Uilyam Shafer - William Schafer

Uilyam Shafer

Uilyam Schafer.jpg
Tug'ilgan
Uilyam Ronald Shafer

(1964-08-29) 1964 yil 29 avgust (56 yosh)
MillatiAmerika Qo'shma Shtatlari, Buyuk Britaniya
Ta'limLakeside High School, DeKalb okrugi, Jorjiya, AQSh
Olma materGarvard universiteti (AB Biology, 1986); Berkli Kaliforniya universiteti (biokimyo fanlari nomzodi, 1991)
Ilmiy martaba
TezisProteinni prenilatsiya qilish saccharomyces cervesiae ' (1990)
Doktor doktoriJasper Reyn
Veb-saythttps://www2.mrc-lmb.cam.ac.uk/group-leaders/n-to-s/william-schafer/

Uilyam Ronald Shafer FRS (1964 yil 29 avgustda tug'ilgan) - bu xatti-harakatning molekulyar va asabiy asoslarini tushunishda muhim hissa qo'shgan nevrolog va genetik. Uning ishi, asosan, nematodada C. elegans, kichik neyron guruhlarining xatti-harakatlarini qanday yaratishini tekshirish uchun fanlararo yondashuvdan foydalangan va u kengroq nevrologiya sohasida juda ta'sirli bo'lgan optogenetik neyro-tasvirlash va xatti-harakatlarning avtomatlashtirilgan fenotipini o'z ichiga olgan uslubiy yondashuvlarni yaratgan. U sensorli o'tkazishda ionotropik retseptorlarning funktsional xususiyatlari va neyronlarning mikrosxemalarida bo'shliqqa o'tish joylari va ekstrasinaptik modulyatsiya rollari bo'yicha muhim kashfiyotlar qildi. Yaqinda u oddiy miyadagi saqlanib qolgan hisoblash printsiplarini anglash maqsadida oddiy neyron konnomomalarining tuzilishi va funktsiyasini o'rganish uchun tarmoq ilmi va boshqarish nazariyasidan nazariy g'oyalarni qo'llagan. U EMBO a'zo, Xush kelibsiz Tergovchi va uning a'zosi Tibbiyot fanlari akademiyasi.

Karyera

Shafer genetik va biokimyogar sifatida o'qigan Berkli Kaliforniya universiteti nazorati ostida Jasper Reyn. Doktorlik dissertatsiyasi davomida u xamirturush tarkibidagi CAAX-box oqsillari, shu jumladan Ras tarkibida prenatlanganligini aniqladi va ushbu modifikatsiya membranani nishonlash va biologik faollik uchun juda zarurligini ko'rsatdi.[1]

Laboratoriyasida postdok sifatida Sintiya Kenyon, u dopaminning lokomotivni inhibe qilishini aniqladi C. elegans va g'ayritabiiy dopamin sezgirligi bo'lgan qurtlar uchun ekranda birinchi neyronal kaltsiy kanal mutantini aniqladi.[2] 1995 yilda kafedraning dotsenti bo'ldi Kaliforniya universiteti, San-Diego.

2004-2005 yillarda ta'tildan so'ng, 2006 yilda u o'zining tadqiqot guruhini Molekulyar biologiya laboratoriyasi Buyuk Britaniyaning Kembrij shahrida. 2020 yilda u a Qirollik jamiyatining a'zosi [3]

Tadqiqot

Genetika bilan kodlangan kaltsiy ko'rsatkichlari: Birinchi genetik kodlangan kaltsiy ko'rsatkichlari 1997 yilda ishlab chiqilgan, ammo dastlab transgenli hayvonlarda ulardan foydalanish qiyin bo'lgan. 2000 yilda Shafer va uning shogirdi Reks Kerr GECI sariq naylon 2 yordamida transgen qurtlarning mushaklari va bitta neyronlaridagi faollikni qayd etish uchun ishlatilishini ko'rsatdilar.[4] Bu optogenetik datchikdan hayvonda asabiy faoliyat dinamikasini qayd etish uchun birinchi marta foydalanish edi. Ushbu texnikadan foydalangan holda, Shafer va uning guruhi ko'plab aniqlangan neyronlarning xususiyatlarini, shu jumladan mexanosensor, xemosensor va nosiseptiv neyronlarning pastki turlarini,[5][6][7] va TMC va TRP kanallari kabi molekulalarning ushbu neyronlarda saqlanadigan hissiy funktsiyalarni bajarishini ko'rsatdi.[8][9][10]

