SNW1 - SNW1

SNW1
Identifikatorlar
Taxalluslar	SNW1, Bx42, NCOA-62, PRPF45, Prp45, SKIIP, SKIP, 1, SKIP1, FUN20 o'z ichiga olgan SNW domeni
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 603055 MGI: 1913604 HomoloGene: 56557 Generkartalar: SNW1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 14 (odam)
Oxiri	77,761,207 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 12 (sichqoncha)
Oxiri	87,472,274 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001106 transkripsiyasi korepressor faoliyati; • GO: 0001105 transkripsiya koaktivatori faoliyati; • yadro gormoni retseptorlari bilan bog'lanish; • Notch majburiy; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • retinoik kislota retseptorlari bilan bog'lanish; • SMAD majburiyligi; • D vitamini retseptorlari bilan bog'lanish; • RNK bilan bog'lanish; • fermentlarni bog'lash; • androgen retseptorlari bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• katalitik 2-bosqich splitseozoma; • yadro matritsasi; • nukleoplazma; • siklin / CDK ijobiy transkripsiyasini uzaytiruvchi omil kompleksi; • splitseozoma kompleksi; • hujayra yadrosi; • yadro tanasi; • mRNKdan keyin ajraladigan splitseozoma kompleksi; • yadro zarrasi; • U2 tipli katalitik 2-bosqich splitseysoma;
Biologik jarayon	• Notch signalizatsiya yo'li; • retinoik kislotaga uyali javob; • o'zgaruvchan o'sish omili beta retseptorlari signalizatsiya yo'lini ijobiy tartibga solish; • p53 sinf mediatori tomonidan DNK zararlanishiga javoban ichki apoptotik signalizatsiya yo'li; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • mRNK qo'shilishini ijobiy tartibga solish, splitseozoma orqali; • retinoik kislota retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani tartibga solish; • mRNKni qayta ishlash; • D vitamini retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi; • neyrogenezning ijobiy regulyatsiyasi; • retinoik kislota retseptorlari signalizatsiya yo'li; • histon H3-K4 metilatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • RNK qo'shilishi; • D vitamini retseptorlari signalizatsiya yo'lining ijobiy regulyatsiyasi; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyani boshlash; • GO: 0022415 virusli jarayon; • transkripsiyaning salbiy regulyatsiyasi, DNK-andozalari; • virusli transkripsiya xosti tomonidan ijobiy tartibga solish; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi; • transkripsiya, DNK-andozali; • mRNK qo'shilishi, splitseozoma orqali; • ikkinchi transesterifikatsiya bosqichi uchun katalitik splitseozoma hosil bo'lishi; • Notch retseptorlari maqsadining transkripsiyasini ijobiy tartibga solish; • Notch signalizatsiya yo'lining ijobiy regulyatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	22938
	66354
	ENSG00000100603
	ENSMUSG00000021039
	Q13573
	Q9CSN1
	NM_012245; NM_001318844
	NM_025507
	NP_001305773; NP_036377
	NP_079783
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

SNW tarkibidagi oqsil 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi SNW1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funktsiya

Ushbu gen, SNW genlar oilasining a'zosi, ba'zi Pol II promouterlaridan transkripsiyani kuchaytiradigan koaktivatorni kodlaydi. Ushbu koaktivator D vitamini retseptorining ligand bilan bog'lanish sohasiga va retinoid retseptorlari bilan D-, retinoik kislota-, estrogen- va glyukokortikoidlar vositasida gen ekspressionini kuchaytirishi mumkin. Shuningdek, u transkripsiya darajasida mushaklarga xos genlarning ekspresiyasini to'g'ridan-to'g'ri boshqarish uchun poli (A) bilan bog'langan oqsil 2 bilan o'zaro aloqada bo'lib, splicing omil sifatida ishlashi mumkin. Va nihoyat, oqsil onkogenezda ishtirok etishi mumkin, chunki u SKI onkoproteidlari o'zgarishi uchun zarur bo'lgan mintaqa bilan o'zaro ta'sir qiladi.^[7]

