SAP130 - SAP130

SAP130
Identifikatorlar
Taxalluslar	SAP130, Sin3A bilan bog'liq bo'lgan oqsil 130
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 609697 MGI: 1919782 HomoloGene: 11577 Generkartalar: SAP130
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 2 (odam)
Oxiri	128,028,120 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 18 (sichqoncha)
Oxiri	31,723,061 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001105 transkripsiya koaktivatori faoliyati; • giston asetiltransferaza faolligi;
Uyali komponent	• hujayra yadrosi; • Sin3 tipidagi kompleks; • yadro zarrasi;
Biologik jarayon	• transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • transkripsiya, DNK-andozali;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	79595
	269003
	ENSG00000136715
	ENSMUSG00000024260
	Q9H0E3
	Q8BIH0
NM_001145928; NM_024545; NM_001330299; NM_001330300; NM_001330301;
	NM_001330302; NM_001330303
	NM_172965; NM_001357554; NM_001357555
NP_001139400; NP_001317228; NP_001317229; NP_001317230; NP_001317231;
	NP_001317232; NP_078821
	NP_766553; NP_001344483; NP_001344484
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SAP130 giston deatsetilaza kompleks subbirligi bu ferment odamlarda kodlanganligi SAP130 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

SAP130 - bu histon deatsetilazning kichik birligi (qarang HDAC1; MIM 601241) -ga bog'liq SIN3A (MIM 607776) korepressor kompleksi (Fleischer va boshq., 2003). [OMIM tomonidan taqdim etilgan]^[7]

O'zaro aloqalar

SAP130 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

CSN1S1,^[8]
CUL2,^[8]
Myc,^[9]
SIN3A,^[6] va
Von Xippel-Lindau o'simtasini bostiruvchi vosita^[8] va

Model organizmlar

Model organizmlar SAP130 funktsiyasini o'rganishda ishlatilgan. Shartli sichqoncha chiziq chaqirildi Sap130^{tm1a (KOMP) Mbp} da hosil bo'lgan Wellcome Trust Sanger instituti.^[10] Erkak va urg'ochi hayvonlar standartlashtirildi fenotipik ekran^[11] o'chirish ta'sirini aniqlash uchun.^[12]^[13]^[14]^[15] Qo'shimcha ekranlar amalga oshirildi: - chuqur immunologik fenotiplash^[16]

*Sap130* sichqonchani fenotipini nokaut qilish
Xarakterli	Fenotip
Barcha ma'lumotlar mavjud.^[11]^[16]
Periferik qon leykotsitlari 6 hafta	Anormal
Insulin	Oddiy
Gematologiya 6 hafta	Oddiy
P14 da gomozigot hayotiyligi	Anormal
Retsessiv halokatli o'rganish	Anormal
Tana vazni	Oddiy
Nevrologik baholash	Oddiy
Qo'l kuchi	Oddiy
Dismorfologiya	Oddiy
Bilvosita kalorimetriya	Anormal
Glyukoza bardoshlik testi	Oddiy
Eshituvchi miya sopi javobi	Oddiy
DEXA	Oddiy
Radiografiya	Oddiy
Ko'z morfologiyasi	Oddiy
Klinik kimyo	Oddiy
Gematologiya 16 hafta	Oddiy
Periferik qon leykotsitlari 16 hafta	Oddiy
Yurakning og'irligi	Oddiy
Salmonella infektsiya	Oddiy
Sitotoksik T hujayralarining funktsiyasi	Oddiy
Dalakni immunofenotiplash	Oddiy
Mezenterik limfa tugunini immunofenotiplash	Oddiy
Suyak iligi immunofenotipini yaratish	Oddiy
Epidermal immunitet tarkibi	Oddiy
Grippga qarshi kurash	Oddiy