Avtomatlashtirilgan fenotiplash: Shafer guruhi shuningdek, xatti-harakatlarni fenotiplash uchun avtomatlashtirilgan tasvirlash va mashinani ko'rishda foydalanishga kashshof bo'lgan. Yozib olish uchun dastlab ular avtomatlashtirilgan kuzatuv mikroskopidan foydalanganlar C. elegans ko'p soat davomida o'zini tutish va tuxum qo'yadigan vaqtni o'lchash; ushbu tajribalar shuni ko'rsatdiki, qurtlar serotonin tomonidan boshqariladigan xulq-atvor holatlari o'rtasida o'zgarib turadi.[11] Keyinchalik murakkab qurtlarni izlovchilar harakatlanish kabi boshqa harakatlar uchun yuqori tarkibli fenotipik ma'lumotlarni yaratish uchun ishlatilgan;[12][13][14] ushbu yondashuv genlarning asab tizimiga ta'sirini aniq o'lchash va tasniflash uchun juda foydali ekanligini isbotladi.

Tarmoq fanlari: Shafer shuningdek, tarmoq olimlari bilan tuzilmani o'rganish uchun ishlagan C. elegans asabiy konnektom. Xususan, u neyromodulyatsion signalizatsiya asosan ekstrasinaptik bo'lib, simsiz konnektom bilan topologik xususiyatlari va o'zaro ta'sir qilish rejimlarini multipleksli tarmoq sifatida tahlil qilish mumkin bo'lgan parallel simsiz konnektomni hosil qiladi deb tan oldi.[15] Laszlo Barabasi guruhi bilan birgalikda uning guruhi, shuningdek, nazorat qilish nazariyasidan murakkab neyronal konnektom topologiyasiga asoslangan holda asab funktsiyasini bashorat qilishda foydalanish mumkin degan g'oyaning birinchi sinovini o'tkazdi.[16]

