GABARAPL2 - GABARAPL2

GABARAPL2
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	4CO7
Identifikatorlar
Taxalluslar	GABARAPL2, ATG8, ATG8C, GATE-16, GATE16, GEF-2, GEF2, GABA A tipidagi retseptorlari 2 ga o'xshash oqsil
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 607452 MGI: 1890602 HomoloGene: 68550 Generkartalar: GABARAPL2
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 16 (odam)
Oxiri	75,577,881 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 8 (sichqoncha)
Oxiri	111,953,612 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• GABA retseptorlari bilan bog'lanish; • mikrotubulani bog'lash; • ATPazni bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • beta-tubulin bilan bog'lanish; • SNARE majburiy; • ubikuitin protein ligaz bilan bog'lanish;
Uyali komponent	• sitoplazma; • Golgi apparati; • Golgi membranasi; • hujayra ichidagi; • avtofagosoma; • avtofagosoma membranasi; • sitoplazmatik vazikula; • sitozol;
Biologik jarayon	• ATPase faolligini ijobiy tartibga solish; • avtofagiya; • oqsillarni tashish; • proteazomal protein katabolik jarayonining salbiy regulyatsiyasi; • ichki Golgi pufakchali vositasi; • makroavtofagiya; • GO: 0000046 avtofagosomaning pishib etish jarayoni; • avtofagosoma yig'ilishi; • mitoxondriyaning otofagiyasi; • azot ochligiga uyali javob;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	11345
	93739
	ENSG00000034713
	ENSMUSG00000031950
	P60520
	P60521
	NM_007285
	NM_026693
	NP_009216
	NP_080969
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Gamma-aminobutirik kislota retseptorlari bilan bog'liq oqsilga o'xshash 2 a oqsil odamlarda kodlanganligi GABARAPL2 gen.^[5]^[6]

O'zaro aloqalar

GABARAPL2 ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan ULK1,^[7] ATG4B,^[8]^[9] va FAM134B.^[10]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000034713 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031950 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (iyun 2001). "GABA (A) retseptorlari bilan bog'liq oqsilning uchta odam va ikkita sichqonchani homologlarini klonlash, ekspression shakllari va xromosoma lokalizatsiyasi". Genomika. 74 (3): 408–13. doi:10.1006 / geno.2001.6555. PMID 11414770.
^ "Entrez Gen: GABARAPL2 GABA (A) retseptorlari bilan bog'liq oqsilga o'xshash 2".
^ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (dekabr 2000). "Unc-51 ga o'xshash kinaza va mikrotubulaga bog'liq bo'lgan oqsilning yorug'lik zanjiri miyadagi 3 ta bog'liq oqsillarning o'zaro ta'siri: aksonal cho'zishda vesikulyar transportning mumkin bo'lgan roli". Miya tadqiqotlari. Molekulyar miya tadqiqotlari. 85 (1–2): 1–12. doi:10.1016 / S0169-328X (00) 00218-7. PMID 11146101.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Teylor P, Klimi S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Konnor L, Li M, Teylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Chjan S, Ornatskiy O, Buxman YV, Etier M, Sheng Y, Vasilesku J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duelel HS, Styuart II, Kuehl B, Xogue K, Kolvill K, Gladvish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Molekulyar tizimlar biologiyasi. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Stelzl U, Vorm U, Lalovski M, Xenig C, Brembek FH, Goler H, Stroedik M, Zenkner M, Shoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Avraam C, Bok N, Kitsman S, Gyedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier V, Lehrach H, Wanker EE (sentyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'i: proteomni izohlash uchun manba". Hujayra. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
^ Xaminets, Aliaksandr; Geynrix, Tereza; Mari, Muriel; Grumati, Paolo; Xuebner, Antje K.; Akutsu, Masato; Liebman, Lyuts; Stolz, Aleksandra; Nitsshe, Sandor (2015-06-18). "Endoplazmik retikulum aylanishini selektiv otofagiya bilan tartibga solish". Tabiat. 522 (7556): 354–358. doi:10.1038 / tabiat14498. ISSN 0028-0836. PMID 26040720. S2CID 4449106.

