SAH riboswitch - SAH riboswitch

S-adenosil-L-homosistein riboswitch
SAH riboswitch ikkilamchi tuzilishi.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SAH_riboswitch
Identifikatorlar
BelgilarSAH_riboswitch
RfamRF01057
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiCis-reg; riboswitch
Domen (lar)Bakteriyalar
SOSO: 0005836
PDB tuzilmalarPDBe

SAH riboswitches bir xil riboswitch bu bog'laydi S-adenosilhomotsistein (SAH).[1] Qachon koenzim S-adenosilmetionin (SAM) a-da ishlatiladi metilatsiya reaktsiya, SAH hosil bo'ladi. SAH riboswitches odatda ko'proq SAM yaratish uchun SAHni qayta ishlashda ishtirok etadigan genlarni tartibga soladi (yoki metabolik jihatdan bog'liq metionin ). Bu, ayniqsa, hujayralarga taalluqlidir, chunki yuqori darajadagi SAH toksik bo'lishi mumkin.[2] Dastlab bioinformatika tomonidan aniqlangan,[3] SAH riboswitches ko'plab turlarda ko'rinadi bakteriyalar, asosan aniq Proteobakteriyalar va Aktinobakteriyalar. An ning atom o'lchamlari uchun 3 o'lchovli tuzilishi SAH riboswitch rentgen kristallografiyasi yordamida hal qilindi.[4]

SAH riboswitchesining ikkinchi darajali tuzilishi. Layout nashr etilgan tasvirda ishlatilganiga o'xshaydi.[1] Ushbu ikkilamchi strukturadagi uchta tayanch jufti noto'g'ri prognoz qilingan, ammo qo'shimcha tayanch jufti yo'qolgan, bu atom rezolyutsiyasi uchinchi tuzilishi tomonidan aniqlangan.[4]

Adabiyotlar

  1. ^ a b Vang JX, Li ER, Morales DR, Lim J, Breaker RR (2008). "S-adenosilhomotsisteinni sezadigan va koenzimni qayta ishlashda ishtirok etgan genlarni faollashtiradigan riboswitches". Mol. Hujayra. 29 (6): 691–702. doi:10.1016 / j.molcel.2008.01.012. PMC  2712820. PMID  18374645.
  2. ^ Ueland PM (1982). "S-adenosilhomotsistein va S-adenosilhomotsistein gidrolazning farmakologik va biokimyoviy jihatlari". Farmakol. Vah. 34 (3): 223–253. PMID  6760211.
  3. ^ Vaynberg Z, Barrik JE, Yao Z va boshq. (2007). "CMfinder qiyosiy genomika quvur liniyasidan foydalangan holda bakteriyalarda 22 nomzod tuzilgan RNKlarni aniqlash". Nuklein kislotalari rez. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC  1950547. PMID  17621584.
  4. ^ a b Edvards AL, Reyes FE, Héroux A, Batey RT (sentyabr 2010). "S-adenosilhomotsisteinni riboswitchlar tomonidan tanib olishning tarkibiy asoslari". RNK. 16 (11): 2144–2155. doi:10.1261 / rna.2341610. PMC  2957054. PMID  20864509.

Tashqi havolalar