U11 splitseozomal RNK - U11 spliceosomal RNA

U11 splitseozomal RNK
U11 ikkinchi darajali strukturasi.png
Odam U11 splitseozomali RNKning ikkilamchi tuzilishi
Identifikatorlar
BelgilarU11
RfamRF00548
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; biriktirish
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000398
PDB tuzilmalarPDBe

The U11 snRNA (kichik yadro ribonuklein kislotasi ) muhim ahamiyatga ega kodlamaydigan RNK ichida kichik splitsezoma oqsil kompleksi, faollashtiradigan muqobil qo'shish mexanizmi. Kichik splitsozom xuddi shunga o'xshash oqsil tarkibiy qismlari bilan bog'liq yirik splitsezoma. U11 ni tanib olish uchun sn11 RNKdan foydalanadi 5 'qo'shiladigan sayt (funktsional jihatdan teng U1 snRNA ) esa U12 snRNA ni tanib olish uchun filial nuqtasiga bog'laydi 3 'qo'shiladigan sayt (funktsional jihatdan teng U2 snRNA ).[1]

Ikkilamchi tuzilish

U11 snRNA a ga ega dastani tuzilishi 5 'oxiri bilan qo'shilish joylari ketma-ketligi (5s)[2] va to'rtta ilmoq konstruktsiyasini (I-IV) o'z ichiga oladi. U11 snRNA ni o'simliklar, umurtqali hayvonlar va hasharotlar o'rtasida tizimli ravishda taqqoslash shuni ko'rsatadiki, u 5 'joyida to'rtburchak tutashgan va 3' joyidagi dastani halqali tuzilishga o'ralgan.[3]

O'rnatish yo'li davomida bog'lash joyi

5 'qo'shilish joyi mintaqasi, eukaryotik U12 tipidagi 5' qo'shilish joyi bilan ketma-ketlikni to'ldiradi. mRNKdan oldingi intronlar. Ham 5 'qo'shilish joyi, ham Sm majburiy sayt bor juda konservalangan barcha turlarda.[3] Shuningdek, Ildiz tsikli III mumkin bo'lgan oqsillarni bog'laydigan joy yoki bazani juftlashtiruvchi mintaqadir, chunki u "AUCAAGA" nukleotidlar ketma-ketligiga ega.[3]

Muqobil qo'shish paytida roli

Splitseozomalarning kichik mexanizmi

U11 va U12 snRNP (kichik splitseozomal yo'l) U1 va U2 snRNP (asosiy splitseozomal yo'l) ning funktsional analogidir. U4 atac /U6 atac snRNPs ga o'xshash U4 /U6. Asosiy biriktiruvchi yo'ldan farqli o'laroq, U11 va U12 snRNPlar mRNK bilan barqaror, oldindan shakllangan U11 / U12 di-snRNP kompleksi sifatida bog'lanadi. Bu etti oqsil (65K, 59K, 48K, 35K, 31K, 25K va 20K) dan foydalanish orqali amalga oshiriladi. Ulardan to'rttasi (59K, 48K, 35K va 25K) U11 snRNA bilan bog'langan.[4]

Splitseozoma hosil bo'lishida U11 va U12 snRNAlarning 5 'uchi mos ravishda mRNKning 5' qo'shilish joyi va tarmoqlanish ketma-ketligi bilan o'zaro ta'sir qiladi.[4][5] U11 snRNP a ga bog'lanadi tandemni takrorlash U11 snRNP-biriktiruvchi qo'shimchani kuchaytiruvchi (USSE) deb nomlanadi va qo'shilish jarayonini boshlaydi.[6] U11 va U12 snRNKlari ikkitomonlama kompleks sifatida birlashganligi sababli ular splitseozomal kompleksdagi intronlarning ikki uchi o'rtasida molekulyar ko'prik hosil qiladi.[4] U11-48K va U11 / U12-65K oqsillari U12 tipli intronning qo'shilish joyini taniydi va U11 / U12 bi-kompleksini barqarorlashtiradi.[6] Splitseozomal kompleksni faollashtirgandan so'ng U11 snRNA assambleyadan chiqadi.

Ushbu 5 'splice saytini aniqlash va intron ko'prigi oqsil-oqsil, oqsil-RNK va RNK-RNKning o'zaro ta'siri kichik splicesomal kompleksda, asosiy splitseozomnikidan farq qiladi.[4] Muqobil biriktirish oqsillarni kodlovchi gen ekspressioni (mRNA) turlicha bo'lishining kaliti bo'lgani uchun U11 ushbu tartibga solish jarayoni uchun juda muhimdir va proteomik hovuz. Shuning uchun U11 snRNA evolyutsiya jihatlari jihatidan muhimdir.[7]

Adabiyotlar

  1. ^ Elliot, Devid; Ladomeri, Maykl (2011). RNKning molekulyar biologiyasi. Oksford universiteti matbuoti. p. 124.
  2. ^ Rassel AG, Charette JM, Spenser DF, Grey MW (oktyabr 2006). "Kichik splitsozomaning dastlabki evolyutsion kelib chiqishi". Tabiat. 443 (7113): 863–6. doi:10.1038 / nature05228. PMID  17051219.
  3. ^ a b v Schneider C, Will CL, Brosius J, Frilander MJ, Lührmann R (iyun 2004). "Drozofiladagi evolyutsion jihatdan ajralib turuvchi U11 kichik yadroli ribonukleoprotein zarrachasini aniqlash" (PDF). Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 101 (26): 9584–9. doi:10.1073 / pnas.0403400101. PMC  470718. PMID  15210936.
  4. ^ a b v d Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lürmann R (iyun 2004). "Inson 18S U11 / U12 snRNP tarkibida U2 ga bog'liq splitsozomada mavjud bo'lmagan yangi oqsillar to'plami mavjud". RNK. 10 (6): 929–41. doi:10.1261 / rna.7320604. PMC  1370585. PMID  15146077.
  5. ^ Kolossova I, Padgett RA (1997 yil mart). "U11 snRNA in vivo jonli ravishda U12 ga bog'liq bo'lgan (AU-AC) mRNA intronlarining 5 'qo'shilish joyi bilan o'zaro ta'sir qiladi". RNK. 3 (3): 227–33. PMC  1369475. PMID  9056760.
  6. ^ a b Verbeeren J, Niemelä EH, Turunen JJ, Will CL, Ravantti JJ, Lührmann R, Frilander MJ (mart 2010). "Splicing boshqaruvining qadimiy mexanizmi: U11 snRNP alternativ qo'shishni faollashtiruvchisi sifatida". Molekulyar hujayra. 37 (6): 821–33. doi:10.1016 / j.molcel.2010.02.014. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-D5F2-D. PMID  20347424.
  7. ^ Kashyap, Luv; Tripati Parul. "Muqobil qo'shilish: Qanday qilib bitta gen ko'plab oqsillarni hosil qilishi mumkin" (PDF). biobilim tushuntirdi.

Tashqi havolalar