Tilapiya tilapinevirusi - Tilapia tilapinevirus

Tilapiya tilapinevirusi
Viruslarning tasnifi e
(ochilmagan):Virus
Shohlik:Riboviriya
Qirollik:Orthornavirae
Filum:Negarnavirikota
Sinf:Insthoviricetes
Buyurtma:Artikulyar viruslar
Oila:Amnoonviridae
Tur:Tilapinevirus
Turlar:
Tilapiya tilapinevirusi
Sinonimlar[1]
  • Tilapiya ko'l virusi

Tilapiya tilapinevirusi, yoki Tilapiya ko'l virusi (TiLV), yovvoyi va ham yuqadigan virusdir suv yetishtirildi aholisi tilapiya.[2] Bu yagona tur monotipik tur Tilapinevirus, bu o'z navbatida oiladagi yagona tur Amnoonviridae.[3] Hozirgacha bu turli mintaqalarda qayd etilgan Osiyo, Afrika va Janubiy Amerika.[2] Virus birinchi marta 2014 yilda topilgan va aniqlangan Galiley dengizi (Kinneret ko'li) yilda Isroil tilapiya ovlash miqdori sezilarli darajada pasaygan.[4]

Tasnifi

Tilapiya ko'l virusi - salbiy ma'noga ega, bir qatorli RNK virusi.[4] Bu guruhning V guruhiga tegishli Baltimor tasniflash tizimi viruslar.

Tuzilishi

Elektron mikroskopda tilapiya ko'l virusi an ekanligini aniqladi o'ralgan ikosahedral zarracha[4] diametri 55-100 nm ga teng.[2] Virusli tuzilish haqida qo'shimcha ma'lumot hali mavjud emas, ammo TiLV ortomiksozga o'xshash virus deb ta'riflangan[5] u sirt kabi o'xshash tuzilish xususiyatlariga ega bo'lishi mumkin glikoproteinlar va spiral nukleokapsid,[6] boshqa sferik ortomiksoviruslar singari.

Genom

RNK zanjiri o'nta virusli genomik segmentlarga bo'linadi ochiq o'qish ramkalari O'nta oqsilni kodlaydigan (ORF).[7] Genomning umumiy hajmi 10,323kb ni tashkil qiladi va har o'n segmentning har biri 465 dan 1641 nukleotidgacha o'zgaradi.[5] Segmentlarning birinchi va eng kattasi minimaldir homologiya bilan gripp C virusi PB1 kichik birligi. Qolgan to'qqizta segment ma'lum bo'lgan boshqa viruslar bilan homologiyani ko'rsatmaydi, ammo ularning genomlari boshqa ortomiksoviruslarga mos keladi.[4] Tilapiyaning turli xil global populyatsiyalaridan TiLV ning genomni qiyosiy tahlili shuni ko'rsatdiki, genom segmentlari genetik o'zgarishga geografik ta'sir ko'rsatgan.[8] Barcha segmentlarda mavjud bo'lgan 13 ta nukleotidlar TiLV 5 'va 3' kodlanmaydigan terminiga kiritilgan, bu TiLVni boshqa ikkita ortomiksovirusga o'xshashligini beradi, Isavirus va Thogoto.[5]

Replikatsiya davri

Ilova va kirish

Virusli replikatsiya va bog'liq virusning transkripsiyasi ortomiksovirus

TiLVga xos replikatsiya tsikli haqida cheklangan ma'lumotlar mavjud, ammo ular oilada ekanligi ma'lum Orthomyxoviridae uning bir zanjirli salbiy sezgir RNK genomi tufayli. Odatda Orthomyxoviridae maqsadli hujayra membranasida sialik kislota retseptorlarini taniydigan va bog'laydigan bir necha sirt glikoproteidlarini olib yurish.[9] Maqsadli hujayra virusni hujayraga retseptorlari vositasida endotsitoz bilan tashiydi va endosoma kislotaliligini boshlaydi.[10] Ushbu kislotalash natijasida virusli glikoproteinning konformatsion o'zgarishi, virusli konvert va endosomal membrananing membrana sintezi boshlanadi. Birlashma tugagandan so'ng, virusli genom, aksessuar oqsillari va RNKga bog'liq RNK-polimeraza xujayra sitoplazmasiga ajralib chiqadi.[10]

