Mir-199 mikroRNK prekursori - Mir-199 microRNA precursor

mir-199 mikroRNK prekursori
RF00144.jpg
Bashorat qilingan ikkilamchi tuzilish va ketma-ketlikni saqlash mir-199
Identifikatorlar
Belgilarmir-199
RfamRF00144
miRBaseMI0000242
miRBase oilasiMIPF0000040
Boshqa ma'lumotlar
RNK turiGen; miRNA
Domen (lar)Eukaryota
GOGO muddati GO bilan boshlanishi kerak: GO muddati GO bilan boshlanishi kerak:
SOSO: 0001244
PDB tuzilmalarPDBe

The miR-199 mikroRNA prekursori qisqa kodlamaydigan RNK ishtirok etgan gen genlarni tartibga solish.miR-199 genlari hozirda taxmin qilingan yoki eksperimental tarzda tasdiqlangan sichqoncha, inson va boshqa 21 tur.[1][2][3][4] mikroRNKlar ~ 70 ga ko'chiriladi nukleotid prekursorlar va keyinchalik tomonidan qayta ishlangan Dicer ~ 22 nukleotid mahsulotini beradigan ferment. Voyaga etgan mahsulotlarni to'ldirish orqali tartibga soluvchi rollarga ega deb o'ylashadi mRNA.[5]

MiR-199 ning kelib chiqishi va evolyutsiyasi

miR-199 umurtqali nasl kelib chiqishi paytida paydo bo'lgan umurtqali hayvonlarga xos miR oilasi ekanligi ko'rsatilgan. [6] MiR-199 ning uchta paralogini odatda teleost bo'lmagan umurtqali hayvonlar turlarida va 4-5 nusxalarini teleost turlarida topish mumkin. Barcha miR-199 genlari ortologik intronning qarama-qarshi qismida joylashgan Dinamin genlar. Ichida Dinamin3 gen (Dnm3), miR-199 bilan bog'liq miR-214 va ikkala miR ham umumiy birlamchi transkript sifatida birlashtirilib, sichqoncha, odam va zebrafishlarda namoyish etiladi.[7]

MiR-199 ning maqsadlari va ifodasi

miR-199 turli xil uyali va rivojlanish mexanizmlarida, masalan, saratonning rivojlanishi va rivojlanishida, kardiomiositlarni himoya qilishda yoki skelet shakllanishida ishtirok etishi isbotlangan.[8]

Mikroarray va immunoblotalarni tahlil qilish yordamida miR-199a * ni maqsad qilib qo'yganligi ko'rsatildi Uchrashdi proto-onkogen.[9]

MicroRNA hsa-miR-199a - IκB kinaz-b (IKKβ) ekspressionining regulyatori.[10]

Foydalanish TaqMan real vaqtda PCR massivining miqdoriy usullari, miRNA ekspresiyasi profillangan. miR-199a, bu eng katta ta'sirlardan biri invaziv skuamöz hujayrali karsinomalar (ISCC), bachadon bo'yni saraton hujayralarini (SiHa va ME-180) anti-miR-199a oligonukleotidlar bilan transfektsiya qilish orqali baholandi va hujayraning hayotiyligi baholandi. MirR-199a *, mir199a va mirR-199b ISCClarda sezilarli darajada haddan tashqari ta'sir ko'rsatdi.[11]

MiR-199 ning skeletogenezdagi ta'siri

miR-199, uning klaster sherigi bilan birga MiR-214, skelet hosil bo'lishiga aloqador ekanligi isbotlangan. Sichqonlarda miR-199 perikondriyal hujayralar, periartikulyar xondrositlar, traxeya xaftasi, oyoq-qo'llarida ifodalanadi. mezenxima, va yuqori va pastki jagdagi to'qimalarning aksariyati.[7] Zebrafishlarda miR-199 rivojlanayotgan notoxord va skelet elementlari atrofidagi barcha to'qimalarda ifodalanadi.[6] Qiyosiy miRNA massivi bir nechtasini ajratib olishga olib keldi Suyak morfogen oqsil 2 (BMP2) javob beruvchi miRNAlar. Ular orasida miR-199a * alohida qiziqish uyg'otadi, chunki u suyak tizimida aniq ifoda etilganligi va xondrogenezni inhibe qilganligi ko'rsatilgan. Smad1-ning pastki regulyatsiyasi, suyak va xaftaga tushish va rivojlanishning asosiy regulyatori.[12] Shuningdek, Twist-1 skelet shakllanishining asosiy aktyori bo'lgan sichqonchada miR-199 va miR-214 klaster ifodasini tartibga soladi.[13] Bundan tashqari, sichqonchani miR199-214 klasterini yo'q qilish skelet rivojlanishining anormalliklariga, shu jumladan kraniofasiyal nuqsonlarga, asab kamari va o'murtqa jarayonlarning malformatsiyalari va osteopeniyaga olib keladi.[14]

MiR-199 ning klinik ahamiyati

Alkogolli jigar kasalligi surunkali spirtli ichimliklarni suiiste'mol qilishning keng tarqalgan tibbiy oqibati. Gipoksiya bilan induktsiya qilinadigan omil-1a (HIF-1a) ning faollashuvi ko'rsatkichidir gipoksiya. Endotelin-1 (ET-1) qon tomirlarini toraytiradigan va qon bosimini ko'taradigan oqsildir. Etanol bilan bog'liq miR-199 pastga regulyatsiyasi kuchaygan HIF-1a va ET-1 ekspresyoniga hissa qo'shishi mumkinligi ko'rsatilgan.[15]

