SSR4 - SSR4

SSR4
Identifikatorlar
Taxalluslar	SSR4, TRAPD, CDG1Y, signal ketma-ketligi retseptorlari subbirligi 4
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 300090 MGI: 1099464 HomoloGene: 4573 Generkartalar: SSR4
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	X xromosoma (odam)
Oxiri	153,798,499 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	X xromosoma (sichqoncha)
Oxiri	73,790,830 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
	6748
	20832
	ENSG00000180879
	ENSMUSG00000002014
	P51571
	62186
	NM_001204526; NM_001204527; NM_006280
	NM_001166480; NM_009279; NM_001358212; NM_001358213
	NP_001191455; NP_001191456; NP_006271
	NP_001159952; NP_033305; NP_001345141; NP_001345142
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Translokon bilan bog'liq oqsil subbirligi deltasi a oqsil odamlarda kodlanganligi SSR4 gen.^[5]^[6]

SSR4, shuningdek, TRAPD deb ataladi, unda ishtirok etgan deb taxmin qilinadi oqsil sekretsiyasi. U joylashgan Xq28 bilan ixcham tarzda boshma-bosh joylashtirilgan mintaqa IDH3G gen. Ushbu ikkita gen ikki tomonlama yo'naltirilgan targ'ibotchi ular orasida joylashgan va bir-biriga bog'liq bo'lmagan oqsillarni kodlaydi biokimyoviy yo'llar hujayraning turli bo'limlarida joylashgan. Transkripsiyalanmagan intergenik mintaqa atigi 133 bp ni ifodalaydi va a ga joylashtirilgan CpG oroli. CpG oroli boshlash uchun ikki tomonlama promouter vazifasini bajaradi transkripsiya funktsional jihatdan bir-biriga bog'liq bo'lmagan ikkala genning ajralib turishi ifoda naqshlar. SSR4 oltitadan iborat exons va ALD geni uchun taxminan 70 kb telomerikdir. Garchi muqobil qo'shish ekzon 5 ning SSRSda aniqlanmagan, odam ekzoni 5 bilan gomologik bo'lgan mintaqa yo'qolgan transkript variantlari ikkalasida ham aniqlangan Ksenopus laevis va Muskul mushak.^[6]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000180879 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000002014 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Brenner V, Nyakatura G, Rosenthal A, Platzer M (noyabr 1997). "Odamning Xq28-da ikkita yangi genning genomik tashkil etilishi: IDH gamma va TRAP deltasining ixcham boshdan boshgacha joylashishi kalamush va sichqonchada saqlanadi". Genomika. 44 (1): 8–14. doi:10.1006 / geno.1997.4822. PMID 9286695.
^ ^a ^b "Entrez Gen: SSR4 signal ketma-ketligini qabul qiluvchi, delta (translokon bilan bog'liq oqsil deltasi)".

Qo'shimcha o'qish

Holthuis JC, van Riel MC, Martens GJ (1996). "Translokon bilan bog'liq bo'lgan TRAP deltasi va yangi TRAPga o'xshash oqsil Xenopus oraliq gipofizidagi pro-opiomelanokortin bilan muvofiqlashtirilgan". Biokimyo. J. 312 (Pt 1) (Pt 1): 205-13. doi:10.1042 / bj3120205. PMC 1136246. PMID 7492314.
Hartmann E, Görlich D, Kostka S va boshq. (1993). "Endoplazmatik to'rdagi membrana oqsillarining tetramerik kompleksi". Yevro. J. Biokimyo. 214 (2): 375–81. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17933.x. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-3BD2-F. PMID 7916687.
Vang L, Dobberstayn B (1999). "Endoplazmik retikulum membranasi bo'ylab oqsillarni translokatsiyasida ishtirok etadigan oligomerik komplekslar". FEBS Lett. 457 (3): 316–22. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01075-3. PMID 10471800.
Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In vitro saytga xos rekombinatsiyadan foydalangan holda DNKni klonlash". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Miyazaki K, Fujita T, Ozaki T va boshq. (2004). "NEDL1, parchalangan-1 uchun yangi ubiqitin-oqsil izopeptid ligaz, mutant superoksid dismutaz-1ni nishonga oladi". J. Biol. Kimyoviy. 279 (12): 11327–35. doi:10.1074 / jbc.M312389200. PMID 14684739.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Vang Z, VandeBerg JL (2005). "Monodelphis TRAPD odam orlogiyasini ultrafiolet B tomonidan indikatsiya qilingan melanomada klonlash va molekulyar tavsifi". Melanoma rez. 14 (2): 107–14. doi:10.1097/00008390-200404000-00005. PMID 15057039.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber V va boshqalar. (2004). "ORFeome'dan Biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom Res. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I va boshq. (2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalari rez. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Ewing RM, Chu P, Elisma F va boshq. (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Ushbu maqola gen insonga X xromosoma va / yoki unga tegishli oqsil a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000180879 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000002014 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid9286695-5] Brenner V, Nyakatura G, Rosenthal A, Platzer M (noyabr 1997). "Odamning Xq28-da ikkita yangi genning genomik tashkil etilishi: IDH gamma va TRAP deltasining ixcham boshdan boshgacha joylashishi kalamush va sichqonchada saqlanadi". Genomika. 44 (1): 8–14. doi:10.1006 / geno.1997.4822. PMID 9286695.

[entrez-6] "Entrez Gen: SSR4 signal ketma-ketligini qabul qiluvchi, delta (translokon bilan bog'liq oqsil deltasi)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]