Replikatsiya va transkripsiya

Orqali joyida hibridizatsiya, TiLV virusli genomining transkripsiyasi yadroda sodir bo'lishi aniqlandi, bu hamma uchun keng tarqalgan Orthomyxoviridae.[5] An nukleokapsidi ortomiksovirus yadroga etkaziladi, u erda virusli fermentlar tomonidan transkripsiyalanadi, natijada virusli mRNK hosil bo'ladi.[11] Qopqoqlarning ketma-ketligi transkripsiya paytida mRNA xujayrasidan olinadi va virusli mRNK bilan bog'lanadi, bu virus mRNK ning yadrosidan chiqib, xujayraning sitoplazmasiga qaytishiga imkon beradi, u erda u tanib olinadi va xujayra ribosomalari tomonidan oqsillarga tarjima qilinadi.[11] TiLV ning 5 'va 3' kodlamaydigan terminalariga 13 ta shunga o'xshash nukleotidlar kiradi, bu ikkilamchi tuzilmalar hosil bo'lishi natijasida virusli RNKning bazaviy juftlashishi va ko'payishi, transkripsiyasi va qadoqlanishiga imkon beradi.[12] Bundan tashqari, TiLV genomik RNK segmentlarining barcha 5 ′ uchlarida uridinning qisqa qisilishi (3 dan 5 tagacha uzunlik) mavjud. Ushbu qisqa uzluksiz ketma-ketlik boshqa ko'plab ortomiksoviridalarda uchraydigan 5 dan 7 gacha uridin nukleotidlariga o'xshaydi, bu virusli polimeraza poli (A) dumlarni yig'ish paytida "qoqilib" ketganda yuz beradi.[5]

Yig'ish va chiqarish

Orthomyxovirus virusli glikoproteidlar keyinchalik hujayra membranasiga o'tib, u erda sferik buyrak hosil qilib, hujayra hujayrasidan salbiy zanjirli vRNKni tashiydi. Yangi virusli material mezbon hujayradan chiqib ketgandan so'ng, xujayra tugaydi.[13]

Uy egasi bilan o'zaro aloqalar

Hujayra madaniyatida ta'sirlangan hujayralar sezilarli darajada namoyon bo'ladi sitopatik ta'sir (CPE), virusli infektsiya tufayli xujayraning tarkibiy o'zgarishlari.[4] CPE ning aniq va tez rivojlanishi birinchi navbatda E-11 hujayra chizig'ida sodir bo'ladi, miya va jigar hujayralarining chiziqlari TiLV tarqalishida juda joiz ekanligi isbotlangan.[2][4] Infektsiyani yuqtirish holatlari sintitsiya shakllanishi, yuqumli qo'shni hujayralarning ko'p yadroli hujayralarni hosil qilish uchun birlashishi. Ushbu turdagi sinitsial hujayralar mitoxondriyani shishishi bilan ajralib turadi.[8] Yuqtirilgan tilapiya gepatotsitlari shishgan va dissotsiatsiyalangan,[8] tabiiy va eksperimental yuqtirgan baliqlarning taloq va jigarida sariqdan jigarrang pigmentgacha (MMC) sitoplazmik darajada to'planishi bilan.[4] Bundan tashqari, eksperimental infektsiya miyada shish, leptomeningesdagi fokal qon ketish va oq va kulrang moddalarda kapillyar tiqilishi kabi gistologik shikastlanishlarni ko'rsatadi.[4]

Tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, TiLVni eksperimental infektsiyasi natijasida gistopatologik shikastlanishlar tabiiy avj olishda kuzatilganlarga o'xshash topilgan.[4] Ushbu tabiiy epidemiyalar letargiya, rang o'zgarishi, ko'zning o'zgarishi, terining parchalanishi va oshqozon-ichak traktining yaralari bilan tavsiflangan.[4] Patologiya kuzatiladigan asosiy organlar miya, ko'z va jigardir. Yalpi shikastlanishlar, odatda, kataraktning ko'zning xiralashishi va, masalan, teri eroziyalari kabi yuqtirilgan turlarda ko'rinadi.[4] tarozi yo'qolishi yoki rang o'zgarishi, teriga qon quyilishi, qorin shishishi, tarozidan chiqib ketish va ekzoftalmiya.[12] Ayni paytda TiLVga qarshi emlash yo'q va u o'lim darajasi> 80% ni tashkil qiladi.[4]

