PPFIBP1 - PPFIBP1

PPFIBP1
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarPPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA bog'lovchi oqsil 1
Tashqi identifikatorlarOMIM: 603141 MGI: 1914783 HomoloGene: 2685 Generkartalar: PPFIBP1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 12 (odam)
Chr.Xromosoma 12 (odam)[1]
Xromosoma 12 (odam)
PPFIBP1 uchun genomik joylashuv
PPFIBP1 uchun genomik joylashuv
Band12p11.23-p11.22Boshlang27,523,431 bp[1]
Oxiri27,695,564 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE PPFIBP1 203735 x

Ps.Bng da PBB GE PPFIBP1 214374 s

Fs.png da PBB GE PPFIBP1 203736 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

8496

67533

Ansambl

ENSG00000110841

ENSMUSG00000016487

UniProt

Q86W92

Q8C8U0

RefSeq (mRNA)

NM_001198915
NM_001198916
NM_003622
NM_177444

NM_001170433
NM_026221
NM_001355728
NM_001355729

RefSeq (oqsil)

NP_001185844
NP_001185845
NP_003613
NP_803193

NP_001163904
NP_080497
NP_001342657
NP_001342658

Joylashuv (UCSC)Chr 12: 27.52 - 27.7 MbChr 6: 146.89 - 147.03 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Liprin-beta-1 a oqsil odamlarda kodlanganligi PPFIBP1 gen.[5][6][7]

Ushbu gen tomonidan kodlangan oqsil LAR oqsil-tirozin fosfataza bilan o'zaro ta'sir qiluvchi protein (liprin) oilasining a'zosi hisoblanadi. Liprinlar aksonni boshqarish va sut bezlarini rivojlanishi uchun muhim bo'lgan transmembran oqsili tirozin fosfatazalarning LAR oilasi a'zolari bilan o'zaro ta'sir o'tkazadilar. Liprinlar murakkab tuzilmalarni hosil qiluvchi va tirnoqli fosfatazalarning LAR turkumini biriktirish uchun iskala vazifasini bajaradigan ko'p valentli oqsillardir. Ushbu oqsil o'smaning invazivligi va metastaziga bog'liq bo'lgan S100A4, kaltsiyni biriktiruvchi oqsil bilan o'zaro aloqada ekanligi aniqlandi. In vitro tajriba shuni ko'rsatdiki, o'zaro ta'sir bu oqsilning fosforillanishini S-protein kinaz va CK2 protein kinaz bilan inhibe qiladi. Shu bilan bir qatorda alohida izoformlarni kodlovchi transkript variantlari haqida xabar berilgan.[7]

O'zaro aloqalar

PPFIBP1 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan liprin-alfa-1.[5]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000110841 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000016487 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b Serra-Pages C, Medley QG, ​​Tang M, Xart A, Streuli M (Iyul 1998). "Liprinlar, LAR transmembran oqsil-tirozin fosfataza bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillar oilasi". J Biol Chem. 273 (25): 15611–20. doi:10.1074 / jbc.273.25.15611. PMID  9624153.
  6. ^ Kriajevska M, Fischer-Larsen M, Mertz E, Vorm O, Tulchinskiy E, Grigorian M, Ambartsumian N, Lukanidin E (Fevral 2002). "Liprin beta 1, LAR transmembran tirozin fosfataza bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillar oilasining a'zosi, metastaz bilan bog'liq bo'lgan S100A4 (Mts1) oqsilining yangi maqsadi". J Biol Chem. 277 (7): 5229–35. doi:10.1074 / jbc.M110976200. PMID  11836260.
  7. ^ a b "Entrez Gen: PPFIBP1 PTPRF o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil, bog'lovchi oqsil 1 (liprin beta 1)".

Qo'shimcha o'qish