Adabiyotlar

  1. ^ Lagos-Kintana M, Rauhut R, Meyer J, Borxardt A, Tushl T (fevral 2003). "Sichqoncha va odamdan yangi mikroRNKlar". RNK. 9 (2): 175–9. doi:10.1261 / rna.2146903. PMC  1370382. PMID  12554859.
  2. ^ Houbaviy HB, Murray MF, Sharp PA (Avgust 2003). "Embrion ildiz hujayralariga xos MicroRNAlar". Rivojlanish hujayrasi. 5 (2): 351–8. doi:10.1016 / S1534-5807 (03) 00227-2. PMID  12919684.
  3. ^ Dostie J, Mourelatos Z, Yang M, Sharma A, Dreyfuss G (2003 yil fevral). "Yangi mikroRNKlarni o'z ichiga olgan neyron hujayralaridagi ko'plab mikroRNPlar". RNK. 9 (2): 180–6. doi:10.1261 / rna.2141503. PMC  1370383. PMID  12554860.
  4. ^ MIPF0000040
  5. ^ Ambros V (2001 yil dekabr). "microRNAs: katta potentsialga ega bo'lgan kichik regulyatorlar". Hujayra. 107 (7): 823–6. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00616-X. PMID  11779458.
  6. ^ a b Desvignes, T; Postletxayt JH. 2013. miR199-214 klasterining rivojlanishi va umurtqali hayvonlar skeletining rivojlanishi. RNK Biologiyasiga topshirilgan.[tekshirish kerak ]
  7. ^ a b Loebel DA, Tsoy B, Vong N, Tam PP (iyun 2005). "Dnm3 sichqonchasi joyida saqlanadigan kodlanmagan intronik transkript". Genomika. 85 (6): 782–9. doi:10.1016 / j.ygeno.2005.02.001. PMID  15885504.
  8. ^ Gu S, Chan VY (2012). "Moslashuvchan va ko'p qirrali microRNA-199a-ning xameleon kabi murakkab vazifalari". Xalqaro molekulyar fanlar jurnali. 13 (7): 8449–66. doi:10.3390 / ijms13078449. PMC  3430244. PMID  22942713.
  9. ^ Kim S, Li UJ, Kim MN, Li EJ, Kim JY, Li MY, Choung S, Kim YJ, Choi YC (iyun 2008). "MicroRNA miR-199a * MET proto-onkogen va quyi oqim hujayradan tashqari signal bilan boshqariladigan kinaz 2 (ERK2) ni tartibga soladi". Biologik kimyo jurnali. 283 (26): 18158–66. doi:10.1074 / jbc.M800186200. PMID  18456660.
  10. ^ Chen R, Alvero AB, Silasi DA, Kelly MG, Fest S, Visintin I, Leiser A, Shvarts PE, Rezerford T, Mor G (2008 yil avgust). "IKKbeta miR-199a tomonidan tartibga solinishi tuxumdon saraton hujayralarida NF-kappaB faolligiga ta'sir qiladi". Onkogen. 27 (34): 4712–23. doi:10.1038 / onc.2008.112. PMC  3041589. PMID  18408758.
  11. ^ Li JW, Choi CH, Choi JJ, Park YA, Kim SJ, Xvan SY, Kim VY, Kim TJ, Li JH, Kim BG, Bae DS (may 2008). "Serviks karsinomalarida o'zgargan MicroRNA ekspressioni". Klinik saraton tadqiqotlari. 14 (9): 2535–42. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-07-1231. PMID  18451214.
  12. ^ Lin EA, Kong L, Bai XH, Luan Y, Liu CJ (2009 yil aprel). "miR-199a, suyak morfogen oqsili 2 ta sezgir MicroRNA, xondrogenezni to'g'ridan-to'g'ri Smad1 ga yo'naltirish orqali boshqaradi". Biologik kimyo jurnali. 284 (17): 11326–35. doi:10.1074 / jbc.M807709200. PMC  2670138. PMID  19251704.
  13. ^ Lee YB, Bantounas I, Li DY, Phylactou L, Caldwell MA, Uney JB (yanvar 2009). "Twist-1 rivojlanish jarayonida miR-199a / 214 klasterini tartibga soladi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 37 (1): 123–8. doi:10.1093 / nar / gkn920. PMC  2615617. PMID  19029138.
  14. ^ Burkardt DD, Rozenfeld JA, Helgeson ML, Angle B, Banklar V, Smit BIZ, Gripp KW, Moline J, Moran RT, Niyazov DM, Stivens CA, Zackai E, Lebel RR, Ashley DG, Kramer N, Lachman RS, Graham JM (Iyun 2011). "1q24-q25 xromosomasi yo'q qilingan 9 nafar bemorda o'ziga xos fenotip". Amerika tibbiyot genetikasi jurnali. A qism. 155A (6): 1336–51. doi:10.1002 / ajmg.a.34049. PMC  3109510. PMID  21548129.
  15. ^ Yeligar S, Tsukamoto H, Kalra VK (oktyabr 2009). "Jigar sinusoidal endoteliya hujayralari va inson endotelial hujayralarida ET-1 va ET-BR ning etanol ta'sirida ekspressioni gipoksiyaga ta'sir qiluvchi omil-1alfa va mikrorNA-199ni o'z ichiga oladi". Immunologiya jurnali. 183 (8): 5232–43. doi:10.4049 / jimmunol.0901084. PMC  3622549. PMID  19783678.

Qo'shimcha o'qish

Tashqi havolalar