Tropizm

TiLV patologiyasi asosan optik, miya va jigar to'qimalariga ta'sir qilishi aniqlandi.[4] Ammo, ba'zi tadkikotlar shuni ko'rsatadiki, TiLV tropizmi biriktiruvchi mushak to'qimalarida, buyraklarda, gillada, taloqda va yurakda ham bo'lishi mumkin.[8] Virusning tropizmi geografik joylashuvga qarab turlicha ko'rinadi. Isroildagi tilapiya bo'yicha laboratoriya tadqiqotlari keltirilgan sustlik, ko'zning o'zgarishi va jarohatlar va yovvoyi va dehqonchilik qilingan tilapiyada teri eroziyasi, rang o'zgarishi, shuningdek, yetishtirilgan tilapiya orasida TiLV ning keng tarqalgan belgisi hisoblanadi.[4] Ba'zi Misr dehqon xo'jaliklarining TiLV yuqtirgan baliqlarida gemorragik parchalar, ajralgan tarozilar, ochiq yaralar, rang o'zgarishi va fin chirishi garchi ba'zilari birgalikda yuqtirgan bo'lsa aeromonalar .[14] Ekvadorda kuzatilgan Tilapiya ham rang o'zgarishini namoyish etdi ekzoftalmiya, qorin bo'shlig'i kengayishi, tarozining chiqishi va gill rangparlik.[15] Ekzoftalmiya va oshqozon yarasi Peru tilapiyasida TiLV bilan kechdi.[16] Teri tiqilishi va eroziyasi, rang o'zgarishi, g'ayritabiiy xatti-harakatlar, sustlik, ishtahani yo'qotish, xira rang, anemiya, ekzoftalmi va qorin shishishi Tailandda patologiya belgilari kuzatilgan.[8][7] Hindistonda tabiiy ravishda yuqtirilgan tilapiya infektsiyasi natijasida terining eroziyasi va tarozi yo'qolgan.[17] Hindistondagi laboratoriya sharoitida TiLV bilan kasallanganlar ekzoftalmiya, qorin shishishi va tarozidan chiqib ketishni namoyish etishdi.[17] Filippindagi TiLV holatlari to'g'risidagi xabarlarda TiLV infektsiyasi natijasida qorin shishishi va ekzoftalmiya keltirilgan.[18]

Bilan bog'liq kasalliklar

TiLV ning boshqa virusli akvakultura kasalliklari bilan aloqasi haqida kam ma'lumot mavjud, ammo yuqumli losos anemiyasi ortomiksoviruslari, yuqumli gemopoetik nekroz viruslari va virusli gemorragik septikemiya virusi madaniy baliqlarda kasallik va o'limning keng tarqalgan sabablari.[7] Salmon anemiyasi ortomiksoviruslari, gripp va Thogoto transkripsiyada bazani juftlashtirishga imkon beradigan nukleotidlar ketma-ketligini tashkil etish tufayli TiLV bilan o'xshash takrorlanishga ega ekanligi aytilgan.[5] Tilapiya uchun xos bo'lgan Tilapia iridovirus - bu og'ir kasallik va o'limga olib keladigan yagona muhim virusli patogen.[19] Ushbu turdagi virusli kasalliklarni keltirib chiqaradigan boshqa patogenlar betanodavirus va gerpesga o'xshash virusdir.[7]

Etkazish va boshqarish

Virus to'g'ridan-to'g'ri gorizontal yo'l bilan birgalikda yashash yoki jonli suv hayvonlarini ko'chirish yo'li bilan yuqishi aniqlangan, ammo bu virusli patogenlar yangi va saqlanib qolgan tilapiyada topilgan.[20][21] TiLV ning hayvonot mahsuloti bilan bog'liq bo'lgan biofizik xususiyatlari va xatarlari to'g'risida cheklangan ma'lumotlar mavjud, ammo tadqiqotlar shuni ko'rsatadiki, ko'z, miya va jigarda eng yuqori kontsentratsiya TiLV bo'lishi va shu sababli qattiq va suyuq chiqindilar ifloslanishi mumkin.[20] Hozirda TiLV ning vertikal ravishda uzatilishi haqida hech qanday dalil yo'q.

