SF3B3 - SF3B3

SF3B3
Identifikatorlar
Taxalluslar	SF3B3, RSE1, SAP130, SF3b130, STAF130, biriktiruvchi omil 3b subbirlik 3
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 605592 MGI: 1289341 HomoloGene: 6579 Generkartalar: SF3B3
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	70,577,670 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 8 (sichqoncha)
Oxiri	110,846,787 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish; • nuklein kislota bilan bog'lanish; • GO: 0032403 makromolekulyar kompleksni bog'lash;
Uyali komponent	• katalitik 2-bosqich splitseozoma; • splitseozoma kompleksi; • U12 tipli splitseozomal kompleks; • nukleus; • kichik yadroli ribonukleoprotein kompleksi; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • U2 tipidagi prekatalitik splitseozoma;
Biologik jarayon	• RNK qo'shilishi, transesterifikatsiya reaktsiyalari orqali; • mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali; • mRNKni qayta ishlash; • RNK qo'shilishi; • protein katabolik jarayonining salbiy regulyatsiyasi; • makromolekulyar kompleks birikma;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	23450
	101943
	ENSG00000189091
	ENSMUSG00000033732
	Q15393
	Q921M3
	NM_012426
	NM_133953
	NP_036558
	NP_598714
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Birlashtirish omili 3B subbirlik 3 a oqsil odamlarda kodlanganligi SF3B3 gen.^[5]^[6]

Ushbu gen 3b oqsil kompleksining biriktiruvchi omilining 3-kichik birligini kodlaydi. Splitsing faktor 3b, biriktiruvchi omil 3a va 12S RNK birligi bilan birgalikda U2 kichik yadro ribonukleoproteidlar majmuasini (U2 snRNP) hosil qiladi. 3b / 3a biriktiruvchi omil intronning tarmoqlanish joyidan oldingi mRNKni ketma-ketlikda mustaqil ravishda bog'laydi va U2 snRNP ni mRNK ga qadar bog'lashi mumkin. Splitsing faktor 3b ham kichik U12 tipli splitseozomaning tarkibiy qismidir. Subunit 3 shuningdek STAGA (SPT3-TAF (II) 31-GCN5L asetilaza) transkripsiyasi koaktivatori-HAT (giston asetiltransferaza) kompleksining tarkibiy qismi va TFTC (TATA-bog'lovchi-oqsilsiz TAF (II) - o'z ichiga olgan murakkab). Ushbu komplekslar xromatin modifikatsiyasida, transkripsiyasida, qo'shilishida va DNKni tiklashda ishlashi mumkin.^[6]

O'zaro aloqalar

SF3B3 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan SF3B1,^[5]^[7] Transkripsiyani boshlash oqsil SPT3 gomologi^[8] va TAF9.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000189091 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000033732 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b Das BK; Xia L; Palandjian L; Gozani O; Chyung Y; Reed R (2000 yil fevral). "Splitseozomal oqsillar tarkibidagi SAP 49, 130, 145 va 155 tarkibidagi oqsil kompleksining xarakteristikasi". Mol hujayrasi biol. 19 (10): 6796–802. doi:10.1128 / mcb.19.10.6796. PMC 84676. PMID 10490618.
^ ^a ^b "Entrez Gen: SF3B3 biriktiruvchi omil 3b, kichik birlik 3, 130kDa".
^ Villi, Sindi L; Urlaub Xenning; Axsel Tilmann; Gentzel Mark; Vilm Matias; Lyurmann Raynxard (2002 yil sentyabr). "Yangi SF3b va 17S U2 snRNP oqsillarining xarakteristikasi, shu jumladan inson Prp5p gomologi va SF3b DEAD-box oqsillari". EMBO J. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. ISSN 0261-4189. PMC 126279. PMID 12234937.
^ ^a ^b Martines, E; Palxan V B; Tyernberg A; Lymar E S; Gamper A M; Kundu T K; Chait B T; Roeder R G (2001 yil oktyabr). "Inson STAGA majmuasi - bu mRNK splitsingi va DNKning zarar etkazuvchi omillari bilan o'zaro ta'sir qiluvchi xromatin-asetillovchi transkripsiya koaktivatori". Mol. Hujayra. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99856. PMID 11564863.

