VPS13D - VPS13D

VPS13D

Identifikatorlar

VPS13D, vakuoler oqsillarni saralash 13 homolog D, SCAR4

Tashqi identifikatorlar

OMIM: 608877 MGI: 2448530 HomoloGene: 15583 Generkartalar: VPS13D

Gen joylashuvi (odam)

Chr.	Xromosoma 1 (odam)^[1]

Band	1p36.22-p36.21	Boshlang	12,230,030 bp^[1]
Band	1p36.22-p36.21	Oxiri	12,512,047 bp^[1]

Gen joylashuvi (Sichqoncha)

Chr.	Xromosoma 4 (sichqoncha)^[2]

Band	4 \| 4 E1	Boshlang	144,972,622 bp^[2]
Band	4 \| 4 E1	Oxiri	145,195,005 bp^[2]

RNK ekspressioni naqsh

Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari

Turlar

Inson

Sichqoncha


55187


230895


ENSG00000048707


ENSMUSG00000020220


Q5THJ4


n / a

RefSeq (mRNA)


NM_018156 NM_015378


NM_001033190 NM_001128198 NM_001276465 NM_001276502

RefSeq (oqsil)


NP_056193 NP_060626


n / a

Joylashuv (UCSC)

Chr 1: 12.23 - 12.51 Mb

Chr 4: 144.97 - 145.2 Mb

PubMed qidirmoq

^[3]

^[4]

Insonni ko'rish / tahrirlash

Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Vakuolyar oqsillarni saralash bilan bog'liq 13D oqsil a oqsil odamlarda kodlanganligi VPS13D gen.^[5]

Ushbu gen tarkibiga kiruvchi oqsilni kodlaydi vakuolyar -proteinlarni saralash-13 genlar oilasi. Yilda xamirturush, vakuolalar-oqsillarni saralash-13 oqsillari savdosi bilan shug'ullanadi membrana oqsillari o'rtasida Golgi tarmog'i va prekakular bo'linma.

Ushbu gen uchun bir nechta transkript variantlari mavjud bo'lishi mumkin bo'lsa-da, faqat ikkitasining to'liq metrajli tabiati hozirgi kunga qadar tavsiflangan. Ushbu ikkalasi ushbu genning asosiy variantlarini anglatadi va alohida kodlaydi izoformlar.^[5]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000048707 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000020220 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b "Entrez Gen: VPS13D vakuoler oqsilni saralash 13 homolog D (S. cerevisiae)".

Qo'shimcha o'qish

Andersson B, Ventlend MA, Rikafrente JY va boshq. (1996). "Yaxshi o'qotar qurol kutubxonasini qurish uchun" ikkita adapter "usuli". Anal. Biokimyo. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu V, Andersson B, Uorli KC va boshq. (1997). "Katta ko'lamli birlashma cDNA ketma-ketligi". Genom Res. 7 (4): 353–8. doi:10.1101 / gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Seki N, Ohira M, Nagase T va boshq. (1998). "Odam miyasidan kattaligi bo'yicha cDNA kutubxonalarida cDNA klonlarining xarakteristikasi". DNK rez. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). "Katta oqsillar orasidagi oqsil va oqsillarning o'zaro ta'siri: uzoq cDNAlardan tashkil topgan funktsional tasniflangan kutubxonadan foydalangan holda ikki gibrid skrining". Genom Res. 12 (11): 1773–84. doi:10.1101 / gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikava T va boshq. (2004). "21,243 to'liq uzunlikdagi odam cDNA-larining to'liq ketma-ketligi va tavsifi". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq uzunlikdagi cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Velayos-Baeza A, Vettori A, Kopli RR va boshq. (2005). "Insonning VPS13 genlar oilasini tahlil qilish". Genomika. 84 (3): 536–49. doi:10.1016 / j.ygeno.2004.04.012. PMID 15498460.
Gregori SG, Barlow KF, McLay KE va boshq. (2006). "DNKning ketma-ketligi va odam xromosomasining biologik izohlanishi 1". Tabiat. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 1 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.