RBBP6 - RBBP6

RBBP6
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2C7H, 2YSA, 2YUR, 3ZTG
Identifikatorlar
Taxalluslar	RBBP6, MY038, P2P-R, PACT, RBQ-1, SNAMA, retinoblastomani bog'laydigan oqsil 6, RB bog'laydigan oqsil 6, ubikuitin ligaz
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 600938 MGI: 894835 HomoloGene: 136812 Generkartalar: RBBP6
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	24,572,863 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 7 (sichqoncha)
Oxiri	123,002,557 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • rux ioni bilan bog'lash; • nuklein kislota bilan bog'lanish; • metall ionlari bilan bog'lanish; • ubikuitin-protein transferaza faolligi; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 ubiquitin protein ligaza faolligi; • transferaza faoliyati; • RNK bilan bog'lanish; • protein kinaz bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• nukleus; • mikrotubulalarni tashkil etish markazi; • hujayra yadrosi; • xromosoma; • sitoplazma; • sitoskelet; • sitozol; • tsentrosoma; • yadro zarrasi; • makromolekulyar kompleks;
Biologik jarayon	• bachadon embrional rivojlanishida; • embrional organlarning rivojlanishi; • DNK replikatsiyasini tartibga solish; • DNKning replikatsiyasi; • DNKning zararlanishini rag'batlantirishga uyali javob; • oqsilning hamma joyda tarqalishi; • ko'p hujayrali organizm o'sishi; • somite rivojlantirish; • mRNKni qayta ishlash; • oqsil poliubikvitinatsiyasi; • ubikuitinga bog'liq oqsil katabolik jarayoni;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	5930
	19647
	ENSG00000122257
	ENSMUSG00000030779
	Q7Z6E9
	P97868
	NM_006910; NM_018703; NM_032626
	NM_011247; NM_175023
	NP_008841; NP_061173; NP_116015
	NP_035377; NP_778188
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Retinoblastomani bog'laydigan oqsil 6 a oqsil odamlarda kodlanganligi RBBP6 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Retinoblastoma o'simtasini bostiruvchi (pRB) oqsil boshqa ko'plab oqsillar bilan bog'lanadi. Insonning turli xil saraton kasalliklarida pRB hujayra ko'payishini bostiradi va inaktiv bo'ladi. Hujayra tsikliga bog'liq fosforillanish pRB faoliyatini tartibga soladi. Ushbu gen fosforillangan, ammo fosforlanmagan pRB bilan bog'langan oqsilni kodlaydi. Ushbu gen uchun turli xil izoformlarni kodlaydigan bir nechta muqobil ravishda biriktirilgan transkript variantlari topildi.^[7]

O'zaro aloqalar

RBBP6 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan Y qutisini bog'laydigan oqsil 1.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000122257 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000030779 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Sakai Y, Saijo M, Coelho K, Kishino T, Niikava N, Taya Y (noyabr 1995). "retinoblastoma geni mahsuloti bilan bog'langan RBQ-1 (RBBP6) inson oqsilining cDNA ketma-ketligi va xromosomal lokalizatsiyasi". Genomika. 30 (1): 98–101. doi:10.1006 / geno.1995.0017. PMID 8595913.
^ Pugh DJ, Ab E, Faro A, Lutya PT, Hoffmann E, Rees DJ (2006 yil fevral). "DWNN, yangi ubikitinga o'xshash domen, RBBP6 ni mRNKni qayta ishlashga va ubikuitinga o'xshash yo'llarga ta'sir qiladi". BMC Strukturaviy Biologiya. 6: 1. doi:10.1186/1472-6807-6-1. PMC 1360078. PMID 16396680.
^ ^a ^b "Entrez Gen: RBBP6 retinoblastoma bog'lovchi oqsil 6".
^ Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Riz DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (dekabr 2008). "RBBP6 RING barmoq domeni orqali ko'p funktsional YB-1 oqsil bilan o'zaro ta'sir qiladi, bu esa YB-1ni hamma joyda va proteosomal degradatsiyaga olib keladi". Molekulyar biologiya jurnali. 384 (4): 908–16. doi:10.1016 / j.jmb.2008.09.060. PMID 18851979.

