SNX5 - SNX5

SNX5
Mavjud tuzilmalar
PDBOrtholog qidiruvi: PDBe RCSB
Identifikatorlar
TaxalluslarSNX5, nexin 5 ni saralash
Tashqi identifikatorlarOMIM: 605937 MGI: 1916428 HomoloGene: 40944 Generkartalar: SNX5
Gen joylashuvi (odam)
20-xromosoma (odam)
Chr.20-xromosoma (odam)[1]
20-xromosoma (odam)
SNX5 uchun genomik joylashuv
SNX5 uchun genomik joylashuv
Band20p11.23Boshlang17,941,597 bp[1]
Oxiri17,968,980 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
PBB GE SNX5 217792 da fs.png
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_152227
NM_001282454
NM_014426

NM_001199188
NM_024225

RefSeq (oqsil)

NP_001269383
NP_055241
NP_689413

NP_001186117
NP_077187

Joylashuv (UCSC)Chr 20: 17.94 - 17.97 MbChr 2: 144.25 - 144.27 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Neksin-5ni saralash a oqsil odamlarda kodlanganligi SNX5 gen.[5][6][7]

Ushbu gen. A'zosini kodlaydi nexinni saralash oila. Ushbu oila a'zolari fosfoinositidni bog'laydigan domen bo'lgan foks (PX) domenini o'z ichiga oladi va hujayra ichidagi odam savdosi bilan shug'ullanadi. Ushbu protein sutemizuvchining tarkibiy qismidir retromer murakkab,[6] bu yukni olishni osonlashtiradi endosomalar uchun Golgi tarmog'i. Bilan bog'lab turishi ham ko'rsatilgan Fankoni anemiyasi, komplementatsiya guruhi A oqsil. Ushbu gen bir xil oqsilni kodlovchi ikkita transkript variantiga olib keladi.[7]

Model organizmlar

Model organizmlar SNX5 funktsiyasini o'rganishda ishlatilgan. Shartli sichqoncha chiziq, chaqirildi Snx5tm1a (KOMP) Vtsi[13][14] ning bir qismi sifatida yaratilgan Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi Dastur - kasallikning hayvon modellarini yaratish va manfaatdor olimlarga tarqatish bo'yicha yuqori darajadagi mutagenez loyihasi Wellcome Trust Sanger instituti.[15][16][17] Erkak va urg'ochi hayvonlar standartlashtirildi fenotipik ekran o'chirish ta'sirini aniqlash uchun.[11][18] Yigirma beshta sinov o'tkazildi bir jinsli mutant kattalar sichqonlari, ammo sezilarli darajada anormallik kuzatilmagan.[11]

O'zaro aloqalar

SNX5 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan FANKA.[5]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000089006 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000027423 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b Otsuki T; Kajigaya S; Ozawa K; Liu JM (2000 yil yanvar). "SNX5, saralash nexinlar oilasining yangi a'zosi, Fanconi anemiya komplementatsiya guruhi A oqsili bilan bog'lanadi". Biokimyo Biofiz Res Commun. 265 (3): 630–5. doi:10.1006 / bbrc.1999.1731. PMID  10600472.
  6. ^ a b Wassmer T; Attar N; Bujny MV; Okli J; Traer CJ; Kullen PJ (2006 yil dekabr). "Yo'qotilgan ekran SNX5 va SNX6 ni sutemizuvchilar retromerining potentsial komponentlari sifatida aniqlaydi". J Uyali ilmiy ish. 120 (Pt 1): 45-54. doi:10.1242 / jcs.03302. PMID  17148574.
  7. ^ a b "Entrez Gen: SNX5 nexin 5 ni saralash".
  8. ^ "Snx5 uchun gematologiya ma'lumotlari". Wellcome Trust Sanger instituti.
  9. ^ "Salmonella Snx5 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
  10. ^ "Sitrobakter Snx5 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
  11. ^ a b v Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetika dasturi: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88 (S248): 0. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ Sichqoncha resurslari portali, Wellcome Trust Sanger instituti.
  13. ^ "Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi".
  14. ^ "Sichqoncha genomining informatikasi".
  15. ^ Skarnes, VC.; Rozen, B.; G'arbiy, A. P .; Koutsourakis, M .; Bushell, V .; Iyer, V .; Muxika, A. O .; Tomas, M.; Xarrou, J .; Koks, T .; Jekson, D.; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Nefedov, M.; De Yong, P. J.; Styuart, A. F.; Bredli, A. (2011). "Sichqon geni funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut manbai". Tabiat. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  16. ^ Dolgin E (iyun 2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  17. ^ Kollinz FS; Rossant J; Wurst V (yanvar 2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  18. ^ van der Veyden L; Oq JK; Adams DJ; Logan DW (2011). "Sichqoncha genetikasi uchun asboblar to'plami: funktsiyasi va mexanizmini ochib berish". Genom Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.

Qo'shimcha o'qish