Fermer xo'jaliklari yoki baliqchilik xo'jaliklari o'rtasida jonli tilapinalar harakatini cheklash virusli kasallikning yangi turlarga tarqalishini cheklaydi, shuningdek, ushbu joylarda toza amaliyot va sanitariya-texnik vositalarni saqlab qoladi. Infektsiyalangan fermada virus tarqalishini cheklash bo'yicha amaliyotlar mavjudligiga hali ham dalil yo'q.[20]

Ahamiyati

TiLV tarqalishi tijorat va ekologik sharoitda global ta'sirga ega. Dunyo bo'ylab tilapiya savdosi yiliga 4,5 million metrik tonna mahsulot va 7,5 milliard dollar olib keladigan sanoat sifatida ulkan iqtisodiy ta'sirga ega.[5] Ushbu sanoat Xitoy, Misr, Tailand, Filippinlar, Indoneziya, Laos, Kosta-Rika, Kolumbiya, Ekvador va Gondurasdagi asosiy ish beruvchidir.[5] Tilapiya ekologik tizimlar uchun ham juda muhimdir[4] chunki ular suv o'tlari, chivinlar va yashash joylarini umumiy nazorat qilishda foydali.[5]

Adabiyotlar

  1. ^ Baxarax, Eran; Mishra, Nischay; Briz, Tomas; Eldar, Avi; Lipkin, V. Yan; Kuhn, Jens H. (2016 yil 18-iyul). "Bir (1) yangi tur, shu jumladan bitta (1) yangi tur yarating" (pdf). Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mita (ICTV). Olingan 14 mart 2019.
  2. ^ a b v d Jansen MD, Dong HT, Mohan CV (2018). "Tilapiya ko'l virusi: global tilapiya sanoatiga tahdidmi?". Akvakulturadagi sharhlar. doi:10.1111 / raq.12254.
  3. ^ "Virus taksonomiyasi: 2018b versiyasi". Viruslar taksonomiyasi bo'yicha xalqaro qo'mita (ICTV). 2019 yil fevral. Olingan 14 mart 2019.
  4. ^ a b v d e f g h men j k l m n o Eyngor M, Zamostiano R, Kembou Tsofack JE, Berkowitz A, Bercovier H, Tinman S, Lev M, Hurvitz A, Galeotti M, Bacharach E, Eldar A (dekabr 2014). "Tilapiyaga olib keladigan yangi RNK virusini aniqlash". Klinik mikrobiologiya jurnali. 52 (12): 4137–46. doi:10.1128 / JCM.00827-14. PMC  4313277. PMID  25232154.
  5. ^ a b v d e f g h men Bacharach E, Mishra N, Briz T, Zodi MC, Kembou Tsofack JE, Zamostiano R, Berkowitz A, Ng J, Nitido A, Corvelo A, Tussaint NC, Abel Nielsen SC, Hornig M, Del Pozo J, Bloom T, Ferguson H , Eldar A, Lipkin WI (2016 yil aprel). "Tilapiyaning ommaviy ravishda nobud bo'lishiga olib keladigan yangi Orthomyxo-shunga o'xshash virusning xarakteristikasi". mBio. 7 (2): e00431-16. doi:10.1128 / mBio.00431-16. PMC  4959514. PMID  27048802.
  6. ^ "ORTHOMYXOVIRIDAE ning tibbiy ta'rifi". www.merriam-webster.com. Olingan 2019-03-12.
  7. ^ a b v d Surachetpong V, Janetanakit T, Nonthabenjawan N, Tattiyapong P, Sirikanchana K, Amonsin A (iyun 2017). "Tilapiya ko'li virusi yuqishi, Tailand, 2015–2016". Rivojlanayotgan yuqumli kasalliklar. 23 (6): 1031–1033. doi:10.3201 / eid2306.161278. PMC  5443430. PMID  28518020.
  8. ^ a b v d e Dong HT, Siriroob S, Meemetta V, Santimanawong V, Gangnonngiw V, Pirarat N, Khunrae P, Rattanarojpong T, Vanichviriyakit R, Senapin S (iyul 2017). "Tailandda tilapiya ko'l virusi paydo bo'lishi va aniqlash uchun alternativ yarim uyali RT-PCR". Suv mahsulotlari yetishtirish. 476: 111–8. doi:10.1016 / j.aquaculture.2017.04.019.
