CRABP2 - CRABP2

CRABP2
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1BLR, 1BM5, 1CBQ, 1CBS, 1XCA, 2CBS, 2FR3, 2FRS, 2FS6, 2FS7, 2G78, 2G79, 2G7B, 3CBS, 3CR6, 3CWK, 3D95, 3D96, 3D97, 3F8A, 3F9D, 3FA6, 3FA7, 3FA8, 3FA9, 3FEK, 3FEL, 3FEN, 3FEP, 3I17, 4I9R, 4I9S, 4M6S, 4M7M, 4QGV, 4QGW, 4QGX, 4YBP, 4YBU, 4YKM, 4YKO, 4YCH, 4YGZ, 4YFP, 4YFQ, 4YGH, 4YH0, 4YFR, 4YOSH, 4YGG, 4YDA, 4YDB, 5HZQ
Identifikatorlar
Taxalluslar	CRABP2, CRABP-II, RBP6, hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil 2
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 180231 MGI: 88491 HomoloGene: 1415 Generkartalar: CRABP2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 1 (odam)
Oxiri	156,705,816 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 3 (sichqoncha)
Oxiri	87,953,376 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• transport faoliyati; • lipid bilan bog'lanish; • retinol bilan bog'lanish; • retinoik kislota bilan bog'lanish; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • retinani bog'lash; • retinoid bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• hujayra tashqari ekzozoma; • endoplazmatik to'r; • hujayra yadrosi; • nukleoplazma; • sitoplazma; • sitozol;
Biologik jarayon	• transkripsiyani tartibga solish, DNK-andozalari; • garov o'sib chiqishini ijobiy tartibga solish; • retinoik kislota metabolik jarayoni; • embrional oldingi morfogenez; • signal uzatish; • retinoik kislota retseptorlari signalizatsiya yo'lini tartibga solish; • epidermis rivojlanishi; • retinoik kislota biosintezi jarayoni; • transport;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	1382
	12904
	ENSG00000143320
	ENSMUSG00000004885
	P29373
	P22935
	NM_001878; NM_001199723
	NM_007759
	NP_001186652; NP_001869
	NP_031785
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Uyali retinoik kislotani bog'laydigan oqsil 2 sitoplazmatik bog'lanishdir oqsil odamlarda kodlanganligi CRABP2 gen.^[5]^[6]^[7]

CRABP2 strukturaviy jihatdan o'xshashdir CRABP1, lekin CRABP2 ning yaqinligi pastroq retinoik kislota (RA).^[5] CRABP2 ko'p miqdordagi retinoik kislota ishlab chiqaradigan hujayralar bilan bog'langan va hujayrada retinoik kislota ta'sirida vositachilik qilishi mumkin.^[5]^[8]

Funktsiya

A vitamini oilasi a'zolari uchun bir qator o'ziga xos tashuvchi oqsillar topildi. Retinoik kislota A vitamini (retinol) ning faol metabolitidir.^[8] Uyali retinoik kislotani bog'laydigan oqsillar (CRABP) past molekulyar og'irlikdagi oqsillar bo'lib, ularning aniq funktsiyasi noma'lum bo'lib qolmoqda.

CRABP2 genining induktivligi bu izoformning retinoik kislota vositachiligida inson terisining o'sishi, differentsiatsiyasi va rivojlanishini tartibga solishda muhim ahamiyatga ega ekanligini ko'rsatadi. CRABP2 retinoik kislota sitosoldan yadroda joylashgan RARlarga (retinoik kislota retseptorlari) metabolizmida va transportida ishtirok etadi.^[5]^[7]^[8]^[9] CRABP2 ma'lum to'qimalarda RAR-b va hujayra retinolini bog'lovchi oqsil 1 genlari bilan birgalikda ifoda etilgan.^[5] CRABP2 geni yangi sintez qilingan regulyator oqsili tomonidan transkripsiyaviy ravishda tartibga solinadi, deb taxmin qilingan.^[7]

To'qimalarning tarqalishi

CRABP2 genining to'qimalarining tarqalishi birinchi navbatda sichqoncha modellari yordamida o'rganilgan. Embrional rivojlanish jarayonida CRABP2 tanadagi to'qimalarda CRABP1 ga qaraganda ancha tarqoq shaklda bo'ladi.^[5] CRABP1 ma'lum mintaqalar uchun ko'proq ajratilgan, ammo u yuqori konsentratsiyalarda ko'rinadi.^[5] CRABP1 va 2 ko'pincha to'qimalarda bir-biriga to'g'ri keladi.^[5]

