri	102,500,061 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • fermentlarni bog'lash; • nuklein kislota bilan bog'lanish; • ubikuitin protein ligaz bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish; • C-ga boy bitta zanjirli DNKni bog'lash;
Uyali komponent	• hujayra tashqari ekzozoma; • membrana; • fokal yopishqoqlik; • nukleoplazma; • sitoplazma; • hujayra yadrosi; • sitozol; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsinaptik zichlik;
Biologik jarayon	• mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali; • virusga qarshi mudofaa reaktsiyasini salbiy tartibga solish; • proteazom vositachiligidagi ubiqitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni; • virusga qarshi himoya; • mRNK metabolik jarayoni; • I turdagi interferon ishlab chiqarishni salbiy tartibga solish; • immunitet tizimi jarayoni; • tug'ma immunitet tizimi; • virusli RNK genomining replikatsiyasi; • IRESga bog'liq virusli tarjima boshlanishi; • RNK metabolik jarayoni;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	5094
	18521
	ENSG00000197111
	ENSMUSG00000056851
	Q15366
	Q61990
NM_031989; NM_001098620; NM_001128911; NM_001128912; NM_001128913;
	NM_001128914; NM_005016
	NM_001103165; NM_001103166; NM_001174073; NM_011042
NP_001092090; NP_001122383; NP_001122384; NP_001122385; NP_001122386;
	NP_005007; NP_114366
	NP_001096635; NP_001096636; NP_001167544; NP_035172; NP_001361700
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Poli (rC) bog'laydigan oqsil 2 a oqsil odamlarda kodlanganligi PCBP2 gen.^[5]

Funktsiya

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil ko'p funktsiyali ko'rinadi. U PCBP-1 va hnRNPK bilan birgalikda asosiy uyali poli (rC) bilan bog'langan oqsillarga to'g'ri keladi. U uchta K-gomologik (KH) domenlari RNK bilan bog'lanishda ishtirok etishi mumkin. Ushbu kodlangan oqsil PCBP-1 bilan birgalikda poliovirus RNKning translyatsion koaktivatori vazifasini bajaradi va IRESning ildiz tsikli IV bilan ketma-ketlik bo'yicha o'zaro ta'sir qiladi va poliovirus RNK replikatsiyasini uning 5'-terminalli yonca yaprog'i tuzilishiga bog'laydi. Bu shuningdek, 15-lipoksigenaza mRNK, odam Papillomavirus turi 16 L2 mRNK va gepatit A virusi RNKni translyatsion nazoratida ishtirok etgan. Kodlangan oqsil, shuningdek, alfa-globin mRNK barqarorligi bilan bog'liq bo'lgan ketma-ket alfa-globin mRNP kompleksini shakllantirishda muhim rol o'ynaydi. Ushbu multiexon tizimli mRNK o'xshash funktsiyalarga ega bo'lgan PCBP-1 intronless genini ishlab chiqarish uchun retrotranspozitsiya qilingan deb o'ylashadi. Ushbu gen va PCBP-1 PCBP3 va PCBP4 paraloglariga ega, ular butun genlarning takrorlanish hodisalari natijasida paydo bo'lgan deb o'ylashadi. Bundan tashqari, PCBP2P1 va PCBP2P2 ikkita qayta ishlangan pseudogenlari mavjud. Hozirgi vaqtda ushbu gen uchun tavsiflangan ikkita muqobil ravishda biriktirilgan transkript variantlari mavjud.^[6]

Odamlarda PCBP2 geni ustma-ust tushadi TUC338, ko'chirilgan ultra saqlanib qolgan element taalluqli Gepatotsellulyar karsinoma.^[7]

O'zaro aloqalar

PCBP2 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan HNRPK,^[8] PTBP1,^[8] va HNRNPL.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000197111 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000056851 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Tommerup N, Leffers H (1997 yil may). "In situ gibridlash yo'li bilan inson KH-qutisini o'z ichiga olgan genlarni tayinlash: HNRNPK 9q21.32-q21.33, PCBP1 dan 2p12-p13 gacha va PCBP2 dan FRA12A gacha distal bilan 12q13.12-q13.13 gacha xaritalar". Genomika. 32 (2): 297–8. doi:10.1006 / geno.1996.0121. PMID 8833161.
^ "Entrez Gen: PCBP2 poli (rC) bog'laydigan oqsil 2".
^ Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). "Gepatotsellulyar karsinomada ultrakonservlangan element bilan transkripsiya qilingan kodlanmaydigan RNKning ifodasi va funktsional roli". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 108 (2): 786–91. doi:10.1073 / pnas.1011098108. PMC 3021052. PMID 21187392.
^ ^a ^b ^v Kim JH, Xahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (may 2000). "Yadro va sitoplazma o'rtasida mo''tadil bo'lgan hnRNPlar orasidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri". J. Mol. Biol. 298 (3): 395–405. doi:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.

