Solvatsiya qobig'i - Solvation shell

A ning birinchi solvatsiya qobig'i natriy ion suvda erigan

A solvatsiya qobig'i har qanday narsaning hal qiluvchi interfeysi kimyoviy birikma yoki tashkil etuvchi biomolekula erigan. Qachon erituvchi bo'ladi suv u ko'pincha a deb nomlanadi hidratsiya qobig'i yoki hidratsiya sferasi. Erigan moddaning har bir birligini o'rab turgan hal qiluvchi molekulalarining soni hidratsiya raqami erigan moddaning

Klassik misol, suv molekulalari metall ioni atrofida joylashganida. Masalan, agar ikkinchisi kation bo'lsa, the elektr manfiy suv molekulasining kislorod atomi metall ionidagi musbat zaryadga elektrostatik ravishda jalb qilingan bo'lar edi. Natijada, ionni o'rab turgan suv molekulalarining solvatsion qobig'i. Ushbu qobiq ionning zaryadiga, uning tarqalishiga va fazoviy o'lchamlariga bog'liq bo'lgan bir necha qalin molekulalar bo'lishi mumkin.

Erituvchi molekulalarining bir qismi erituvchi tarkibidagi eritilgan tuzdan olingan anionlar va kationlar atrofidagi solvatlanish qobig'ida ishtirok etadi. Suvli eritmalardagi metall ionlari shakl metall akvokomplekslar. Ushbu raqamni siqish va NMR o'lchovlari kabi turli xil usullar bilan aniqlash mumkin.

Elektrolitning faollik koeffitsienti va uning solvatsiya qobig'i raqami bilan bog'liqligi

Eritilgan elektrolitning solvatsion qobig'i sonini ning statistik komponentiga bog'lash mumkin faoliyat koeffitsienti elektrolitlar va kontsentrlangan eritmadagi erigan elektrolitning ko'rinadigan molyar hajmi va erituvchining (suv) molyar hajmi o'rtasidagi nisbatga:

[1]

Oqsillarning gidratatsion qobiqlari

Oqsillar atrofida hosil bo'ladigan gidratatsiya qobig'i (ba'zan uni gidratatsiya qatlami ham deyiladi) biokimyoda alohida ahamiyatga ega. Oqsil sathining atrofdagi suv bilan o'zaro ta'siri ko'pincha oqsil hidratsiyasi deb ataladi va oqsil faoliyati uchun asos bo'ladi.[2] Oqsil atrofidagi gidratatsiya qatlami quyma suvdan 1 nm masofaga qadar bo'lgan dinamikaga ega ekanligi aniqlandi. Muayyan suv molekulasining oqsil yuzasi bilan aloqa qilish muddati subnanosekundiya oralig'ida bo'lishi mumkin molekulyar dinamikasi simulyatsiyalar suvning tashqi ko'p miqdordagi suv bilan aralashtirishdan oldin hidratsiya qobig'ida sarflagan vaqtini femtosekundadan pikosekundagacha bo'lishini ko'rsatadi.[2]

Boshqa erituvchi va erigan moddalar bilan o'zgaruvchan sterik va kinetik omillar ham eritma qobig'iga ta'sir qilishi mumkin.

Dehidronlar

Dehidron - bu orqa miya vodorod aloqasi suv hujumidan to'liq himoyalanmagan va o'zini targ'ib qilishga moyil bo'lgan oqsilda suvsizlanish, ikkalasi ham jarayon baquvvat va termodinamik jihatdan yoqimli.[3][4] Ular yon zanjirning to'liq bo'lmagan klasteridan kelib chiqadi qutbsiz "o'raydigan" guruhlar qutbli ichida juftlik oqsil tuzilishi. Dehidronlar atrofdagi suvni olib tashlashga yordam beradi oqsil assotsiatsiyalari yoki ligandni bog'lash.[3] Dehidronlarni eruvchan oqsilning suvli interfeysini qoplash uchun zarur bo'lgan birlik birligi bo'yicha qaytariladigan ishni yoki interfeysdagi "epistrukturaviy taranglikni" hisoblash orqali aniqlash mumkin.[5][6]:217–33 Aniqlanganidan so'ng, degidronlardan foydalanish mumkin giyohvand moddalarni topish, ham yangi birikmalarni aniqlash uchun, ham mavjud birikmalarni optimallashtirish uchun; kimyoviy moddalar bo'lishi mumkin ishlab chiqilgan degidronlarni maqsad bilan birlashganda suv hujumidan "o'rash" yoki himoya qilish.[3][6]:1–15[7][8]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Gluekkauf, E. (1955). "Konsentrlangan elektrolit eritmalaridagi faollik koeffitsientlariga ionli gidratatsiyaning ta'siri". Faraday Jamiyatining operatsiyalari. 51: 1235. doi:10.1039 / TF9555101235.
  2. ^ a b Chjan, L .; Vang, L .; Kao, Y. -T .; Qiu, V.; Yang, Y .; Okobya, O .; Zhong, D. (2007). "Oqsil yuzasi atrofidagi hidratsiya dinamikasini xaritalash". Milliy fanlar akademiyasi materiallari. 104 (47): 18461–18466. Bibcode:2007PNAS..10418461Z. doi:10.1073 / pnas.0707647104. PMC  2141799. PMID  18003912.
  3. ^ a b v Fernandes, A; Crespo, A (noyabr 2008). "Oqsillarni o'rash: assotsiatsiya, agregatsiya va dori dizayni uchun molekulyar marker". Chem Soc Rev.. 37 (11): 2373–82. doi:10.1039 / b804150b. PMID  18949110.
  4. ^ To'p, P (Yanvar 2008). "Suv hujayra biologiyasining faol tarkibiy qismi sifatida". Kimyoviy. Vah. 108 (1): 74–108. doi:10.1021 / cr068037a. PMID  18095715.
  5. ^ Fernandes, A (2012 yil may). "Epistructural kuchlanish oqsil assotsiatsiyasini rivojlantiradi" (PDF). Fizika. Ruhoniy Lett. 108 (18): 188102. Bibcode:2012PhRvL.108r8102F. doi:10.1103 / physrevlett.108.188102. hdl:11336/17929. PMID  22681121. Xulosa: Suv imkon beradigan joyda oqsillar birikadi
  6. ^ a b Ariel Fernandes. Dori-darmonlarni loyihalashtirish uchun transformatsion tushunchalar: Maqsadni o'rash: Maqsadni o'rash. Springer Science & Business Media, 2010 yil. ISBN  978-3-642-11791-6
  7. ^ Demetri, GD (2007 yil dekabr). "Saratonni davolashda yurak xavfini kamaytirish uchun imatinibni tizimli ravishda qayta qurish". J Clin Invest. 117 (12): 3650–3. doi:10.1172 / JCI34252. PMC  2096446. PMID  18060025.
  8. ^ Sara Crunkhorn Tabiatni ko'rib chiqish uchun giyohvand moddalarni kashf qilish uchun. 2008 yil fevral. Tadqiqotning asosiy mavzusi: Saratonga qarshi dorilar: kinaz inhibitörlerini qayta ishlab chiqish.

Tashqi havolalar