Qo'shimcha o'qish

Simons A, Melamed-Bessudo C, Wolkowicz R, Sperling J, Sperling R, Eisenbach L, Rotter V (Yanvar 1997). "PACT: klonlash va Rb bilan o'zaro bog'liq bo'lgan uyali p53 majburiy oqsilining tavsifi". Onkogen. 14 (2): 145–55. doi:10.1038 / sj.onc.1200825. PMID 9010216.
Gao S, Witte MM, Scott RE (may 2002). "P2P-R oqsili interfaaza hujayralarining yadrosi va maksimal P2P-R immunoreaktivligini ko'rsatadigan mitotik hujayralardagi xromosomalarning atrofiga joylashadi". Uyali fiziologiya jurnali. 191 (2): 145–54. doi:10.1002 / jcp.10084. PMID 12064457. S2CID 25240477.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Gamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (Iyul 2004). "Inson signalizatsiya yo'lining funktsional proteomik xaritasi". Genom tadqiqotlari. 14 (7): 1324–32. doi:10.1101 / gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Shvarts D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (Avgust 2004). "HeLa hujayra yadroviy fosfoproteidlarining keng ko'lamdagi tavsifi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Yoshitake Y, Nakatsura T, Monji M, Senju S, Matsuyoshi H, Tsukamoto H, Xosaka S, Komori H, Fukuma D, Ikuta Y, Katagiri T, Furukava Y, Ito H, Shinohara M, Nakamura Y, Nishimura Y (oktyabr 2004) ). "DNKning mikroarray komplementar tahlillari yordamida aniqlangan immunoterapiya uchun qizilo'ngach saratoni uchun ideal antigen, ko'payish potentsialiga bog'liq oqsil". Klinik saraton tadqiqotlari. 10 (19): 6437–48. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0841. PMID 15475430.
Scott RE, White-Grindley E, Ruley HE, Chesler EJ, Williams RW (Iyul 2005). "P2P-R ekspressioni genetik jihatdan tarjima mashinasining tarkibiy qismlari bilan va P2P-R mRNA bilan bog'langan translyatsion repressor PUM2 bilan yadroli qilingan". Uyali fiziologiya jurnali. 204 (1): 99–105. doi:10.1002 / jcp.20263. PMID 15617101. S2CID 24888360.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (oktyabr 2006). "Yuqori oqsilli fosforillanish tahlili va joyni lokalizatsiya qilish uchun ehtimollikka asoslangan yondashuv". Tabiat biotexnologiyasi. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Olsen QK, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noyabr 2006). "Signalizatsiya tarmoqlarida global, in vivo jonli va saytga xos fosforillanish dinamikasi". Hujayra. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000122257 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000030779 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8595913-5] Sakai Y, Saijo M, Coelho K, Kishino T, Niikava N, Taya Y (noyabr 1995). "retinoblastoma geni mahsuloti bilan bog'langan RBQ-1 (RBBP6) inson oqsilining cDNA ketma-ketligi va xromosomal lokalizatsiyasi". Genomika. 30 (1): 98–101. doi:10.1006 / geno.1995.0017. PMID 8595913.

[pmid16396680-6] Pugh DJ, Ab E, Faro A, Lutya PT, Hoffmann E, Rees DJ (2006 yil fevral). "DWNN, yangi ubikitinga o'xshash domen, RBBP6 ni mRNKni qayta ishlashga va ubikuitinga o'xshash yo'llarga ta'sir qiladi". BMC Strukturaviy Biologiya. 6: 1. doi:10.1186/1472-6807-6-1. PMC 1360078. PMID 16396680.

[entrez-7] "Entrez Gen: RBBP6 retinoblastoma bog'lovchi oqsil 6".

[pmid18851979-8] Chibi M, Meyer M, Skepu A, G Riz DJ, Moolman-Smook JC, Pugh DJ (dekabr 2008). "RBBP6 RING barmoq domeni orqali ko'p funktsional YB-1 oqsil bilan o'zaro ta'sir qiladi, bu esa YB-1ni hamma joyda va proteosomal degradatsiyaga olib keladi". Molekulyar biologiya jurnali. 384 (4): 908–16. doi:10.1016 / j.jmb.2008.09.060. PMID 18851979.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]