Qo'shimcha o'qish

Kiledjian M, Vang X, Liebhaber SA (1995). "Alfa-globin mRNP barqarorlik kompleksidagi ikkita KH domen oqsilini aniqlash". EMBO J. 14 (17): 4357–64. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00110.x. PMC 394520. PMID 7556077.
Leffers H, Dejgaard K, Celis JE (1995). "Har biri uchta K-homolog (KH) domenini o'z ichiga olgan ikkita asosiy hujayrali poli (rC) bog'laydigan inson oqsillarining xarakteristikasi". Yevro. J. Biokimyo. 230 (2): 447–53. doi:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20581.x. PMID 7607214.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Blyn LB, Swiderek KM, Richards O, Stahl DC, Semler BL, Ehrenfeld E (1996). "Poli (rC) bog'laydigan oqsil 2 poliovirus RNK 5 'kodlamaydigan mintaqaning IV-tsikli bilan bog'lanadi: avtomatlashtirilgan suyuqlik xromatografiyasi-tandem mass-spektrometriyasi bilan identifikatsiya qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 93 (20): 11115–20. doi:10.1073 / pnas.93.20.11115. PMC 38293. PMID 8855318.
Funke B, Zuleger B, Benavente R, Schuster T, Goller M, Stévenin J, Horak I (1996). "Sichqoncha poli (C) bilan bog'langan oqsil ko'p izoformlarda mavjud va bir nechta RNK bilan bog'langan oqsillar bilan o'zaro ta'sir qiladi". Nuklein kislotalari rez. 24 (19): 3821–8. doi:10.1093 / nar / 24.19.3821. PMC 146158. PMID 8871564.
Blyn LB, Towner JS, Semler BL, Erenfeld E (1997). "Poliovirus RNKni tarjima qilish uchun poli (rC) bog'laydigan oqsil 2 talablari". J. Virol. 71 (8): 6243–6. doi:10.1128 / JVI.71.8.6243-6246.1997. PMC 191892. PMID 9223526.
Kiledjian M, DeMaria CT, Brewer G, Novick K (1997). "AUF1ni (heterojen yadroli ribonukleoprotein D) alfa-globin mRNA barqarorlik kompleksining tarkibiy qismi sifatida aniqlash". Mol. Hujayra. Biol. 17 (8): 4870–6. doi:10.1128 / MCB.17.8.4870. PMC 232339. PMID 9234743.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Czyzyk-Krzeska MF, Bendixen AC (1999). "Eritropoietin xabarchi RNKning 3 'tarjima qilinmagan mintaqasi bilan bog'liq bo'lgan kompleksdagi poli (C) bog'lovchi oqsilni aniqlash". Qon. 93 (6): 2111–20. doi:10.1182 / blood.V93.6.2111.406k24_2111_2120. PMID 10068686.
Vang Z, kun N, Trifillis P, Kiledjian M (1999). "MRNA barqarorligi kompleksi in vitro mRNKni barqarorlashtirish uchun poli (A) bilan bog'langan oqsil bilan ishlaydi". Mol. Hujayra. Biol. 19 (7): 4552–60. doi:10.1128 / MCB.19.7.4552. PMC 84253. PMID 10373504.
Makeyev AV, Chxeidze AN, Liebhaber SA (1999). "MRNK stabillashuviga aloqador alfaCP-1 va alfaCP-2 yuqori darajada saqlanib qolgan RNK bilan bog'langan oqsillar to'plami intrononsiz gen va uning intron o'z ichiga olgan paralogidan birgalikda ekspression qilinadi". J. Biol. Kimyoviy. 274 (35): 24849–57. doi:10.1074 / jbc.274.35.24849. PMID 10455157.
Kim JH, Xahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (2000). "Yadro va sitoplazma o'rtasida mo''tadil bo'lgan hnRNPlar orasidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri". J. Mol. Biol. 298 (3): 395–405. doi:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.