CRABP2 gen ekspressioni magistral va orqa miyada juda ko'p (va kam miqdordagi oldingi miyada), ammo tananing boshqa sohalarida mavjud.^[5] Oyoq-qo'llar, orqa miya va kranial asab hujayralari kabi tuzilmalar retinoik kislotaning yuqori darajalariga haddan tashqari sezgir ekanligi isbotlangan.^[5] Orqa miyada rombomer segmentatsiyasi va V, VII, VIII, IX va X kranial ganglionlarning rivojlanishi ham qisman CRABP2 ekspressioniga bog'liq bo'lib ko'rinadi.^[5] CRABP2 rivojlanish jarayonida a'zoning dorsal qismida ko'p bo'ladi.^[5]

CRABP2 genlari, shuningdek, embrional rivojlanish jarayonida tanadagi retinoid darajasiga nisbatan kam sezgir bo'lgan tuzilmalarda ham namoyon bo'ladi.^[5] Ushbu tuzilmalarga faringeal sumkalar, foregut, midgut, mandibular va frontal kiradi mezenxima, rivojlanayotgan mushak, interdigital mezenxima, urogenital tizim, optik tomirlar va ichki quloq sezgir epiteliyasi.^[5]

Kamchiliklar

Sichqonlarda A vitamini etishmovchiligi spermatogenez, tartibsiz estrus tsikllari, bachadon epiteliyasidagi o'zgarishlar va homila o'limi va reabsorbsiyasi bilan tugaydigan reproduktiv etishmovchilik bilan bog'liq muammolarni keltirib chiqarishi isbotlangan.^[8]

CRABP2 bilan to'qima retinoik kislotaning yuqori darajalariga sezgir bo'lishi mumkin, bu esa ushbu to'qimalarning rivojlanishida nuqsonlarni keltirib chiqarishi mumkin.^[5]

CRABP2 geni nokaut tadqiqotlari ushbu genning yo'qolishi natijasida kelib chiqadigan har qanday aniq nuqsonlarni aniqlash uchun o'tkazilishi kerak.

O'zaro aloqalar

CRABP2 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan Velosiped D3.^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000143320 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000004885 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b ^v ^d ^e ^f ^g ^h ^men ^j ^k ^l ^m ⁿ ^o Ruberte E, Fridrix V, Morriss-Kay G, Chambon P (Avgust 1992). "Sichqoncha embriogenezi paytida CRABP I va CRABP II transkriptlarining differentsial tarqatish naqshlari". Rivojlanish. 115 (4): 973–987. PMID 1333403.
^ Aström A, Tavakkol A, Pettersson U, Kromie M, Elder JT, Voorhees JJ (sentyabr 1991). "Ikki kishining hujayra retinoik kislota bilan bog'langan oqsillarini (CRABP) molekulyar klonlash. Vivo jonli kattalar odam terisida CRABP-II emas, balki CRABP-I ning retinoik kislota bilan ifodalangan ekspressioni". Biologik kimyo jurnali. 266 (26): 17662–6. PMID 1654334.
^ ^a ^b ^v "Entrez Gen: CRABP2 hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil 2".
^ ^a ^b ^v ^d Zheng WL, Ong DE (1998 yil aprel). "Homiladorlikning dastlabki davrida kalamush bachadonida hujayrali retinol bilan bog'laydigan oqsil va hujayra retinoik kislota bilan bog'langan oqsillarning fazoviy va vaqtinchalik ifodalanishi". Ko'paytirish biologiyasi. 58 (4): 963–970. doi:10.1095 / biolreprod58.4.963. PMID 9546726.
^ Maden M, Ong DE, Summerbell D, Chytil F (aprel 1989). "Retinoid bilan bog'langan oqsillarning rivojlanayotgan a'zoda, regeneratsiyalanuvchi a'zoda va asab tizimida naqsh hosil bo'lishidagi o'rni". Rivojlanish. 107 Qo'shimcha: 109–119. PMID 2561479.
^ Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (Fevral 2003). "Siklin D3 retinoik kislota retseptorlarining kofaktoridir, ularning faoliyatini hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil II ishtirokida modulyatsiya qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (8): 6355–62. doi:10.1074 / jbc.M210697200. PMID 12482873.

Tashqi havolalar

Inson CRABP2 genom joylashuvi va CRABP2 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.

