Kichik nukleolyar RNK SNORD64 - Small nucleolar RNA SNORD64

Kichik yadroli RNK SNORD64
RF00570.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash SNORD64
Identifikatorlar
BelgilarSNORD64
Alt. BelgilarsnoHBII-13
RfamRF00570
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; snRNA; snoRNA; C / D-quti
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0000593
PDB tuzilmalarPDBe

SNORD64 (shuningdek, nomi bilan tanilgan HBII-13) a kodlamaydigan RNK (ncRNA) molekulasi, boshqalarning biogenezida (modifikatsiyasida) ishlaydi kichik yadroli RNKlar (snRNAlar). Ushbu turdagi modifikatsiya qiluvchi RNK nukleus snRNA biogenezining asosiy joyi bo'lgan ökaryotik hujayradan. Bu a nomi bilan tanilgan kichik nukleolyar RNK (snoRNA) va shuningdek, ko'pincha qo'llanma RNK deb nomlanadi.

SNORD64 ga tegishli C / D qutisi C box (UGAUGA) va D box (CUGA) deb nomlanuvchi konservalangan ketma-ketlik motiflarini o'z ichiga olgan snoRNAs klassi. C / D oilaviy qutisi a'zolarining aksariyati saytga xos 2'-O- ni boshqarishda ishlaydi.metilatsiya substrat RNKlari.[1]

snoRNA HBII-13 asosan miyaning to'qimalarida, shuningdek o'pka, buyrak va mushaklarda ifodalanadi;[2] ammo HBII-13 aniqlangan maqsadli RNKga ega emas.[3]HBII-13 geni 460 kbda joylashgan intron ota tomonidan ifodalangan katta transkripsiya birligi (SNURF-SNRNP -UBE3A AS) bilan bir qatorda boshqa snoRNAs HBII-436, HBII-437, HBII-438A / B va HBII-85, HBII-52 klasterlari.[4] Ushbu xost geni ona tomonidan ifoda etilgan UBE3A geni uchun antisens transkriptdir.

Adabiyotlar

  1. ^ Galardi S, Fatica A, Bachi A, Scaloni A, Presutti C, Bozzoni I (oktyabr 2002). "Tozalangan quti C / D snoRNP'lar, maqsadli RNKni in vitro joyga xos 2'-O-metilatsiyasini ko'paytirishga qodir". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (19): 6663–8. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC  134041. PMID  12215523.
  2. ^ Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A (dekabr 2000). "G'ayrioddiy genomik tashkilotni namoyish qiluvchi miyaga xos va imprintlangan kichik nukleolyar RNK genlarini aniqlash". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 97 (26): 14311–6. doi:10.1073 / pnas.250426397. PMC  18915. PMID  11106375.
  3. ^ Lestrade L, Weber MJ (2006 yil yanvar). "snoRNA-LBME-db, insonning H / ACA va C / D qutilari snoRNAlarining keng ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D158-62. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. doi:10.1093 / nar / gkj002. PMC  1347365. PMID  16381836.
  4. ^ Runte M, Hüttenhofer A, Gross S, Kiefmann M, Horsthemke B, Buiting K (Noyabr 2001). "IC-SNURF-SNRPN transkripti bir nechta kichik nukleolyar RNK turlari uchun xost va UBE3A uchun antisens RNK sifatida xizmat qiladi". Inson molekulyar genetikasi. 10 (23): 2687–700. doi:10.1093 / hmg / 10.23.2687. PMID  11726556.

Tashqi havolalar