O'zaro aloqalar

SNW1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000100603 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000021039 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Folk P, Pyta F, Krpejsova L, Blaůskova A, Markos A, Rabino M, Dottin RP (noyabr 1996). "Diktiyosteliya tarkibida aniqlangan xxromatinni bog'lovchi oqsil Bx42 ning homologi". Gen. 181 (1–2): 229–31. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00483-0. PMID 8973337.
^ ^a ^b Baudino TA, Kraichely DM, Jefcoat SC, Winchester SK, Partridge NC, MacDonald PN (iyun 1998). "D vitamini vositachiligida transkripsiyada ishtirok etgan NCoA-62 yangi koaktivator oqsilini ajratish va tavsifi". Biologik kimyo jurnali. 273 (26): 16434–41. doi:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID 9632709.
^ ^a ^b "Entrez Gen: SNW1 SNW domeni 1 ta".
^ ^a ^b ^v ^d Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Hayward SD (Fevral 2000). "CBF1-repressiya qilingan promotorlarni EBNA2 aktivatsiyasida SKIPning roli". Virusologiya jurnali. 74 (4): 1939–47. doi:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. PMC 111672. PMID 10644367.
^ ^a ^b Zhang C, Baudino TA, Dowd DR, Tokumaru H, Vang V, MacDonald PN (noyabr 2001). "D vitamini retseptorlari vositasida transkripsiyada NCoA-62 / tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil va steroid retseptorlari koaktivatorlari o'rtasidagi uchlik komplekslari va kooperativ o'zaro bog'liqlik". Biologik kimyo jurnali. 276 (44): 40614–20. doi:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.
^ ^a ^b ^v Leong GM, Subramaniam N, Figueroa J, Flanagan JL, Hayman MJ, Eisman JA, Kouzmenko AP (may 2001). "Tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil Smad oqsillari bilan o'zaro ta'sirlashib, o'sish omiliga bog'liq bo'lgan beta-transkripsiyani o'zgartiradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (21): 18243–8. doi:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.
^ ^a ^b ^v Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (2000 yil aprel). "SKIP, CBF1 bilan bog'liq bo'lgan protein, NotchIC funktsiyasini engillashtirish uchun NotchIC-ning ankirin takroriy domeni bilan o'zaro ta'sir qiladi". Molekulyar va uyali biologiya. 20 (7): 2400–10. doi:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. PMC 85419. PMID 10713164.
^ Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (iyun 2001). "Notch hujayra ichidagi domenlarda ankirin takrorlanadigan mintaqaning kelib chiqishi HES promouterlik faoliyatini tartibga solish uchun juda muhimdir". Rivojlanish mexanizmlari. 104 (1–2): 3–20. doi:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.
^ Kim YJ, Noguchi S, Hayashi YK, Tsukahara T, Shimizu T, Arahata K (may 2001). "Okulofaringeal mushak distrofiyasi geni mahsuloti, poli (A) bog'laydigan oqsil 2 SKIP bilan o'zaro ta'sir qiladi va mushaklarga xos gen ekspressionini rag'batlantiradi". Inson molekulyar genetikasi. 10 (11): 1129–39. doi:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.
^ Prathapam T, Kühne C, Banks L (Dekabr 2002). "Skip retinoblastoma o'smasi supressori bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning transkripsiyaviy repressiya faolligini inhibe qiladi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 30 (23): 5261–8. doi:10.1093 / nar / gkf658. PMC 137971. PMID 12466551.
^ Prathapam T, Kühne C, Hayman M, Banks L (sentyabr 2001). "Ski Skip evolyutsiyasi saqlanib qolgan SNW domeni bilan o'zaro aloqada". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 29 (17): 3469–76. doi:10.1093 / nar / 29.17.3469. PMC 55893. PMID 11522815.
^ Dahl R, Vani B, Hayman MJ (Mar 1998). "Onkoprote chang'isi Drosophila Bx42 inson homologi Skip bilan o'zaro ta'sir qiladi". Onkogen. 16 (12): 1579–86. doi:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.