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000136715 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024260 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge V, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterxöft A, Beyer A, Koxer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: odamning CDNKlarini kodlaydigan 500 ta yangi to'liq oqsillarni ketma-ketligi va tahlili". Genom tadqiqotlari. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ ^a ^b Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (may 2003). "MSin3A korepressor kompleksining uchta yangi komponentlarini aniqlash va tavsiflash". Molekulyar va uyali biologiya. 23 (10): 3456–67. doi:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. PMC 164750. PMID 12724404.
^ ^a ^b "Entrez Gen: SAP130 Sin3A bilan bog'liq oqsil, 130kDa".
^ ^a ^b ^v Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Vey N (2008). "Sull1-RING ubikuitin ligaza komplekslari bilan SAP130 / SF3b-3 assotsiatsiyasi va uni COP9 signalosomasi bilan tartibga solish". BMC Biokimyo. 9: 1. doi:10.1186/1471-2091-9-1. PMC 2265268. PMID 18173839.
^ Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (may 2003). "c-Myc transformatsion domeni odamning STAGA kompleksini jalb qiladi va transkripsiyani faollashtirish uchun TRRAP va GCN5 asetilaza faolligini talab qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (22): 20405–12. doi:10.1074 / jbc.M211795200. PMC 4031917. PMID 12660246.
^ Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetics Program: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
^ ^a ^b "Xalqaro sichqoncha fenotiplarini konsortsiumi".
^ Skarnes WC, Rozen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell V, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bredli A (iyun 2011). "Sichqon geni funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut manbai". Tabiat. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
^ Dolgin E (iyun 2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
^ Kollinz FS, Rossant J, Vurst V (yanvar 2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Solsbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smith I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (Iyul 2013). "Genom bo'yicha avlod yaratish va nokaut sichqonlarini muntazam ravishda fenotiplash ko'plab genlar uchun yangi rollarni ochib beradi". Hujayra. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.
^ ^a ^b "Infektsiya va immunitetni immunofenotiplash (3i) konsortsiumi".

Qo'shimcha o'qish

Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (Nov 2000). "In vitro joyga xos rekombinatsiya yordamida DNKni klonlash". Genom tadqiqotlari. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000 yil sentyabr). "Keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi bilan aniqlangan yangi oqsillarni tizimli hujayralararo lokalizatsiyasi". EMBO hisobotlari. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Gamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (Iyul 2004). "Inson signalizatsiya yo'lining funktsional proteomik xaritasi". Genom tadqiqotlari. 14 (7): 1324–32. doi:10.1101 / gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Wiemann S, Arlt D, Huber V, Vellenayter R, Shlyeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sultmann H, Poustka A (2004 yil oktyabr). "ORFeome'dan biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom tadqiqotlari. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I, del Val C, Arlt D, Xahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber V, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Yanvar 2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000136715 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000024260 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid11230166-5] Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge V, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterxöft A, Beyer A, Koxer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Inson genlari va oqsillari katalogiga qarab: odamning CDNKlarini kodlaydigan 500 ta yangi to'liq oqsillarni ketma-ketligi va tahlili". Genom tadqiqotlari. 11 (3): 422–35. doi:10.1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

[pmid12724404-6] Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (may 2003). "MSin3A korepressor kompleksining uchta yangi komponentlarini aniqlash va tavsiflash". Molekulyar va uyali biologiya. 23 (10): 3456–67. doi:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. PMC 164750. PMID 12724404.

[entrez-7] "Entrez Gen: SAP130 Sin3A bilan bog'liq oqsil, 130kDa".

[pmid18173839-8] v Menon S, Tsuge T, Dohmae N, Takio K, Vey N (2008). "Sull1-RING ubikuitin ligaza komplekslari bilan SAP130 / SF3b-3 assotsiatsiyasi va uni COP9 signalosomasi bilan tartibga solish". BMC Biokimyo. 9: 1. doi:10.1186/1471-2091-9-1. PMC 2265268. PMID 18173839.

[pmid12660246-9] Liu X, Tesfai J, Evrard YA, Dent SY, Martinez E (may 2003). "c-Myc transformatsion domeni odamning STAGA kompleksini jalb qiladi va transkripsiyani faollashtirish uchun TRRAP va GCN5 asetilaza faolligini talab qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (22): 20405–12. doi:10.1074 / jbc.M211795200. PMC 4031917. PMID 12660246.

[mgp_reference-10] Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetics Program: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.

[IMPCsearch_ref-11] "Xalqaro sichqoncha fenotiplarini konsortsiumi".

[pmid21677750-12] Skarnes WC, Rozen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell V, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bredli A (iyun 2011). "Sichqon geni funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut manbai". Tabiat. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC 3572410. PMID 21677750.

[mouse_library-13] Dolgin E (iyun 2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.

[mouse_for_all_reasons-14] Kollinz FS, Rossant J, Vurst V (yanvar 2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.

[pmid23870131-15] White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Solsbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smith I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (Iyul 2013). "Genom bo'yicha avlod yaratish va nokaut sichqonlarini muntazam ravishda fenotiplash ko'plab genlar uchun yangi rollarni ochib beradi". Hujayra. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC 3717207. PMID 23870131.

[iii_ref-16] "Infektsiya va immunitetni immunofenotiplash (3i) konsortsiumi".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]