Prp24 - Prp24

Prp24 (prekursor RNA pressessing, gen 24) ning oqsil qismidir oldindan xabar beruvchi RNK biriktirish jarayonini bog'lashga yordam beradi U6 snRNA ga U4 snRNA shakllanishi paytida splitseozomalar. Topilgan eukaryotlar dan xamirturush ga E. coli, qo'ziqorinlar va Prp24 dastlab 1989 yilda RNK qo'shilishining muhim elementi ekanligi aniqlandi.[1][2] Mutatsiyalar Prp24-da keyinchalik bostirish uchun 1991 yilda topilgan mutatsiyalar U4 tarkibida xamirturushning sovuqqa sezgir shtammlari paydo bo'ldi, bu uning qo'shilishning katalitik bosqichlaridan keyin U4 / U6 dupleksining isloh qilinishida ishtirok etishini ko'rsatdi.[3]

Prp24 RRM 1 va 2

Biologik roli

Splitseozoma hosil bo'lish jarayoni U4 va U6 ni o'z ichiga oladi snRNPs assotsiatsiyalash va di-snRNP ni shakllantirish hujayra yadrosi. Keyin ushbu di-snRNP boshqa a'zoni yollaydi (U5 ) tri-snRNP bo'lish. U6 U4 bilan bog'lanish uchun U4 dan ajralishi kerak U2 va katalitik faollashadi. Splicing amalga oshirilgandan so'ng, U6 splitseozomadan ajralib, tsiklni qayta boshlash uchun U4 bilan qayta bog'lanishi kerak.

Prp24 U4 va U6 snRNP-larining bog'lanishiga yordam beradi. Prp24 ni olib tashlash natijasida bepul U4 va U6 to'planib qoladi va keyinchalik Prp24 qo'shilishi U4 / U6 ni qayta tiklaydi va bo'sh U4 va U6 miqdorini kamaytiradi.[4] Yalang'och U6 snRNA juda ixcham va uni shakllantirish uchun joy oz tayanch juftliklari boshqa RNK bilan. Ammo, U6 snRNP Prp24 kabi oqsillar bilan birikganda, struktura ancha ochilib, U4 bilan bog'lanishni osonlashtiradi.[5] Prp24 U6 / U4 dupleksida mavjud emas va tegishli tayanch juftliklari hosil bo'lishi uchun Prp24 kompleksni tark etishi kerakligi haqida taklif qilingan.[6][7] Bundan tashqari, U6 bazalarni U2 bilan juftlashtirishi uchun Prp24 U4 / U6-ni beqarorlashtirishda muhim rol o'ynashi mumkinligi aytilgan.[8]

Tuzilishi

Prp 24 RRM 3

Prp24-da a molekulyar og'irlik 50 dan kDa va to'rtta RNKni aniqlashni o'z ichiga olganligi ko'rsatilgan motiflar (RRM) va a konservalangan 12-aminokislota ketma-ketligi da C-terminali.[9][10] 1 va 2 RRM yuqori ko'rsatkichlar uchun muhim ekanligi ko'rsatilgan.qarindoshlik U6 ning ulanishi, 3 va 4-RRMlar esa U6 ning yaqinligi pastroq joylarda bog'lanadi.[11] Birinchi uchta RRM bir-biri bilan keng ta'sir o'tkazadi va tarkibida to'rt qatorli kanonik burmalar mavjud. beta-varaq va ikkitasi alfa-spirallar. RRM 1 va 2 ning elektropozitiv yuzasi RNKdir tavlash RRM2 ning beta-varaq yuzini o'z ichiga olgan RRM 1 va 2 orasidagi yoriq ketma-ketlikka xos RNK bilan bog'lanish joyidir.[1] Bilan bog'lanish uchun C-terminal motifi zarur LSm oqsillar va o'z hissasini qo'shadi substrat (U6) bog'lash va qo'shilishning katalitik tezligi emas.[10]

U6 snRNP bog'liq Prp24 va LSm oqsillari bilan

O'zaro aloqalar

Prp24 UR snRNA bilan o'z RRMlari orqali ta'sir o'tkazadi. Bu orqali ko'rsatildi kimyoviy modifikatsiya buni sinab ko'rish nukleotidlar U6 ning 39-57 (xususan, 40-43)[5] Prp24 ni majburiy ravishda jalb qilishda ishtirok etadilar.[12]

LSm oqsillari U6 RNKida izchil konfiguratsiyaga ega.[9][tushuntirish kerak ] LSm oqsillari va Prp24 jismoniy va funktsional jihatdan o'zaro ta'sir qilishi taklif qilingan[6] va Prp24-ning C-terminal motifi bu o'zaro bog'liqlik uchun muhimdir.[10] Prp24 ning U6 bilan bog'lanishi Lsm oqsillarini U6 bilan bog'lanishi bilan kuchayadi, U4 va U6 bilan bog'lanish kabi.[13] Bu tomonidan aniqlangan elektron mikroskopi Prp24 LSm2 da LSm oqsil halqasi bilan o'zaro ta'sir qilishi mumkin.[9]

