TAF1C - TAF1C

TAF1C
Identifikatorlar
Taxalluslar	TAF1C, MGC: 39976, SL1, TAFI110, TAFI95, TATA-bog'lovchi protein bilan bog'langan omil, RNK polimeraza I subbirlik C
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 604905 MGI: 109576 HomoloGene: 21163 Generkartalar: TAF1C
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	84,187,070 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 8 (sichqoncha)
Oxiri	119,605,222 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• DNK bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • GO: 0001187 RNK polimeraza I yadro promotorining ketma-ketligiga xos DNK bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• RNK polimeraza I transkripsiyasi omil kompleksi; • fibrillar markazi; • nukleoplazma; • nukleus; • hujayra yadrosi;
Biologik jarayon	• RNK polimeraza I transkripsiyasini tugatish; • RNK polimeraza I promotoridan transkripsiyani boshlash; • gen ekspressionining ijobiy regulyatsiyasi, epigenetik; • transkripsiya, DNK-andozali; • transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • RNK polimeraza II promotoridan transkripsiya; • RNK polimeraza I promotoridan transkripsiyani tartibga solish; • RNK-polimeraza I transkripsiyali oldindan rejalashtirish kompleksi; • RNK polimeraza I promotoridan transkripsiya; • RNK polimeraza I promotoridan transkripsiyaning uzayishi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	9013
	21341
	ENSG00000103168
	ENSMUSG00000031832
	Q15572
	Q6PDZ2
NM_001243156; NM_001243157; NM_001243158; NM_001243159; NM_001243160;
	NM_005679; NM_139353
	NM_021441; NM_001378901
NP_001230085; NP_001230086; NP_001230087; NP_001230088; NP_001230089;
	NP_005670; NP_647610
	NP_067416; NP_001365830
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

TATA qutisini bog'laydigan oqsil bilan bog'liq omil RNK polimeraza I subbirligi C bu ferment odamlarda kodlanganligi TAF1C gen.^[5]^[6]

Funktsiya

RNK polimeraza I bilan transkripsiyani boshlash uchun TATA bilan bog'lovchi oqsil (TBP) va RNK polimeraza I ga xos bo'lgan uchta TBP bilan bog'liq omillar (TAF) dan iborat kompleks hosil bo'lishini talab qiladi. Ushbu kompleks SL1 deb nomlanuvchi yadro promotor bilan bog'lanadi. polimerazani to'g'ri joylashtirishi va regulyator signallari uchun kanal vazifasini bajarishi uchun ribosomal RNK genlarining. Ushbu gen SL1ga xos eng katta TAFni kodlaydi. Turli izoformlarni kodlovchi ikkita transkript aniqlandi.^[6]

O'zaro aloqalar

TAF1C ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan UBTF.^[7]^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000103168 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031832 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Komai L, Zomerdijk JK, Bekman H, Chjou S, Admon A, Tjian R (1994). "SL1 transkripsiya omilini qayta tiklash: TBP ning SL1 yoki TFIID subbirliklari bilan eksklyuziv bog'lanishi". Ilm-fan. 266 (5193): 1966–72. doi:10.1126 / science.7801123. PMID 7801123.
^ ^a ^b "Entrez Gen: TAF1C TATA qutisini bog'laydigan oqsil (TBP) bilan bog'liq omil, RNK polimeraza I, C, 110kDa".
^ Voit R, Grummt I (2001 yil noyabr). "UBF ning serin 388 da fosforillanishi RNK polimeraza I bilan o'zaro ta'sir qilish va rDNK transkripsiyasini faollashtirish uchun zarur". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 98 (24): 13631–6. doi:10.1073 / pnas.231071698. PMC 61092. PMID 11698641.
^ Zhai V, Comai L (2000 yil avgust). "RNK polimeraza I transkripsiyasini p53 o'simta supressori bilan repressiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (16): 5930–8. doi:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. PMC 86070. PMID 10913176.