Qo'shimcha o'qish

Rohwer A, Kitshteyn V, Marks F, Gschwendt M (Iyul 1999). "A6 bilan bog'liq bo'lgan oqsilni klonlash, ifodalash va tavsiflash". Evropa biokimyo jurnali / FEBS. 263 (2): 518–25. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00537.x. PMID 10406962.
Sagiv Y, Legesse-Miller A, Porat A, Elazar Z (2000 yil aprel). "GATE-16, membranani tashish modulyatori, NSF va Golgi v-SNARE GOS-28 bilan o'zaro ta'sir qiladi". EMBO jurnali. 19 (7): 1494–504. doi:10.1093 / emboj / 19.7.1494. PMC 310219. PMID 10747018.
Xartli JL, Temple GF, Brasch MA (Nov 2000). "In vitro saytga xos rekombinatsiya yordamida DNKni klonlash". Genom tadqiqotlari. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (dekabr 2000). "Unc-51 ga o'xshash kinaza va mikrotubulaga bog'liq bo'lgan oqsilning yorug'lik zanjiri miyadagi 3 ta bog'liq oqsillarning o'zaro ta'siri: aksonal cho'zishda vesikulyar transportning mumkin bo'lgan roli". Miya tadqiqotlari. Molekulyar miya tadqiqotlari. 85 (1–2): 1–12. doi:10.1016 / S0169-328X (00) 00218-7. PMID 11146101.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000 yil sentyabr). "Keng ko'lamli cDNA sekvensiyasi bilan aniqlangan yangi oqsillarni tizimli hujayralararo lokalizatsiyasi". EMBO hisobotlari. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-report / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Tanida I, Tanida-Miyake E, Nishitani T, Komatsu M, Yamazaki H, Ueno T, Kominami E (Mar 2002). "Murine Apg12p uchta Apg8p gomologidan ko'ra murin Apg7p uchun substratni afzal ko'radi". Biokimyoviy va biofizik tadqiqotlari. 292 (1): 256–62. doi:10.1006 / bbrc.2002.6645. PMID 11890701.
Scherz-Shouval R, Sagiv Y, Shorer H, Elazar Z (2003 yil aprel). "GATE ichidagi transport modulyatori bo'lgan GATE-16 ning COOH terminali inson sistein proteaz HsApg4A tomonidan ajratilgan". Biologik kimyo jurnali. 278 (16): 14053–8. doi:10.1074 / jbc.M212108200. PMID 12473658.
Wiemann S, Arlt D, Huber V, Vellenayter R, Shlyeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sultmann H, Poustka A (2004 yil oktyabr). "ORFeome'dan biologiyaga: funktsional genomika quvuri". Genom tadqiqotlari. 14 (10B): 2136-44. doi:10.1101 / gr.2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Xao T, Xirozane-Kishikava T, Drikot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Gedehoussou N, Klitgord N, Saymon S, Boxem M, Milshteyn S, Rozenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Vong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Ducette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (oktyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'ining proteom miqyosli xaritasi tomon". Tabiat. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Sou YS, Tanida I, Komatsu M, Ueno T, Kominami E (2006 yil fevral). "Fosfatidiletanolaminga qo'shimcha ravishda fosfatidilserin - bu sut emizuvchilarning Atg8 modifikatorlari, LC3, GABARAP va GATE-16 ning in vitro maqsadidir". Biologik kimyo jurnali. 281 (6): 3017–24. doi:10.1074 / jbc.M505888200. PMID 16303767.
Mehrle A, Rozenfelder H, Shupp I, del Val C, Arlt D, Xahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber V, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (Yanvar 2006). "2006 yilda LIFEdb ma'lumotlar bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 34 (Ma'lumotlar bazasi muammosi): D415-8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Teylor P, Klimi S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Konnor L, Li M, Teylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Chjan S, Ornatskiy O, Buxman YV, Etier M, Sheng Y, Vasilesku J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duelel HS, Styuart II, Kuehl B, Xogue K, Kolvill K, Gladvish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Molekulyar tizimlar biologiyasi. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 16 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000034713 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000031950 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid11414770-5] Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (iyun 2001). "GABA (A) retseptorlari bilan bog'liq oqsilning uchta odam va ikkita sichqonchani homologlarini klonlash, ekspression shakllari va xromosoma lokalizatsiyasi". Genomika. 74 (3): 408–13. doi:10.1006 / geno.2001.6555. PMID 11414770.

[entrez-6] "Entrez Gen: GABARAPL2 GABA (A) retseptorlari bilan bog'liq oqsilga o'xshash 2".

[pmid11146101-7] Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (dekabr 2000). "Unc-51 ga o'xshash kinaza va mikrotubulaga bog'liq bo'lgan oqsilning yorug'lik zanjiri miyadagi 3 ta bog'liq oqsillarning o'zaro ta'siri: aksonal cho'zishda vesikulyar transportning mumkin bo'lgan roli". Miya tadqiqotlari. Molekulyar miya tadqiqotlari. 85 (1–2): 1–12. doi:10.1016 / S0169-328X (00) 00218-7. PMID 11146101.

[pmid17353931-8] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Teylor P, Klimi S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Konnor L, Li M, Teylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Mur L, Chjan S, Ornatskiy O, Buxman YV, Etier M, Sheng Y, Vasilesku J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duelel HS, Styuart II, Kuehl B, Xogue K, Kolvill K, Gladvish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mass-spektrometriya bo'yicha odam oqsillari va oqsillarning o'zaro ta'sirini keng miqyosda xaritalash". Molekulyar tizimlar biologiyasi. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid16169070-9] Stelzl U, Vorm U, Lalovski M, Xenig C, Brembek FH, Goler H, Stroedik M, Zenkner M, Shoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Avraam C, Bok N, Kitsman S, Gyedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier V, Lehrach H, Wanker EE (sentyabr 2005). "Odamning oqsil va oqsil bilan o'zaro aloqasi tarmog'i: proteomni izohlash uchun manba". Hujayra. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

[10] Xaminets, Aliaksandr; Geynrix, Tereza; Mari, Muriel; Grumati, Paolo; Xuebner, Antje K.; Akutsu, Masato; Liebman, Lyuts; Stolz, Aleksandra; Nitsshe, Sandor (2015-06-18). "Endoplazmik retikulum aylanishini selektiv otofagiya bilan tartibga solish". Tabiat. 522 (7556): 354–358. doi:10.1038 / tabiat14498. ISSN 0028-0836. PMID 26040720. S2CID 4449106.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]