Gomologlar

Prp24-da inson bor gomolog, SART3. SART3 - bu o'smani rad etish antigen (SART3 "ma'nosini anglatadi"skvamoz hujayrali karsinoma antigen rtomonidan tanilgan T hujayralar, gen 3). Xamirturushdagi RRM 1 va 2 inson SART3 tarkibidagi RRMlarga o'xshaydi.[1][11] C-terminal domeni xamirturushdan odamlarga juda yaxshi saqlanib qolgan.[14] Ushbu protein, Prp24 kabi, LSm oqsillari bilan o'zaro ta'sir qiladi[9][15] U6 ni U4 / U6 snRNP ga qayta ishlash uchun. SART3 maqsad U6 ga a ga taklif qilingan Kajal tanasi yoki U4 / U6 snRNP yig'iladigan joy sifatida yadro qo'shilishi.[15] SART3 joylashgan xromosoma 12 va a mutatsiya ehtimol sababdir tarqalgan yuzaki aktinik porokeratoz.[16]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v Bae, E .; va boshq. (2007). "Prp24 qo'shilish omilining birinchi uchta RNK tanib olish motiflarining tuzilishi va o'zaro ta'siri". Molekulyar biologiya jurnali. 367 (5): 1447–1458. doi:10.1016 / j.jmb.2007.01.078. PMC  1939982. PMID  17320109.
  2. ^ Vijayragavan, U .; Kompaniya, M .; Abelson, J. (1989). "MRNKga qo'shilish mutantlarini ajratish va tavsiflash Saccharomyces cerevisiae". Genlar va rivojlanish. 3 (8): 1206–1216. doi:10.1101 / gad.3.8.1206. PMID  2676722.
  3. ^ Shannon, K. V.; Guthrie, C. (1991). "U4 snRNA mutatsiyasining supressorlari RNK bilan bog'lovchi motifli yangi U6 snRNP oqsilini aniqlaydi". Genlar va rivojlanish. 5 (5): 773–785. doi:10.1101 / gad.5.5.773. PMID  1827420.
  4. ^ Ragunatan, P. L.; Guthrie, C. A. (1998). "U4 va U6 kichik yadroli ribonukleoprotein zarralarini qayta tiklaydigan splitseozomal qayta ishlash omili". Ilm-fan. 279 (5352): 857–860. Bibcode:1998 yil ... 279..857R. doi:10.1126 / science.279.5352.857. PMID  9452384.
  5. ^ a b Karaduman, R .; va boshq. (2006). "Tozalangan xamirturush U6 snRNP-laridagi RNK tuzilishi va RNK-oqsillarning o'zaro ta'siri". Molekulyar biologiya jurnali. 356 (5): 1248–1262. doi:10.1016 / j.jmb.2005.12.013. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-E5F7-6. PMID  16410014.
  6. ^ a b Vidal, V. P.; va boshq. (1995). "U6 snRNA-oqsil o'zaro ta'sirining xarakteristikasi". RNK. 5 (11): 1470–1481. doi:10.1017 / S1355838299991355. PMC  1369868. PMID  10580475.
  7. ^ Jandrositz, A .; Guthrie, A. (1995). "U6 snRNA va U6 va U4 snRNAlarning tavlanishida taxminiy oraliqda Prp24 bog'lash joyiga dalillar". EMBO jurnali. 14 (4): 820–832. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07060.x. PMC  398149. PMID  7882985.
  8. ^ Vidaver, R. M.; Fortner, DM; Loos-Ostin, LS; Qosh, DA (1999). "U6 RNK strukturaviy qayta tuzilishida Prp24 oqsilini biriktiruvchi Saccharomyces cerevisiae ning ko'p funktsiyalari". Genetika. 153 (3): 1205–1218. PMC  1460831. PMID  10545453.
  9. ^ a b v d Karaduman, R .; va boshq. (2008). "Xamirturushli U6 snRNPlarning tuzilishi: Prp24p va LSm kompleksini elektron mikroskopida aniqlangan tartib". RNK. 14 (12): 1–10. doi:10.1261 / rna.1369808. PMC  2590955. PMID  18971323.
  10. ^ a b v Rader, S.D .; Guthrie, C. (2002). "U4 / U6 di-snRNP samarali shakllanishi uchun zarur bo'lgan Prp24-da saqlanib qolgan Lsm-o'zaro ta'sir motifi". RNK. 8 (11): 1378–1392. doi:10.1017 / S1355838202020010. PMC  1370345. PMID  12458792.
  11. ^ a b Kvan, S. S .; Qosh, D. A. (2005). "Prp24 qo'shilish omilining N- va C-terminalli RNKni aniqlash motiflari U6 RNKni bog'lashda alohida funktsiyalarga ega". RNK. 11 (5): 808–820. doi:10.1261 / rna.2010905. PMC  1370765. PMID  15811912.
  12. ^ Getti, A .; Kompaniya, M .; Abelson, J. (1995). "Prp24 ning RNK bilan bog'lanishining o'ziga xos xususiyati: U4 va U6 snRNAlarning dinamik o'zaro ta'sirida Prp24 uchun roli". RNK. 1 (2): 132–145. PMC  1369067. PMID  7585243.
  13. ^ Rayan, D. E.; Stivens, S. V.; Abelson, J. (2002). "Xamirturush U6 snRNA ning 5 'va 3' domenlari: Lsm oqsillari Prp24 oqsilining U6 telestem mintaqasi bilan bog'lanishini osonlashtiradi". RNK. 8 (8): 1011–1033. doi:10.1017 / S1355838202026092. PMC  1370313. PMID  12212846.
  14. ^ Bell, M.; va boshq. (2002). "p110, yangi inson U6 snRNP oqsili va U4 / U6 snRNP qayta ishlash omili". EMBO jurnali. 21 (11): 2724–2735. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2724. PMC  126028. PMID  12032085.
  15. ^ a b Stanek, D .; va boshq. (2003). "U4 / U6 kichik yadroli RNP yig'ish koeffitsienti SART3 / p110 ni Kajal jismlariga yo'naltirish". Hujayra biologiyasi jurnali. 160 (4): 505–516. doi:10.1083 / jcb.200210087. PMC  2173746. PMID  12578909.
  16. ^ "OMIM - POROKERATOZ, YO'Q BO'LGAN SUPERFIKAL AKTINIKA, 1; DSAP1". Olingan 2009-04-05.

Tashqi havolalar