TRAPPC4 - TRAPPC4

TRAPPC4

Protein TRAPPC4 PDB 2j3t.png

Mavjud tuzilmalar

Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB

PDB id kodlari ro'yxati
2J3T, 2JSN, 2ZMV

Identifikatorlar

TRAPPC4, HSPC172, PTD009, SBDN, SYNBINDIN, TRS23, CGI-104, muomalada bo'lgan oqsil zarralari kompleksi 4, NEDESBA

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 610971 MGI: 1926211 HomoloGene: 105453 Generkartalar: TRAPPC4

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 11 (odam)^[1]

Band	11q23.3	Boshlang	119,018,763 bp^[1]
Band	11q23.3	Oxiri	119,025,454 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 9 (sichqoncha)^[2]

Band	9 \| 9 A5.2	Boshlang	44,403,698 bp^[2]
Band	9 \| 9 A5.2	Oxiri	44,407,600 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish • Rab guanil-nukleotid almashinuvi omilining faolligi
Uyali komponent	• sitozol • Golgi apparati • sinaptik pufakcha • sinaps • dendrit • endoplazmatik to'r • Golgi to'plami • Golgi membranasi • TRAPP kompleksi
Biologik jarayon	• dendrit rivojlanishi • COPII pufakchali qoplamasi • vesikula vositasida tashish • Golgi pufakchali vositasida transport
Manbalar:Amigo / QuickGO

Turlar

Inson

Sichqoncha


51399


60409


ENSG00000280495 ENSG00000196655


ENSMUSG00000032112


Q9Y296


Q9ES56

RefSeq (mRNA)

NM_016146 NM_001318486 NM_001318488 NM_001318489 NM_001318490
NM_001318492 NM_001318494


NM_021789

RefSeq (oqsil)

NP_001305415 NP_001305417 NP_001305418 NP_001305419 NP_001305421
NP_001305423 NP_057230


NP_068561

Joylashuv (UCSC)

Chr 11: 119.02 - 119.03 Mb

Chr 9: 44.4 - 44.41 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Odam savdosi oqsil zarralari kompleksi kichik birligi 4 a oqsil odamlarda kodlanganligi TRAPPC4 gen.^[5]^[6]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ENSG00000196655 GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000280495, ENSG00000196655 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000032112 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Lay CH, Chou CY, Chang LY, Liu CS, Lin V (Avgust 2000). "Caenorhabditis elegans-da evolyutsion tarzda saqlanib qolgan yangi odam genlarini taqqoslash proteoimi bilan aniqlash". Genom Res. 10 (5): 703–13. doi:10.1101 / gr.10.5.703. PMC 310876. PMID 10810093.
^ "Entrez Gen: TRAPPC4 savdosi oqsil zarralari kompleksi 4".

Qo'shimcha o'qish

Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gavin AC, Bösche M, Krause R va boshq. (2002). "Protein komplekslarini tizimli tahlil qilish orqali xamirturush proteomini funktsional tashkil etish". Tabiat. 415 (6868): 141–7. doi:10.1038 / 415141a. PMID 11805826. S2CID 4425555.
Chjan QH, Ye M, Vu XY va boshq. (2001). "CD34 + gemotopoetik tomir / nasl-nasab hujayralarida ifodalangan ilgari aniqlanmagan 300 gen uchun ochiq o'qish doirasi bo'lgan cDNA-larni klonlash va funktsional tahlil qilish". Genom Res. 10 (10): 1546–60. doi:10.1101 / gr.140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Ethell IM, Xagixara K, Miura Y va boshq. (2000). "Synbindin, roman Syndecan-2 - neyronal dendritik tikanlardagi bog'lovchi protein". J. Hujayra Biol. 151 (1): 53–68. doi:10.1083 / jcb.151.1.53. PMC 2189810. PMID 11018053.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.

PDB galereyasi
2j3t: BET3-TRS33-BET5-TRS23 KOMPLEKSINING KRISTAL TUZILISHI.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 11 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.