Qo'shimcha o'qish

Dahl R, Vani B, Hayman MJ (Mar 1998). "Onkoprote chang'isi Drosophila Bx42 inson homologi Skip bilan o'zaro ta'sir qiladi". Onkogen. 16 (12): 1579–86. doi:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.
Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Hayward SD (Fevral 2000). "CBF1-repressiya qilingan promotorlarni EBNA2 aktivatsiyasida SKIPning roli". Virusologiya jurnali. 74 (4): 1939–47. doi:10.1128 / JVI.74.4.1939-1947.2000. PMC 111672. PMID 10644367.
Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (2000 yil aprel). "SKIP, CBF1 bilan bog'liq bo'lgan protein, NotchIC funktsiyasini engillashtirish uchun NotchIC-ning ankirin takroriy domeni bilan o'zaro ta'sir qiladi". Molekulyar va uyali biologiya. 20 (7): 2400–10. doi:10.1128 / MCB.20.7.2400-2410.2000. PMC 85419. PMID 10713164.
Leong GM, Subramaniam N, Figueroa J, Flanagan JL, Hayman MJ, Eisman JA, Kouzmenko AP (may 2001). "Tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil Smad oqsillari bilan o'zaro ta'sirlashib, o'sish omiliga bog'liq bo'lgan beta-transkripsiyani o'zgartiradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (21): 18243–8. doi:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.
Kim YJ, Noguchi S, Hayashi YK, Tsukahara T, Shimizu T, Arahata K (may 2001). "Okulofaringeal mushak distrofiyasi geni mahsuloti, poli (A) bog'laydigan oqsil 2 SKIP bilan o'zaro ta'sir qiladi va mushaklarga xos gen ekspressionini rag'batlantiradi". Inson molekulyar genetikasi. 10 (11): 1129–39. doi:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.
Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (iyun 2001). "Notch hujayra ichidagi domenlarda ankirin takrorlanadigan mintaqaning kelib chiqishi HES promouterlik faoliyatini tartibga solish uchun juda muhimdir". Rivojlanish mexanizmlari. 104 (1–2): 3–20. doi:10.1016 / S0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.
Chjou S, Xeyvard SD (sentyabr 2001). "CBF1 ning yadroviy lokalizatsiyasi SMRT korepressor kompleksi bilan o'zaro aloqalar bilan tartibga solinadi". Molekulyar va uyali biologiya. 21 (18): 6222–32. doi:10.1128 / MCB.21.18.6222-6232.2001. PMC 87339. PMID 11509665.
Zhang C, Baudino TA, Dowd DR, Tokumaru H, Vang V, MacDonald PN (noyabr 2001). "D vitamini retseptorlari vositasida transkripsiyada NCoA-62 / tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil va steroid retseptorlari koaktivatorlari o'rtasidagi uchlik komplekslari va kooperativ o'zaro bog'liqlik". Biologik kimyo jurnali. 276 (44): 40614–20. doi:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.
Prathapam T, Kühne C, Hayman M, Banks L (sentyabr 2001). "Ski Skip evolyutsiyasi saqlanib qolgan SNW domeni bilan o'zaro aloqada". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 29 (17): 3469–76. doi:10.1093 / nar / 29.17.3469. PMC 55893. PMID 11522815.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Mur MJ (2002 yil aprel). "Uch o'lchovli strukturaviy tahlil uchun mos bo'lgan mahalliy splitseozomalarni tozalash va tavsiflash". RNK. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Wardell SE, Boonyaratanakornkit V, Adelman JS, Aronheim A, Edwards DP (Avgust 2002). "Jun dimerizatsiyasi oqsili 2 progesteron retseptorlari N-terminalli domen koaktivatori vazifasini bajaradi". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (15): 5451–66. doi:10.1128 / MCB.22.15.5451-5466.2002. PMC 133955. PMID 12101239.
Prathapam T, Kühne C, Banks L (Dekabr 2002). "Skip retinoblastoma o'smasi supressori bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning transkripsiyaviy repressiya faolligini inhibe qiladi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 30 (23): 5261–8. doi:10.1093 / nar / gkf658. PMC 137971. PMID 12466551.
Petersen XH, Xilpert J, Milits D, Zandler V, Jeykobsen S, Ribroek AJ, Uillnu TE (Fevral 2003). "Megalinning megalinbinding protein (MegBP) bilan funktsional o'zaro ta'siri, yangi tetratrico peptid takroriy o'z ichiga olgan adapter molekulasi". Hujayra fanlari jurnali. 116 (Pt 3): 453-61. doi:10.1242 / jcs.00243. PMID 12508107.
Barry JB, Leong GM, Church WB, Issa LL, Eisman JA, Gardiner EM (Mar 2003). "SKIP / NCoA-62, TFIIB va retinoid X retseptorlarining D vitamini retseptorlari spirali H10 qoldiqlari bilan o'zaro ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 278 (10): 8224–8. doi:10.1074 / jbc.C200712200. PMID 12529369.
Zhang C, Dowd DR, Staal A, Gu C, Lian JB, van Wijnen AJ, Stein GS, MacDonald PN (2003 yil sentyabr). "Yadro koaktivatori-62 kDa / chang'i bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil - bu D vitamini retseptorlari vositasida transkripsiyasini va RNK qo'shilishini birlashtiradigan yadro matritsasi bilan bog'liq koaktivator". Biologik kimyo jurnali. 278 (37): 35325–36. doi:10.1074 / jbc.M305191200. PMID 12840015.
Leong GM, Subramaniam N, Issa LL, Barry JB, Kino T, Driggers PH, Hayman MJ, Eisman JA, Gardiner EM (Mar 2004). "N-CoR / SMRT va p300 bilan o'zaro aloqada bo'lgan ikki tomonlama yadro retseptorlari yadro regulyatori bo'lgan chang'i bilan ta'sir qiluvchi oqsil". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 315 (4): 1070–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.02.004. PMID 14985122.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000100603 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000021039 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid8973337-5] Folk P, Pyta F, Krpejsova L, Blaůskova A, Markos A, Rabino M, Dottin RP (noyabr 1996). "Diktiyosteliya tarkibida aniqlangan xxromatinni bog'lovchi oqsil Bx42 ning homologi". Gen. 181 (1–2): 229–31. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00483-0. PMID 8973337.

