SYTL1 - SYTL1

SYTL1
Identifikatorlar
TaxalluslarSYTL1, JFC1, SLP1, sinaptotagmin 1 kabi
Tashqi identifikatorlarOMIM: 608042 MGI: 1933365 HomoloGene: 12853 Generkartalar: SYTL1
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
SYTL1 uchun genomik joylashuv
SYTL1 uchun genomik joylashuv
Band1p36.11Boshlang27,342,020 bp[1]
Oxiri27,353,937 bp[1]
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001193308
NM_032872

NM_031393

RefSeq (oqsil)

NP_001180237
NP_116261

n / a

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 27.34 - 27.35 MbChr 4: 133.25 - 133.26 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

Sinaptotagminga o'xshash protein 1 a oqsil odamlarda kodlanganligi SYTL1 gen.[5][6]


Model organizmlar

Model organizmlar SYTL1 funktsiyasini o'rganishda ishlatilgan. Shartli sichqoncha chiziq, chaqirildi Sytl1tm1a (KOMP) Vtsi[15][16] ning bir qismi sifatida yaratilgan Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi Dastur - kasallikning hayvon modellarini yaratish va manfaatdor olimlarga tarqatish uchun yuqori samaradorlikdagi mutagenez loyihasi.[17][18][19]

Erkak va urg'ochi hayvonlar standartlashtirildi fenotipik ekran o'chirish ta'sirini aniqlash uchun.[13][20] Yigirma to'rtta test gomozigot bo'yicha o'tkazildi mutant sichqonlar va oltita muhim anormallik kuzatildi.[13] Ayollarda lokomotorlarning g'ayritabiiy koordinatsiyasi, kaudal vertebra o'zgarishi, qon aylanishining pasayishi kuzatilgan amilaza darajalar va ortgan o'rtacha trombotsit hajmi. Ko'rsatilgan ikkala jins ham kamaydi IgG 2b darajalari va g'ayritabiiy periferik qon limfotsit parametrlar.[13]

O'zaro aloqalar

SYTL1 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan RAB27A.[21][22][23]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000142765 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000028860 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Catz SD, Babior BM, Jonson JL (noyabr 2002). "JFC1 transkripsiyaviy ravishda yadro omil-kappaB bilan faollashadi va prostata karsinom hujayralarida o'sma nekrozi omil alfa bilan regulyatsiya qilinadi". Biokimyoviy jurnal. 367 (Pt 3): 791-9. doi:10.1042 / BJ20020345. PMC  1222920. PMID  12137562.
  6. ^ "Entrez Gene: SYTL1 synaptotagmin-like 1".
  7. ^ "Sytl1 uchun rentgenografiya ma'lumotlari". Wellcome Trust Sanger instituti.
  8. ^ "Sytl1 uchun kimyoviy kimyo ma'lumotlari". Wellcome Trust Sanger instituti.
  9. ^ "Sytl1 uchun gematologiya ma'lumotlari". Wellcome Trust Sanger instituti.
  10. ^ "Sytl1 uchun periferik qon limfotsitlari ma'lumotlari". Wellcome Trust Sanger instituti.
  11. ^ "Salmonella Sytl1 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
  12. ^ "Sitrobakter Sytl1 uchun infektsiya ma'lumotlari ". Wellcome Trust Sanger instituti.
  13. ^ a b v d Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetika dasturi: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  14. ^ Sichqoncha resurslari portali, Wellcome Trust Sanger instituti.
  15. ^ "Xalqaro nokaut sichqonchasi konsortsiumi".
  16. ^ "Sichqoncha genomining informatikasi".
  17. ^ Skarnes WC, Rozen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell V, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bredli A (iyun 2011). "Sichqon geni funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut manbai". Tabiat. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  18. ^ Dolgin E (iyun 2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  19. ^ Kollinz FS, Rossant J, Vurst V (yanvar 2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  20. ^ van der Veyden L, Uayt JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "Sichqoncha genetikasi uchun asboblar to'plami: funktsiyasi va mexanizmini ochib berish". Genom biologiyasi. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC  3218837. PMID  21722353.
  21. ^ Fukuda M (2003 yil aprel). "Slp4-a / granuphilin-a PC12 hujayralaridagi Rab27A ning YaIMga bog'langan shakli bilan o'zaro ta'sir qilish orqali zich yadroli pufak ekzotsitozini inhibe qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (17): 15390–6. doi:10.1074 / jbc.M213090200. PMID  12590134.
  22. ^ Strom M, Xyum AN, Tarafder AK, Barkagianni E, Seabra MC (iyul 2002). "Rab27 bilan bog'langan oqsillar oilasi. Melanofilin Rab27a va miyozin Va ni bog'laydi, melanosoma tashishda". Biologik kimyo jurnali. 277 (28): 25423–30. doi:10.1074 / jbc.M202574200. PMID  11980908.
  23. ^ Kuroda TS, Fukuda M, Ariga H, Mikoshiba K (mart 2002). "Sinaptotagminga o'xshash 1-4 va Slac2 oqsillarining Slp homologiyasi yangi Rab27A majburiy domeni sifatida ishlaydi". Biologik kimyo jurnali. 277 (11): 9212–8. doi:10.1074 / jbc.M112414200. PMID  11773082.

Qo'shimcha o'qish