Qo'shimcha o'qish

Eller MS, Oleksiak MF, McQuaid TJ, McAfee SG, Gilchrest BA (Fevral 1992). "Molekulyar klonlash va ikkita CRABP cDNA ning inson terisidan ekspressioni". Eksperimental hujayra tadqiqotlari. 198 (2): 328–36. doi:10.1016 / 0014-4827 (92) 90387-N. PMID 1309505.
Elder JT, Aström A, Pettersson U, Voorhees JJ, Trent JM (Iyul 1992). Inisotopik in situ gibridlash yo'li bilan insonning CRABP-II genini 1q21 xromosomasiga tayinlash " (PDF). Inson genetikasi. 89 (5): 487–90. doi:10.1007 / BF00219171. PMID 1321791.
Aström A, Pettersson U, Voorhees JJ (1992 yil dekabr). "Insonning uyali retinoik kislota bilan bog'laydigan oqsil II genining tuzilishi. Retinoik kislota tomonidan erta transkripsiyaviy tartibga solish". Biologik kimyo jurnali. 267 (35): 25251–5. PMID 1334086.
Tompson JR, Bratt JM, Banaszak LJ (sentyabr 1995). "I hujayrali retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsilning kristalli tuzilishi molekulalararo beta-varaq hosil bo'lishi sababli bog'lanish bo'shlig'iga kirish imkoniyatini oshiradi". Molekulyar biologiya jurnali. 252 (4): 433–46. doi:10.1006 / jmbi.1995.0509. PMID 7563063.
Kleywegt GJ, Bergfors T, Senn H, Le Motte P, Gsell B, Shudo K, Jones TA (dekabr 1994). "Butun trans-retinoik kislota va sintetik retinoid bilan kompleksda I va II oqsillarni bog'laydigan uyali retinoik kislota kristalli tuzilmalari". Tuzilishi. 2 (12): 1241–58. doi:10.1016 / S0969-2126 (94) 00125-1. PMID 7704533.
Stephanou A, Sarlis NJ, Richards R, Handwerger S (Iyul 1994). "Retinoik kislota retseptorlari subtiplari va hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil-II mRNA ning odam trofoblast hujayralarini differentsiatsiyasi paytida ifodasi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 202 (2): 772–80. doi:10.1006 / bbrc.1994.1997. PMID 8048948.
Sanquer S, Eller MS, Gilchrest BA (Fevral 1993). "Retinoidlar va differentsiatsiya holati terining ekvivalentida CRABP II gen ekspressionini modulyatsiya qiladi".. Tergov dermatologiyasi jurnali. 100 (2): 148–53. doi:10.1111 / 1523-1747.ep12462785. PMID 8381448.
Vang L, Li Y, Yan H (yanvar 1997). "Uyali retinoik kislotani bog'laydigan oqsillarning tuzilish-funktsiya munosabatlari. Yovvoyi tipdagi oqsillar va joy yo'naltirilgan mutantlarning ligand bilan bog'lanish xususiyatlarini miqdoriy tahlil qilish". Biologik kimyo jurnali. 272 (3): 1541–7. doi:10.1074 / jbc.272.3.1541. PMID 8999826.
Flagiello D, Apiou F, Gibaud A, Poupon MF, Dutrillaux B, Malfoy B (1997). "Uyali retinoik kislota bilan bog'laydigan oqsil 1 (CRABP1) va 2 (CRABP2) ni insonning xromosoma bandiga mos ravishda 15q24 va 1q21.3 ga in situ hibridizatsiyasi bo'yicha genlarni tayinlash". Sitogenetika va hujayra genetikasi. 76 (1–2): 17–8. doi:10.1159/000134502. PMID 9154115.
Brar AK, Kessler CA, Meyer AJ, Cedars MI, Jikihara H (Mar 1996). "Retinoik kislota inson endometriyal stromal hujayralarining in vitro dekiduallashuvini bostiradi". Molekulyar inson ko'payishi. 2 (3): 185–93. doi:10.1093 / molehr / 2.3.185. PMID 9238678.
Chen X, Tordova M, Gilliland GL, Vang L, Li Y, Yan X, Dji X (may 1998). "Apo-hujayrali retinoik kislota bilan bog'lovchi II turdagi (R111M) oqsilning kristalli tuzilishi ligandga kirish mexanizmini taklif qiladi" (PDF). Molekulyar biologiya jurnali. 278 (3): 641–53. doi:10.1006 / jmbi.1998.1734. PMID 9600845.
Vang L, Li Y, Abildgaard F, Markli JL, Yan H (sentyabr 1998). "II turdagi odamning uyali retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsilining NMR eritmasi tuzilishi: ligandni bog'lash uchun ta'siri". Biokimyo. 37 (37): 12727–36. doi:10.1021 / bi9808924. PMID 9737849.
Vang L, Yan H (1998 yil sentyabr). "NMR tadqiqotlari Arg111 uchun odamning II turdagi hujayra retinoik kislota biriktiruvchi oqsilining tuzilishi va dinamik xususiyatlarini saqlashda muhim rol o'ynaydi". Biokimyo. 37 (37): 13021–32. doi:10.1021 / bi981021x. PMID 9737883.
Chaudhuri BN, Kleywegt GJ, Broutin-L'Hermite I, Bergfors T, Senn H, Le Motte P, Partouche O, Jones TA (noyabr 1999). "Sintetik retinoidlar bilan kompleksda I va II oqsillarni bog'laydigan uyali retinoik kislota tuzilmalari". Acta Crystallographica bo'limi D. 55 (Pt 11): 1850-7. doi:10.1107 / S0907444999011026. PMID 10531482.
Budxu AS, Noy N (2002 yil aprel). "Retinoik kislotani uyali retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil II va retinoik kislota retseptorlari o'rtasida to'g'ridan-to'g'ri kanalizatsiya qilish sut bezlari karsinomasi hujayralarini retinoik kislota bilan bog'liq o'sishni to'xtatishga sezgir qiladi". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (8): 2632–41. doi:10.1128 / MCB.22.8.2632-2641.2002. PMC 133717. PMID 11909957.
Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (Fevral 2003). "Siklin D3 retinoik kislota retseptorlarining kofaktoridir, ularning faoliyatini hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil II ishtirokida modulyatsiya qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (8): 6355–62. doi:10.1074 / jbc.M210697200. PMID 12482873.
Behrens GM, Genschel J, Shmidt RE, Shmidt HH (may 2003). "OIV bilan bog'liq lipodistrofiyada LMNA, uning targ'ibotchi mintaqasi va hujayra retinoik kislota bog'lovchi oqsil II (CRABP II) mutatsiyalarining etishmasligi". Evropa tibbiy tadqiqotlar jurnali. 8 (5): 221–5. PMID 12844477.
Van den Bogaerdt AJ, El Ghalzzuri A, Hensbergen PJ, Reijnen L, Verkerk M, Kroon-Smits M, Middelkoop E, Ulrich MM (Mar 2004). "CRABP-II ning dermis va teri osti yog'idan olingan fibroblastlarda differentsial ifodasi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 315 (2): 428–33. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.01.069. PMID 14766225.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000143320 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000004885 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[Ruberte-5] v ^d ^e ^f ^g ^h ^men ^j ^k ^l ^m ⁿ ^o Ruberte E, Fridrix V, Morriss-Kay G, Chambon P (Avgust 1992). "Sichqoncha embriogenezi paytida CRABP I va CRABP II transkriptlarining differentsial tarqatish naqshlari". Rivojlanish. 115 (4): 973–987. PMID 1333403.

