SecA - SecA
 | Bu maqola uchun qo'shimcha iqtiboslar kerak tekshirish. (2017 yil oktyabr) (Ushbu shablon xabarini qanday va qachon olib tashlashni bilib oling) |
| Eubakterial oqsil translokaza subbirligi SecA | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatorlar | |||||||||||
| Belgilar | SecA | ||||||||||
| Pfam | PF07517 | ||||||||||
| |||||||||||
The SecA oqsili a hujayra membranasi bog'liq subunit eubakterial Sek yoki II tur sekretor yo'li, hujayra membranasi orqali oqsillarni chiqarilishiga mas'ul bo'lgan tizim. Ushbu tizim ichida SecA an funktsional xususiyatlariga ega ATPase va harakatini kuchaytirish uchun talab qilinadi oqsil substrat bo'ylab translokon kanali.
Translokaza tizimi funktsional ravishda markazlashtirilgan bir qator oqsillarni o'z ichiga oladi translokon kanali bakteriyalarning sitoplazmatik membranasi orqali oqsillarni eksport qilishda va ularning kiritilishida vositachilik qiladi membrana oqsillari unga. Tanlangan yo'nalish marshrutidan qat'i nazar, preprotein oxir-oqibat sitoplazmatik membranaga etib boradi va translokaza bilan aloqa qiladi. Ushbu translokaza periferik membranadan iborat ATPase SecA va o'zi oqsillardan tashkil topgan translokbon membrana kanali Yashirin, Xavfsiz va SecG. SecA tarkibidagi konformatsion o'zgarishlar uning ta'siridir ATP-gidrolizlash xulq-atvori va ehtimol bosqichma-bosqich eksport qilinishiga olib keladi preprotein orqali substrat SecYEG kanali.[1]
Tuzilishi
SecA bu murakkab protein bo'lib, uning tuzilishi oltitadan iborat domenlar SecA ning substratlarni bog'lash va ularni siljitish imkoniyatlarini tushuntirishi mumkin. Hozirgacha tarkibiy tahlil qilingan barcha SecA oqsillarida quyidagi beshta domen mavjud.[2]
O'lik motor domeni
Bu aminokislota domen ikkiga bo'linadi nukleotid majburiy burmalar 1 va 2 (NBF1 va NBF2) bu erda ATP bog'langan va gidrolizlangan. Fosfodiester bog'lanishidagi kimyoviy energiya konformatsion o'zgarishga olib keladi va bu boshqa domenlarga (ayniqsa, HWD va PPXD natijada mexanik ravishda harakatlanadigan domenlar) preprotein membrana bo'ylab. Biroq, ushbu konformatsion o'zgarishlar qisman boshqalari tomonidan tartibga solinadi protomer quyida tavsiflangan domenlar.
C-terminal bog'lovchi domeni
Bilan bog'lanish qobiliyati SecB chaperone davomida tarjimadan keyingi translokatsiya, ribosoma (translyatsiyadan keyingi translokatsiya paytida ham, trans-translyatsiya paytida ham [3]) va fosfolipid ikkilamchi SecA ishlashi uchun juda muhim va unga C-terminal bog'lovchi domeni erishadi.[4]
Vertikal qanotli domen (HWD)
Molekulaning C-terminal qismida joylashgan ushbu domen HSD va PPXD domenlari bilan aloqada. Ehtimol, u molekulyar konformatsion harakatni o'tkazishda muhim rol o'ynaydi, u o'zi qabul qiladi HSD va ATP gidrolizidan kelib chiqadigan O'lik motor domeni, uchun PPXD domen.
Peptidli o'zaro bog'liqlik domeni (PPXD)
SecA-ning muhim vazifasi - transport preprotein membrana bo'ylab aslida bog'lanish qobiliyati preprotein berilishi kerak. PPXD domeni bu funktsiyani substratni bog'lashda bajaradi.
Vertikal iskala domeni (HSD)
Ushbu domen SecA markazida joylashgan protomer va orqali aloqalar a-spiral boshqa subdomenlarning o'zaro ta'siri. Bundan tashqari, u tarkibida ATP gidroliz 1 (IRA1) subdomainining molekula ichidagi regulyatori mavjud bo'lib, SecA SecYEG bilan bog'lanmaganida keraksiz ATP gidrolizining oldini oladi. IRA1 bilan birgalikda keraksiz konformatsion o'zgarishlarning oldini olish uchun Gate 1 deb nomlangan konservalangan tuz ko'prigi ishlashi mumkin. Darvoza 1 nukleotidni funktsional ravishda bog'laydigan ko'rinadi (ATP ) ning majburiy joyi O'lik motor domeni bilan PPXD ATP gidrolizining regulyatsiyasiga olib keladigan domen preprotein majburiy. Biroq, bu muvofiqlashtiruvchi xatti-harakatlar faqat SecA SecYEG bilan bog'langanda sodir bo'lishi ko'rsatildi.[5]
Adabiyotlar
- ^ du Plessis DJ, Nouven N, Driessen AJ (2011 yil mart). "Xavfsiz translokaza". Biochimica et Biofhysica Acta (BBA) - Biomembranalar. 1808 (3): 851–65. doi:10.1016 / j.bbamem.2010.08.016. PMID 20801097.
- ^ Kusters I, Driessen AJ (iyun 2011). "SecA, ajoyib nanomasina". Uyali va molekulyar hayot haqidagi fanlar. 68 (12): 2053–66. doi:10.1007 / s00018-011-0681-y. PMC 3101351. PMID 21479870.
- ^ Vang, Shuay; Jomaa, Ahmad; Jaskolovskiy, Mateush; Yang, Chien-I .; Ban, Nenad; Shan, Shu-ou (oktyabr 2019). "SecA tomonidan kotranslatsion membrana oqsillarini tanib olish va yo'naltirishning molekulyar mexanizmi". Tabiatning strukturaviy va molekulyar biologiyasi. 26 (10): 919–929. doi:10.1038 / s41594-019-0297-8. ISSN 1545-9985. PMC 6858539. PMID 31570874.
- ^ Jamshad, Muhammad; Bils, Timoti J; Oq, Skott A; Uord, Duglas G; Muhammad, Fiyoz; Rahmon, Kazi Fahmida; Vayn, Maks; Xyuz, Garet V; Kramer, Gyunter; Bukau, Bernd; Xuber, Deymon (2019-06-27). Xegde, Ramanujan S; Kuriyan, Jon (tahrir). "ATPase SecA bakterial translokatsiyasining C-terminal dumi uning faoliyatini modulyatsiya qiladi". eLife. 8: e48385. doi:10.7554 / eLife.48385. ISSN 2050-084X. PMC 6620043. PMID 31246174.
- ^ Karamanou S, Gouridis G, Papanikou E, Sianidis G, Gelis I, Keramisanou D, Vrontou E, Kalodimos CG, Economou A (iyun 2007). "SecA ning helikaz motoridagi preprotein bilan boshqariladigan kataliz". EMBO jurnali. 26 (12): 2904–14. doi:10.1038 / sj.emboj.7601721. PMC 1894763. PMID 17525736.