Qo'shimcha o'qish

Nomura N, Miyajima N, Sazuka T va boshq. (1995). "Odamning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. I. KG-1 insonning yetilmagan miyeloid hujayra chizig'idan tasodifiy namuna olingan cDNA klonlarini tahlil qilish natijasida chiqarilgan 40 ta yangi genning (KIAA0001-KIAA0040) kodlash ketma-ketliklari". DNK rez. 1 (1): 27–35. doi:10.1093 / dnares / 1.1.27. PMID 7584026.
Nomura N, Miyajima N, Sazuka T va boshq. (1995). "Odamning noma'lum genlarini kodlash ketma-ketligini bashorat qilish. I. Insonning etuk bo'lmagan miyeloid hujayra chizig'i KG-1 (qo'shimcha) dan tasodifiy namuna olingan cDNA klonlarini tahlil qilish natijasida chiqarilgan 40 ta yangi genning (KIAA0001-KIAA0040) kodlash ketma-ketliklari". DNK rez. 1 (1): 47–56. doi:10.1093 / dnares / 1.1.47. PMID 7584028.
Bonaldo MF; Lennon G; Soares MB (1997). "Normallashtirish va ayirish: genlarni kashf etishni osonlashtirish uchun ikkita yondashuv". Genom Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101 / gr.6.9.791. PMID 8889548.
Mintz PJ, Patterson SD, Noyvald AF va boshq. (1999). "Interkromatin granulalari klasterlarini tozalash va biokimyoviy tavsifi". EMBO J. 18 (15): 4308–20. doi:10.1093 / emboj / 18.15.4308. PMC 1171507. PMID 10428969.
Brend M, Moggs JG, Oulad-Abdelganiy M va boshq. (2001). "TFTC kompleksidagi ultrabinafsha nurlari bilan zararlangan DNKni bog'laydigan oqsil DNK zararini aniqlashni nukleosoma asetilatsiyasiga bog'laydi". EMBO J. 20 (12): 3187–96. doi:10.1093 / emboj / 20.12.3187. PMC 150203. PMID 11406595.
Gangloff YG, Pointud JC, Thuault S va boshq. (2001). "TFIID komponentlari inson TAFII140 va Drosophila BIP2 (TAFII155) - bu giston katlam va PHD barmoqlarini o'z ichiga olgan xamirturush TAFII47 ning yangi metazoan homologlari". Mol. Hujayra. Biol. 21 (15): 5109–21. doi:10.1128 / MCB.21.15.5109-5121.2001. PMC 87236. PMID 11438666.
Will CL, Schneider C, MacMillan AM va boshq. (2001). "UR va U11 / U12 snRNP oqsili mRNKdan oldingi filial joyi bilan bog'langan". EMBO J. 20 (16): 4536–46. doi:10.1093 / emboj / 20.16.4536. PMC 125580. PMID 11500380.
Martinez E, Palhan VB, Tjernberg A va boshq. (2001). "Inson STAGA majmuasi - bu mRNK splitsingi va DNKning zarar etkazuvchi omillari bilan o'zaro ta'sir qiluvchi xromatin-asetillovchi transkripsiya koaktivatori". Mol. Hujayra. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. PMC 99856. PMID 11564863.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR va boshq. (2002). "Uch o'lchovli strukturaviy tahlil uchun mos bo'lgan mahalliy splitseozomalarni tozalash va tavsiflash". RNK. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Scott MP, Zappacosta F, Kim EY va boshq. (2002). "Src oilaviy kinaz Hck. Wiskott-Aldrich sindromi oqsili (WASP), WASP bilan o'zaro ta'sir qiluvchi protein (WIP) va ELMO1 uchun yangi SH3 domen ligandlarini aniqlash". J. Biol. Kimyoviy. 277 (31): 28238–46. doi:10.1074 / jbc.M202783200. PMID 12029088.
Will CL, Urlaub H, Achsel T va boshq. (2002). "Yangi SF3b va 17S U2 snRNP oqsillarining xarakteristikasi, shu jumladan inson Prp5p gomologi va SF3b DEAD-box oqsillari". EMBO J. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. PMC 126279. PMID 12234937.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002 yil PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Chavusho‘g‘li N; M tovar belgisi; Tora L; Van Dorsselaer A (2003). "Bir o'lchovli gel elektroforezidan so'ng parvoz massasi spektrometriyasining matritsa yordamida lazer desorbsiyasi / ionlash vaqti bilan aniqlangan TATA bog'lovchi oqsilsiz TAFII o'z ichiga olgan transkripsiya kompleksining yangi kichik bo'linmalari". Proteomika. 3 (2): 217–23. doi:10.1002 / pmic.200390030. PMID 12601814.
Li J, Xokins IC, Harvi CD va boshq. (2003). "SRrp86 va uning o'zaro ta'sir qiluvchi oqsillari tomonidan muqobil qo'shimchani tartibga solish". Mol. Hujayra. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Will CL, Schneider C, Hossbach M va boshq. (2004). "Inson 18S U11 / U12 snRNP tarkibida U2 ga bog'liq splitsozomada mavjud bo'lmagan yangi oqsillar to'plami mavjud". RNK. 10 (6): 929–41. doi:10.1261 / rna.7320604. PMC 1370585. PMID 15146077.
Jin J, Smit FD, Stark C va boshq. (2004). "Sitoskeletal regulyatsiya va uyali aloqada ishtirok etuvchi in vivo 14-3-3 majburiy oqsillarni proteomik, funktsional va domenga asoslangan tahlil qilish". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ewing RM, Chu P, Elisma F va boshq. (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000189091 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000033732 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid10490618-5] Das BK; Xia L; Palandjian L; Gozani O; Chyung Y; Reed R (2000 yil fevral). "Splitseozomal oqsillar tarkibidagi SAP 49, 130, 145 va 155 tarkibidagi oqsil kompleksining xarakteristikasi". Mol hujayrasi biol. 19 (10): 6796–802. doi:10.1128 / mcb.19.10.6796. PMC 84676. PMID 10490618.

[entrez-6] "Entrez Gen: SF3B3 biriktiruvchi omil 3b, kichik birlik 3, 130kDa".

[pmid12234937-7] Villi, Sindi L; Urlaub Xenning; Axsel Tilmann; Gentzel Mark; Vilm Matias; Lyurmann Raynxard (2002 yil sentyabr). "Yangi SF3b va 17S U2 snRNP oqsillarining xarakteristikasi, shu jumladan inson Prp5p gomologi va SF3b DEAD-box oqsillari". EMBO J. 21 (18): 4978–88. doi:10.1093 / emboj / cdf480. ISSN 0261-4189. PMC 126279. PMID 12234937.

[pmid11564863-8] Martines, E; Palxan V B; Tyernberg A; Lymar E S; Gamper A M; Kundu T K; Chait B T; Roeder R G (2001 yil oktyabr). "Inson STAGA majmuasi - bu mRNK splitsingi va DNKning zarar etkazuvchi omillari bilan o'zaro ta'sir qiluvchi xromatin-asetillovchi transkripsiya koaktivatori". Mol. Hujayra. Biol. 21 (20): 6782–95. doi:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99856. PMID 11564863.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]