Adabiyotlar

  1. ^ Schafer WR, Kim R, Sterne R, Thorner J, Kim SH, Rine J (iyul 1989). "Xamirturush va odamlarning ras genlaridagi onkogen mutatsiyalarning genetik va farmakologik bostirilishi". Ilm-fan. 245 (4916): 379–85. Bibcode:1989Sci ... 245..379S. doi:10.1126 / science.2569235. PMID  2569235.
  2. ^ Schafer WR, Kenyon CJ (1995 yil may). "Caenorhabditis elegansida dopamin va serotoninga moslashish uchun zarur bo'lgan kaltsiy kanalli gomolog". Tabiat. 375 (6526): 73–8. Bibcode:1995 yil 375 yil ... 73S. doi:10.1038 / 375073a0. PMID  7723846.
  3. ^ "Uilyam Shafer". Qirollik jamiyati. Olingan 20 sentyabr 2020.
  4. ^ Kerr R, Lev-Ram V, Baird G, Vinsent P, Tsien RY, Shafer WR (iyun 2000). "C. elegans neyronlari va faringeal mushaklaridagi kaltsiy o'tish vaqtlarini optik tasvirlash". Neyron. 26 (3): 583–94. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 81196-4. PMID  10896155.
  5. ^ Xilliard MA, Apicella AJ, Kerr R, Suzuki H, Bazzicalupo P, Schafer WR (yanvar 2005). "C. elegans ASH neyronlarini in vivo jonli tasvirlash: uyali javob va kimyoviy repelentlarga moslashish". EMBO jurnali. 24 (1): 63–72. doi:10.1038 / sj.emboj.7600493. PMC  544906. PMID  15577941.
  6. ^ Suzuki H, Thiele TR, Faumont S, Ezcurra M, Lockery SR, Schafer WR (iyul 2008). "Caenorhabditis elegansidagi funktsional assimetriya neyronlarni tatib ko'radi va uning ximotaksisdagi hisoblash roli". Tabiat. 454 (7200): 114–7. Bibcode:2008 yil natur.454..114S. doi:10.1038 / nature06927. PMC  2984562. PMID  18596810.
  7. ^ Suzuki H, Kerr R, Bianchi L, Frokjaer-Jensen C, Slone D, Xue J, Gerstbrein B, Driscoll M, Schafer WR (sentyabr 2003). "C. elegans mexanosensor neyronlarning in vivo jonli tasviri yumshoq teginish hissi jarayonida MEC-4 kanalining o'ziga xos rolini namoyish etadi". Neyron. 39 (6): 1005–17. doi:10.1016 / j.neuron.2003.08.015. PMID  12971899.
  8. ^ Kindt KS, Visvanath V, Macpherson L, Quast K, Hu H, Patapoutian A, Schafer WR (may 2007). "Mexanosensatsiyada Caenorhabditis elegans TRPA-1 funktsiyalari". Tabiat nevrologiyasi. 10 (5): 568–77. doi:10.1038 / nn1886. PMID  17450139.
  9. ^ Chatzigeorgiou M, Yoo S, Watson JD, Lee WH, Spencer WC, Kindt KS, Hwang SW, Miller DM, Treinin M, Driscoll M, Schafer WR (iyul 2010). "C. elegans nociceptors-da teginish va termosensatsiyalashda DEG / ENaC va TRP kanallari uchun o'ziga xos rollar". Tabiat nevrologiyasi. 13 (7): 861–8. doi:10.1038 / nn.2581. PMC  2975101. PMID  20512132.
  10. ^ Chatzigeorgiou M, Bang S, Xvan SW, Schafer WR (2013 yil fevral). "tmc-1 natriyga sezgir kanalni kodlaydi.. Tabiat. 494 (7435): 95–99. Bibcode:2013 yil 499 ... 95C. doi:10.1038 / tabiat11845. PMC  4021456. PMID  23364694.
  11. ^ Vagoner LE, Zhou GT, Schafer RW, Schafer WR (1998 yil iyul). "Caenorhabditis elegans-da serotonin bilan xatti-harakatlarning alternativ holatlarini nazorat qilish". Neyron. 21 (1): 203–14. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80527-9. PMID  9697864.
  12. ^ Geng V, Cosman P, Berry CC, Feng Z, Schafer WR (oktyabr 2004). "C elegans fenotiplarini avtomatik kuzatish, xususiyatlarini ajratib olish va tasnifi". Biomedikal muhandislik bo'yicha IEEE operatsiyalari. 51 (10): 1811–20. CiteSeerX  10.1.1.523.8395. doi:10.1109 / TBME.2004.831532. PMID  15490828.
  13. ^ Yemini E, Jucikas T, Grundy LJ, Brown AE, Schafer WR (sentyabr 2013). "Caenorhabditis elegans xulq-atvori fenotiplari ma'lumotlar bazasi". Tabiat usullari. 10 (9): 877–9. doi:10.1038 / nmeth.2560. PMC  3962822. PMID  23852451.
  14. ^ Jigarrang AE, Yemini EI, Grundy LJ, Jucikas T, Schafer WR (yanvar 2013). "Xulq-atvor motivlari lug'atida Caenorhabditis elegans lokomosiyasiga ta'sir qiluvchi genlar klasterlari aniqlangan". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 110 (2): 791–6. Bibcode:2013PNAS..110..791B. doi:10.1073 / pnas.1211447110. PMC  3545781. PMID  23267063.
  15. ^ Bentley B, Branicky R, Barns CL, Chew YL, Yemini E, Bullmore ET, Vértes PE, Schafer WR (dekabr 2016). "Caenorhabditis elegans ko'p qatlamli konnektomi". PLoS hisoblash biologiyasi. 12 (12): e1005283. arXiv:1608.08793. Bibcode:2016PLSCB..12E5283B. doi:10.1371 / journal.pcbi.1005283. PMC  5215746. PMID  27984591.
  16. ^ Yan G, Vértes PE, Towlson EK, Chew YL, Walker DS, Schafer WR, Barabási AL (oktyabr 2017). "Tarmoqni boshqarish printsiplari Caenorhabditis elegans connectome-da neyronlarning ishlashini taxmin qiladi". Tabiat. 550 (7677): 519–523. Bibcode:2017Natur.550..519Y. doi:10.1038 / tabiat24056. PMC  5710776. PMID  29045391.