Tanatotranskriptom - Thanatotranscriptome

DNK mikroarray chap sichqonchaning o'ng tomonida inson genlarining ifodasini tahlil qilish uchun ishlatiladi.

The transkriptom belgilaydi (maydonlarida biokimyo, mikrobiologiya va biofizika ning tanatologiya va xususan sud tibbiyoti ) barchasi RNK qismining stenogrammasidan genom vaqtdan keyin 24-48 soat davomida o'lik tananing ichki organlarida hanuzgacha faol yoki uyg'ongan o'lim.[1] · [2] (Yaqinda ushbu 48 soat ichida ba'zi genlar ifodalanishda davom etayotgani ko'rsatildi hujayralar ishlab chiqarish mRNA va homila rivojlanishining oxiridan beri inhibe qilingan ba'zi genlar yana ifoda etilgan) [3]

Tanatotranskriptomik tahlil

Bu mumkin serologiya o'limdan keyin xarakterlanadi transkriptom ning to'qima ma'lum bir hujayra turi yoki transkriptomlarni eksperimental har xil sharoitlar o'rtasida taqqoslash.

Bu tahlil qilish uchun qo'shimcha bo'lishi mumkin tanatomikrobioma ning o'zgarishini yaxshiroq tushunish uchun nekromassa o'limidan keyingi kunlarda;.[4]

"O'lik" to'qimada transkriptomning xarakteristikasi va miqdorini aniqlash va sharoitlar ma'lumotlarini aniqlash mumkin genlar aktivlari, ning tartibga solish mexanizmlarini aniqlash uchun Genlarning ifodasi va genlarni ekspressionatsiya qilish tarmoqlarini o'rnatish.

Analitik usullar

Bir vaqtning o'zida ko'p miqdordagi mRNK turlarining kontsentratsiyasini o'lchash uchun ishlatiladigan texnikaga quyidagilar kiradi Mikroarray, yuqori o'tkazuvchanlikni ketma-ketligi dedi RNK RNK-sek.

Ilmiy tarix

O'limdan keyingi transkriptomning mavjudligiga oid ko'rsatmalar hech bo'lmaganda 21-asrning boshidan beri mavjud edi,[5] lekin ichida ilmiy nashrlar so'z transkriptom birinchi bo'lib Javan va boshqalar tomonidan taklif qilingan ko'rinadi. 2015 yilda;[6]

Da Vashington universiteti, Piter Nobl, Aleks Pozitkov va ularning hamkasblari yaqinda (2016) sichqonlar yoki zebrafish o'lganidan keyin 2 kun (48 soat) o'tgach, ko'plab genlar hali ham ularning tarkibida ishlashini tasdiqladilar tanasi.[3]
miqdoridagi o'zgarishlar mRNA tanada juda xilma-xil funktsiyalarga ega yuzlab genlar vafotidan keyin uyg'onganligini isbotlaydilar 548 gen shu tariqa vafotidan keyin uyg'ongan zebrafish va 515 laboratoriya sichqonlari.[3]Shunday qilib uyg'ongan genlar orasida organizmning rivojlanishida ishtirok etadigan genlar, shu jumladan, odatda faqat faollashtirilgan genlar mavjud bachadonda yoki ovoda (tuxumda) xomilalik rivojlanish davrida.[3]

Ilovalar

Ushbu ma'lumot kelajakda quyidagilarga olib kelishi mumkin:

  • "Aniqroq va aniqroq hodisaga" ta'rifini tuzing.o'lim ";
  • Tomonidan o'lim vaqti aniqroq sud tibbiyoti (yoki biolog yoki veterinariya shifokori Ekologik salomatlik a) holatisiz soatlab yoki zaharlanish sabablari to'g'risida ma'lumotga muhtoj bo'lgan tergov zoonoz masalan.
    Biz uzoqmiz, ammo agar bu hodisaning qadamlarini yaxshiroq tushunsak Inson, sud orqali sud orqali a "o'limdan keyingi serologiya"[7] Ehtimol, kelajakda, mRNK dozasiga ko'ra, o'limdan keyingi vaqtni aniqroq aniqlang (o'lim sharoitlarini tiklash uchun tekshiruvlar uchun foydali bo'lishi mumkin bo'lgan bir necha kun ichida emas, soatlab, hatto daqiqalarda)[3]).
  • Hodisasini yoritib bering hujayralar o'limi ning apoptoz yoki tananing o'limi va xususan ishemiya (miokard shu jumladan[8]) va uning jarayoni shifo yoki chidamlilik, ehtimol ularni engillashtirish uchun.
    Ushbu genning qayta tiklanishi, shuningdek, bu hayvonlarning o'limidan keyin hujayralarda 48 soat davomida uyali mexanizmni faollashtirish uchun etarli energiya bo'lishini anglatadi.[3] Ushbu genlarning hech bo'lmaganda bir qismi fiziologik davolanish, davolanish yoki "avto-reanimatsiya" bilan shug'ullanadigan genlar kabi ko'rinadi.[3]
  • Saraton kasalligini tushuning. O'limdan ko'p o'tmay qayta faollashgan genlar orasida ba'zi genlar jarayonida qatnashganligi aniqlandi saraton (faollikning eng yuqori darajasi bilan qayta faollashtirilgan o'limdan keyin taxminan 24 soat o'tgach)[3]); ushbu hodisani batafsil tushunish kanserogenez fenomeniga oydinlik kiritishi va yaxshi kurashish uchun ba'zi yangi elementlarni keltirishi mumkin.
  • Organ transplantatsiyasi sifatini oshirish. Darhaqiqat, hayvonlarda o'limdan so'ng saraton bilan bog'liq genlarning faollashishi bizni ushbu transplantatsiya qilingan odamlarda saraton kasalligini kamaytirish uchun organ transplantatsiyasi vaqtini ko'rib chiqishga olib keladigan ma'lumotdir.[3] Yangi jigar payvand qilingan odamlar davolanishdan keyin statistik jihatdan odatdagidan ko'proq saraton kasalligini keltirib chiqarmoqda. Ushbu hodisa ularga o'rnatilgan dietaga bog'liq edi yoki ular tanasi uchun qabul qilingan immunosupressiv dorilar transplantatsiyani rad etmaydi.[3] Bir gipoteza (hali tasdiqlanmagan) - saraton genlari faollashgan jigar ning donor ham rol o'ynashi mumkin.[3]
  • Odamlarda ham shunday bo'ladimi, chunki avvalgi tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, travma, yurak xuruji yoki bo'g'ilib o'lgan odamlarda turli genlar, shu jumladan yurak mushagi qisqarishi va jarohatni davolash bilan shug'ullanadiganlar, o'limdan keyin 12 soatdan ko'proq vaqt davomida faol bo'lishgan.[8] Xuddi shunday gen tishlari pulpasi uchun.[9] 2015 yilda ba'zi mualliflar "thanatotranscriptome apoptotik "[10]
  • Yana bir gipotezani sinab ko'ringki, o'limdan so'ng "supressor genlar" faolligining tez pasayishi (odatda boshqa genlarning faollashishiga to'sqinlik qiladi, shu jumladan homila davridan keyin kerak bo'lmaydiganlar), hech bo'lmaganda shu qisqa vaqt ichida uxlab yotgan genlarning uyg'onishiga imkon beradi. vaqt davri.[3]