[pmid1654334-6] Aström A, Tavakkol A, Pettersson U, Kromie M, Elder JT, Voorhees JJ (sentyabr 1991). "Ikki kishining hujayra retinoik kislota bilan bog'langan oqsillarini (CRABP) molekulyar klonlash. Vivo jonli kattalar odam terisida CRABP-II emas, balki CRABP-I ning retinoik kislota bilan ifodalangan ekspressioni". Biologik kimyo jurnali. 266 (26): 17662–6. PMID 1654334.

[entrez-7] v "Entrez Gen: CRABP2 hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil 2".

[Zheng-8] v ^d Zheng WL, Ong DE (1998 yil aprel). "Homiladorlikning dastlabki davrida kalamush bachadonida hujayrali retinol bilan bog'laydigan oqsil va hujayra retinoik kislota bilan bog'langan oqsillarning fazoviy va vaqtinchalik ifodalanishi". Ko'paytirish biologiyasi. 58 (4): 963–970. doi:10.1095 / biolreprod58.4.963. PMID 9546726.

[Maden-9] Maden M, Ong DE, Summerbell D, Chytil F (aprel 1989). "Retinoid bilan bog'langan oqsillarning rivojlanayotgan a'zoda, regeneratsiyalanuvchi a'zoda va asab tizimida naqsh hosil bo'lishidagi o'rni". Rivojlanish. 107 Qo'shimcha: 109–119. PMID 2561479.

[pmid12482873-10] Despouy G, Bastie JN, Deshaies S, Balitrand N, Mazharian A, Rochette-Egly C, Chomienne C, Delva L (Fevral 2003). "Siklin D3 retinoik kislota retseptorlarining kofaktoridir, ularning faoliyatini hujayra retinoik kislota bilan bog'lovchi oqsil II ishtirokida modulyatsiya qiladi". Biologik kimyo jurnali. 278 (8): 6355–62. doi:10.1074 / jbc.M210697200. PMID 12482873.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]