Kichik nukleolyar RNK sR8 - Small nucleolar RNA sR8
| sR8 | |
|---|---|
 sR8 konsensusining ketma-ketligi | |
| Identifikatorlar | |
| Belgilar | sR8 |
| Rfam | RF01311 |
| Boshqa ma'lumotlar | |
| RNK turi | snoRNA; CD-quti |
| Domen (lar) | Sulfolobaceae, Thermococcaceae |
| PDB tuzilmalar | PDBe |
Kichik nukleolyar RNK sR8 a kodlamaydigan RNK ga tegishli C / D qutisi sinf snoRNAlar. sR8, boshqa C / D qutisi snoRNA bilan birga, 2′- ni bajaradi.O-metilatsiya ning riboza ning maqsadli qatorida ribosomal RNK.[1][2] Maqsadga C va D katakchalari orqali erishiladi, ular qisqa qismlardir konservalangan ketma-ketliklar, shuningdek C '/ D' qutilari (C va D qutilarining ichki ekvivalentlari). Ushbu ketma-ketliklar asosiy juftlik bilan nukleotidlar ularning metilatsiyasini yo'naltirish uchun maqsadli rRNKda.[3]
sR8 RNK a tarkibidagi protein tarkibiy qismlari bilan birga ishlaydi ribonukleoprotein (RNP) kompleksi. sR8 tuzilgan holda topilgan maqsadlar metilatsiyasini boshqarishi mumkin poyalar Bu shuni anglatadiki, kompleks tarkibiy qismi bunday tuzilmalarni echishga qodir.[3]
Model tizim sifatida
sR8 "model" hisoblanadi[3] C / D box sRNA va C / D box snoRNAs va ribonukleoprotein komplekslarining tabiatini o'rganadigan bir necha tajribalarda ishlatilgan.[4][5] Bu, ayniqsa, tadqiqotlarda foydalidir, chunki RNP to'liq tuzilishi mumkin in vitro.[3]
dan sR8 RNK gipertermofil Metanocaldococcus jannaschii yoritish uchun ishlatilgan 3 o'lchovli C / D qutisi RNP tuzilishi.[6] Kutilmaganda tuzilish dimerik ekanligi aniqlandi, unda ikkita RNK molekulasi bir xil kompleksdagi bir nechta oqsillar bilan bog'lanadi.[6][7]
Adabiyotlar
- ^ Galardi, S .; Fatika, A .; Bachi, A .; Skaloni, A .; Presutti, C .; Bozzoni, I. (2002 yil oktyabr). "Tozalangan quti C / D snoRNP'lari maqsadga muvofiq RNKni Vitroda saytga xos 2'-O-metilatsiyasini ko'paytirishga qodir". Molekulyar va uyali biologiya. 22 (19): 6663–6668. doi:10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002. PMC 134041. PMID 12215523.
- ^ Kiss-Laszlo, Z; Genri Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). "Preribosomal RNKning o'ziga xos riboz metilatsiyasi: kichik nukleolyar RNKlar uchun yangi funktsiya". Hujayra. 85 (7): 1077–1088. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81308-2. PMID 8674114.
- ^ a b v d Appel CD, Maksvell ES (iyun 2007). "Qo'llanmaning strukturaviy xususiyatlari: arxeologik quti uchun zarur bo'lgan maqsadli RNK dupleksi C / D sRNA boshqaradigan nukleotid 2'-O-metilasyon". RNK. 13 (6): 899–911. doi:10.1261 / rna.517307. PMC 1869030. PMID 17438123.
- ^ Tran, E .; Chjan X .; Leki, L .; Maksvell, E. S. (2005). "Maqsadli RNKlarning samarali 2'-O-metilatsiyasi uchun C / D sRNP kompleksining arxeologik qutisi C / D qutisi va C '/ D' RNPlari o'rtasida saqlanadigan masofa talab qilinadi". RNK. 11 (3): 285–293. doi:10.1261 / rna.7223405. PMC 1370718. PMID 15661846.
- ^ Rashid R, Aittaleb M, Chen Q, Spiegel K, Demeler B, Li H (oktyabr 2003). "Archaeal quti C / D kichik ribonukleoprotein zarralarini nosimmetrik yig'ish uchun funktsional talab". J. Mol. Biol. 333 (2): 295–306. doi:10.1016 / j.jmb.2003.08.012. PMID 14529617.
- ^ a b Bleichert F, Gagnon KT, Brown BA va boshq. (Sentyabr 2009). "Archaeal quti uchun dimerik tuzilish C / D kichik ribonukleoproteinlar". Ilm-fan. 325 (5946): 1384–7. doi:10.1126 / science.1176099. PMC 2975540. PMID 19745151.
- ^ "Study kutilmagan qadimiy uyali tuzilmani ochib beradi". PhysOrg.com.