Shuningdek qarang

Adabiyotlar

  1. ^ Pozhitkov, A. E., Neme, R., Domazet-Loso, T., Leroux, B., Soni, S., Tautz, D., & Noble, P. A. (2016). Tanatotranskriptom: organizm o'limidan so'ng faol ravishda ifodalangan genlar. bioRxiv, 058305.
  2. ^ Javan, G. T., Can, I., Finley, S. J., & Soni, S. (2015). Kadavrlarning jigari bilan bog'langan apoptotik tanatotranskriptom. Sud ekspertizasi, tibbiyot va patologiya, 11 (4), 509-516 (xulosa ).
  3. ^ a b v d e f g h men j k l Uilyams, Anna (2016) "O'limdan ikki kun o'tgach, hayotda uchqun paydo bo'lgan yuzlab genlar (Ko'pgina genlarning o'limidan 48 soat o'tgach ham ishlashini aniqlash kashfiyot organlari transplantatsiyasi, sud ekspertizasi va o'lim haqidagi ta'rifimizga ta'sir qiladi) ”; New Scientist, 2016 yil 21-iyun, sharhlovchi va maqola intitulé “O'limdan keyin genlar faollashadi”Dont la référence est BioRxiv, DOI: 10.1101 / 058305; DOI: 10.1101 / 058370
  4. ^ Javan, G. T., Finley, S. J., Abidin, Z. va Mulle, J. G. (2016) Tanatomikrobioma: o'limning mikrobial jumboqining yo'qolgan qismi. Mikrobiologiya chegaralari, 7
  5. ^ Javan, G. T., Can, I., Finley, S. J., & Soni, S. (2015). Kadavrlarning jigari bilan bog'langan apoptotik tanatotranskriptom. Sud tibbiyoti, tibbiyot va patologiya, 11 (4), 509-516.
  6. ^ Javan, G. T., Kvon, I., Finley, S. J. va Li, Y. (2015). Biokimyo va biofizika bo'yicha hisobotlar.
  7. ^ Moreno, L. I., Tate, C. M., Knott, E. L., McDaniel, J. E., Rogers, S. S., Koons, B. W., ... & Robertson, J. M. (2012). Sud ekspertizasi uchun mRNK miqdorini aniqlash uchun samarali uy xo'jaligi genini aniqlash. Sud ekspertizasi jurnali, 57 (4), 1051-1058 (xulosa ).
  8. ^ a b Gonsales-Errera, L., Valenzuela, A., Marchal, J. A., Lorente, J. A. va Villanueva, E. (2013). RNK yaxlitligi va inson miokard to'qimalarida gen ekspressioni, perikardial suyuqlik va qon va uning o'limdan keyingi barqarorligi bo'yicha tadqiqotlar. Xalqaro sud ekspertizasi, 232 (1), 218-228 (xulosa ).
  9. ^ Poor, V. S., Lukacs, D., Nagy, T., Rach, E., & Sipos, K. (2016). Odamning tish pulpasida RNKning parchalanish darajasi o'limdan keyingi oraliqni aniqlaydi. Xalqaro yuridik tibbiyot jurnali, 130 (3), 615-619 (xulosa ).
  10. ^ Javan, G. T., Can, I., Finley, S. J., & Soni, S. (2015). Kadavrlarning jigari bilan bog'langan apoptotik tanatotranskriptom. Sud ekspertizasi, tibbiyot va patologiya, 11 (4), 509-516 (xulosa.