[pmid9632709-6] Baudino TA, Kraichely DM, Jefcoat SC, Winchester SK, Partridge NC, MacDonald PN (iyun 1998). "D vitamini vositachiligida transkripsiyada ishtirok etgan NCoA-62 yangi koaktivator oqsilini ajratish va tavsifi". Biologik kimyo jurnali. 273 (26): 16434–41. doi:10.1074 / jbc.273.26.16434. PMID 9632709.

[entrez-7] "Entrez Gen: SNW1 SNW domeni 1 ta".

[pmid10644367-8] v ^d Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Hayward SD (Fevral 2000). "CBF1-repressiya qilingan promotorlarni EBNA2 aktivatsiyasida SKIPning roli". Virusologiya jurnali. 74 (4): 1939–47. doi:10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000. PMC 111672. PMID 10644367.

[pmid11514567-9] Zhang C, Baudino TA, Dowd DR, Tokumaru H, Vang V, MacDonald PN (noyabr 2001). "D vitamini retseptorlari vositasida transkripsiyada NCoA-62 / tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil va steroid retseptorlari koaktivatorlari o'rtasidagi uchlik komplekslari va kooperativ o'zaro bog'liqlik". Biologik kimyo jurnali. 276 (44): 40614–20. doi:10.1074 / jbc.M106263200. PMID 11514567.

[pmid11278756-10] v Leong GM, Subramaniam N, Figueroa J, Flanagan JL, Hayman MJ, Eisman JA, Kouzmenko AP (may 2001). "Tosh bilan o'zaro ta'sir qiluvchi oqsil Smad oqsillari bilan o'zaro ta'sirlashib, o'sish omiliga bog'liq bo'lgan beta-transkripsiyani o'zgartiradi". Biologik kimyo jurnali. 276 (21): 18243–8. doi:10.1074 / jbc.M010815200. PMID 11278756.

[pmid10713164-11] v Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (2000 yil aprel). "SKIP, CBF1 bilan bog'liq bo'lgan protein, NotchIC funktsiyasini engillashtirish uchun NotchIC-ning ankirin takroriy domeni bilan o'zaro ta'sir qiladi". Molekulyar va uyali biologiya. 20 (7): 2400–10. doi:10.1128 / mcb.20.7.2400-2410.2000. PMC 85419. PMID 10713164.

[pmid11404076-12] Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (iyun 2001). "Notch hujayra ichidagi domenlarda ankirin takrorlanadigan mintaqaning kelib chiqishi HES promouterlik faoliyatini tartibga solish uchun juda muhimdir". Rivojlanish mexanizmlari. 104 (1–2): 3–20. doi:10.1016 / s0925-4773 (01) 00373-2. PMID 11404076.

[pmid11371506-13] Kim YJ, Noguchi S, Hayashi YK, Tsukahara T, Shimizu T, Arahata K (may 2001). "Okulofaringeal mushak distrofiyasi geni mahsuloti, poli (A) bog'laydigan oqsil 2 SKIP bilan o'zaro ta'sir qiladi va mushaklarga xos gen ekspressionini rag'batlantiradi". Inson molekulyar genetikasi. 10 (11): 1129–39. doi:10.1093 / hmg / 10.11.1129. PMID 11371506.

[pmid12466551-14] Prathapam T, Kühne C, Banks L (Dekabr 2002). "Skip retinoblastoma o'smasi supressori bilan o'zaro ta'sir qiladi va uning transkripsiyaviy repressiya faolligini inhibe qiladi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 30 (23): 5261–8. doi:10.1093 / nar / gkf658. PMC 137971. PMID 12466551.

[pmid11522815-15] Prathapam T, Kühne C, Hayman M, Banks L (sentyabr 2001). "Ski Skip evolyutsiyasi saqlanib qolgan SNW domeni bilan o'zaro aloqada". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 29 (17): 3469–76. doi:10.1093 / nar / 29.17.3469. PMC 55893. PMID 11522815.

[pmid9569025-16] Dahl R, Vani B, Hayman MJ (Mar 1998). "Onkoprote chang'isi Drosophila Bx42 inson homologi Skip bilan o'zaro ta'sir qiladi". Onkogen. 16 (12): 1579–86. doi:10.1038 / sj.onc.1201687. PMID 9569025.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]