Makeyev AV, Liebhaber SA (2000). "Ikkita yangi sutemizuvchi genlarning identifikatsiyasi KH-domeni RNK bilan bog'langan oqsillarning subfamilasini tashkil qiladi". Genomika. 67 (3): 301–16. doi:10.1006 / geno.2000.6244. PMID 10936052.
Chang CJ, Luh HW, Vang SH, Lin HJ, Li SC, Xu ST (2002). "Geterogen yadro ribonukleoprotein K (hnRNP K) dang virusi yadrosi oqsili bilan o'zaro ta'sir qiladi". DNK hujayrasi biol. 20 (9): 569–77. doi:10.1089/104454901317094981. PMID 11747608.
Yeap BB, Voon DC, Vivian JP, McCulloch RK, Tomson AM, Giles KM, Czyzyk-Krzeska MF, Furneaux H, Wilce MC, Wilce JA, Leedman PJ (2002). "Androgen retseptorlari xabarchisi RNKning 3'-tarjima qilinmagan hududida konservalangan UCga boy motif bilan HuR va poli (C) -siluvchi oqsilni yangi bog'lash". J. Biol. Kimyoviy. 277 (30): 27183–92. doi:10.1074 / jbc.M202883200. PMID 12011088.
Walter BL, Petrushka TB, Erenfeld E, Semler BL (2002). "Poliovirus tarjimasini boshlash va virusli RNK replikatsiyasi uchun KH domenini aniqlovchi poly (rC) majburiy protein". J. Virol. 76 (23): 12008–22. doi:10.1128 / JVI.76.23.12008-12022.2002. PMC 136902. PMID 12414943.
Abraham RS, Geyer SM, Price-Troska TL, Allmer C, Kayl RA, Gertz MA, Fonseca R (2003). "Immunoglobulin yorug'lik zanjiri o'zgaruvchan (V) mintaqaviy genlari yorug'lik zanjiri bilan bog'liq amiloidoz (AL) ning klinik ko'rinishiga va natijalariga ta'sir qiladi". Qon. 101 (10): 3801–8. doi:10.1182 / qon-2002-09-2707. PMID 12515719.
Pickering BM, Mitchell SA, Evans JR, Willis AE (2003). "Polipirimidin yo'llarini bog'laydigan oqsil va poly r (C) bog'laydigan oqsil 1 BAG-1 IRES bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning in vitro va in vivo jonli faoliyatini rag'batlantiradi". Nuklein kislotalari rez. 31 (2): 639–46. doi:10.1093 / nar / gkg146. PMC 140511. PMID 12527772.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 12 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000197111 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000056851 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8833161-5] Tommerup N, Leffers H (1997 yil may). "In situ gibridlash yo'li bilan inson KH-qutisini o'z ichiga olgan genlarni tayinlash: HNRNPK 9q21.32-q21.33, PCBP1 dan 2p12-p13 gacha va PCBP2 dan FRA12A gacha distal bilan 12q13.12-q13.13 gacha xaritalar". Genomika. 32 (2): 297–8. doi:10.1006 / geno.1996.0121. PMID 8833161.

[entrez-6] "Entrez Gen: PCBP2 poli (rC) bog'laydigan oqsil 2".

[Bra11-7] Braconi C, Valeri N, Kogure T, Gasparini P, Huang N, Nuovo GJ, Terracciano L, Croce CM, Patel T (2011-01-11). "Gepatotsellulyar karsinomada ultrakonservlangan element bilan transkripsiya qilingan kodlanmaydigan RNKning ifodasi va funktsional roli". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 108 (2): 786–91. doi:10.1073 / pnas.1011098108. PMC 3021052. PMID 21187392.

[pmid10772858-8] v Kim JH, Xahm B, Kim YK, Choi M, Jang SK (may 2000). "Yadro va sitoplazma o'rtasida mo''tadil bo'lgan hnRNPlar orasidagi oqsil-oqsilning o'zaro ta'siri". J. Mol. Biol. 298 (3): 395–405. doi:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID 10772858.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]