  9. ^ Vagner R, Matrosovich M, Klenk HD (2002 yil may). "Gripp virusi infektsiyalarida gemagglutinin va neyraminidaza o'rtasidagi funktsional muvozanat". Tibbiy virusologiya bo'yicha sharhlar. 12 (3): 159–66. doi:10.1002 / rmv.352. PMID  11987141.
  10. ^ a b Foster JE, Mendoza JA, Seetahal J (2018). "7-bob - viruslar patogen: hayvonlar viruslari, inson viruslariga e'tibor berish". Viruslar: Molekulyar biologiya, xostning o'zaro ta'siri va biotexnologiyaga tatbiq etish. Akademik matbuot. 157-187 betlar. doi:10.1016 / B978-0-12-811257-1.00007-3. ISBN  9780128112571.
  11. ^ a b Couch RB (1996). Baron S (tahrir). Ortomiksoviruslar. Tibbiy mikrobiologiya y (4-nashr). Galveston shahridagi Texas tibbiyot filiali. ISBN  9780963117212. PMID  21413353. Olingan 2019-03-13.
  12. ^ a b Kembou Tsofack JE, Zamostiano R, Watted S, Berkowitz A, Rosenbluth E, Mishra N, Briese T, Lipkin WI, Kabuusu RM, Ferguson H, Del Pozo J, Eldar A, Bacharach E (mart 2017). Fenvik B (tahrir). "Tilapiya ko'li virusini klinik namunalarda kultivatsiya va ichki reverskripsiya-PCR yordamida aniqlash". Klinik mikrobiologiya jurnali. 55 (3): 759–767. doi:10.1128 / JCM.01808-16. PMC  5328443. PMID  27974544.
  13. ^ Nayak DP, Hui EK, Barman S (2004 yil dekabr). "Gripp virusini yig'ish va kurtaklash". Viruslarni o'rganish. 106 (2): 147–65. doi:10.1016 / j.virusres.2004.08.012. PMC  7172797. PMID  15567494.
  14. ^ Nicholson P, Fathi MA, Fischer A, Mohan C, Schieck E, Mishra N, Heinimann A, Frey J, Wieland B, Jores J (dekabr 2017). "2015 yilda o'lim darajasi yuqori bo'lgan Misr baliqchilik xo'jaliklarida Tilapiya ko'li virusini aniqlash". Baliq kasalliklari jurnali. 40 (12): 1925–1928. doi:10.1111 / jfd.12650. PMID  28590067.
  15. ^ Ferguson HW, Kabuusu R, Beltran S, Reyes E, Lince JA, del Pozo J (iyun 2014). "Yetishtiriladigan tilapiya, Oreochromis niloticus (L.) ning sitsitial gepatiti: holatlar to'g'risida hisobot". Baliq kasalliklari jurnali. 37 (6): 583–9. doi:10.1111 / jfd.12142. PMID  23802941.
  16. ^ "Tilapiya ko'l virusi, Peru". www.oie.int. Olingan 2019-03-12.
  17. ^ a b Behera BK, Pradhan PK, Swaminathan TR, Sood N, Paria P, Das A, Verma DK, Kumar R, Yadav MK, Dev AK, Parida PK (fevral 2018). "Hindistonda o'stiriladigan Nil tilapia Oreochromis niloticus (Linnaeus 1758) o'limiga bog'liq tilapiya ko'l virusi paydo bo'lishi". Suv mahsulotlari yetishtirish. 484: 168–74. doi:10.1016 / j.aquaculture.2017.11.025.
  18. ^ "Tilapia Leyk Virusi (TiLV), Filippinlar". www.oie.int. Olingan 2019-03-12.
  19. ^ "Tilapiya kasalliklari". AmeriCulture, Inc. Olingan 2019-03-13.
  20. ^ a b v "Tilapiya ko'l virusi (TiLV) - yangi ortomiksozga o'xshash virus" (PDF). Butunjahon hayvonlarni sog'liqni saqlash tashkiloti (OIE). 2018 yil fevral. Olingan 12 mart 2019.
  21. ^ Kembou Tsofack JE, Zamostiano R, Watted S, Berkowitz A, Rozenbluth E, Mishra N va boshq. (2017 yil mart). Fenvik B (tahrir). "Tilapiya ko'li virusini klinik namunalarda kultivatsiya va ichki reverskripsiya-PCR yordamida aniqlash". Klinik mikrobiologiya jurnali. 55 (3): 759–767. doi:10.1128 / JCM.01808-16. PMC  5328443. PMID  27974544.