Qo'shimcha o'qish

Di Pietro C, Rapisarda A, Amico V, Bonaiuto C, Viola A, Scalia M, Motta S, Amato A, Engel H, Messina A, Sichel G, Grzeschik K, Purrello M (2000). "TAF1A, TAF1B va TAF1C inson genlarining genomik lokalizatsiyasi, TAF (I) 48, TAF (I) 63 va TAF (I) 110 subbirliklarini kodlash, I sinfning umumiy transkripsiyasini boshlash koeffitsienti SL1". Sitogenet. Hujayra geneti. 89 (1–2): 133–6. doi:10.1159/000015592. PMID 10894955. S2CID 27014629.
Miller G, Panov KI, Fridrix JK, Trinkl-Mulkaxi L, Lamond AI, Zomerdijk JK (2001). "hRRN3 SLN-vositachiligida RNK Polimeraza I ni rRNA genlari promouterlariga jalb qilishda muhim ahamiyatga ega". EMBO J. 20 (6): 1373–82. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1373. PMC 145519. PMID 11250903.
Yuan X, Chjao J, Zentgraf H, Hoffmann-Roher U, Grummt I (2002). "RNK-polimeraza I, TIF-IA va TAF (I) subbirliklarining o'zaro ta'siri ribosomal gen promotorida preinitiatsiya kompleksi yig'ilishini tartibga soladi". EMBO vakili. 3 (11): 1082–7. doi:10.1093 / embo-report / kvf212. PMC 1307603. PMID 12393749.
Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (2004). "RNK polimeraza I bilan bog'liq PAF49 faktori va PAF49 ning rRNK transkripsiyasidagi roli bilan bir nechta protein-oqsillarning o'zaro ta'siri". Mol. Hujayra. Biol. 24 (14): 6338–49. doi:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. PMC 434256. PMID 15226435.
Grandori C, Gomes-Roman N, Felton-Edkins ZA, Nguenet C, Galloway DA, Eyzenman RN, White RJ (2005). "c-Myc inson ribosomal DNK bilan bog'lanib, rNK genlarining RNK polimeraza I bilan transkripsiyasini rag'batlantiradi". Nat. Hujayra biol. 7 (3): 311–8. doi:10.1038 / ncb1224. PMID 15723054. S2CID 8913931.
Fridrix JK, Panov KI, Kabart P, Rassel J, Zomerdijk JK (2005). "TBP-TAF kompleksi SL1 RNK polimeraza I boshlang'ichgacha kompleks hosil bo'lishini boshqaradi va rDNK promotorida oqim bilan bog'lanish omilini barqarorlashtiradi". J. Biol. Kimyoviy. 280 (33): 29551–8. doi:10.1074 / jbc.M501595200. PMC 3858828. PMID 15970593.
Zhang C, Comai L, Jonson DL (2005). "PTEN SL1 kompleksini buzgan holda RNK Polimeraza I transkripsiyasini bostiradi". Mol. Hujayra. Biol. 25 (16): 6899–911. doi:10.1128 / MCB.25.16.6899-6911.2005. PMC 1190253. PMID 16055704.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon C, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill Hill, Roth FP, Vidal M (2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Vakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikava T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Vakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Iri R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Vagatsuma M, Murakava K, Ishida S, Ishibashi T, Takaxashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . "Transkripsiya modulyatsiyasining diversifikatsiyasi: keng ko'lamli identifikatsiyalash va inson genlarining muqobil alternativ targ'ibotchilarini tavsiflash". Genom Res. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000103168 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031832 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid7801123-5] Komai L, Zomerdijk JK, Bekman H, Chjou S, Admon A, Tjian R (1994). "SL1 transkripsiya omilini qayta tiklash: TBP ning SL1 yoki TFIID subbirliklari bilan eksklyuziv bog'lanishi". Ilm-fan. 266 (5193): 1966–72. doi:10.1126 / science.7801123. PMID 7801123.

[entrez-6] "Entrez Gen: TAF1C TATA qutisini bog'laydigan oqsil (TBP) bilan bog'liq omil, RNK polimeraza I, C, 110kDa".

[pmid11698641-7] Voit R, Grummt I (2001 yil noyabr). "UBF ning serin 388 da fosforillanishi RNK polimeraza I bilan o'zaro ta'sir qilish va rDNK transkripsiyasini faollashtirish uchun zarur". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 98 (24): 13631–6. doi:10.1073 / pnas.231071698. PMC 61092. PMID 11698641.

[pmid10913176-8] Zhai V, Comai L (2000 yil avgust). "RNK polimeraza I transkripsiyasini p53 o'simta supressori bilan repressiyasi". Mol. Hujayra. Biol. 20 (16): 5930–8. doi:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000. PMC 86070. PMID 10913176.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]